Protein–RNA interactions for Protein: Q12158

MCD1, Sister chromatid cohesion protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
MCD1Q12158 ATP17YDR377W 306 nt3.93□□□□□ -1.78
MCD1Q12158 YER097WYER097W 330 nt3.93□□□□□ -1.78
MCD1Q12158 ARK1YNL020C 1917 nt3.92□□□□□ -1.78
MCD1Q12158 SGN1YIR001C 753 nt3.92□□□□□ -1.78
MCD1Q12158 PET191YJR034W 327 nt3.92□□□□□ -1.78
MCD1Q12158 RPS7BYNL096C 573 nt3.92□□□□□ -1.78
MCD1Q12158 HEM4YOR278W 828 nt3.92□□□□□ -1.78
MCD1Q12158 DPB11YJL090C 2295 nt3.92□□□□□ -1.78
MCD1Q12158 SYT1YPR095C 3681 nt3.92□□□□□ -1.78
MCD1Q12158 YKL100CYKL100C 1764 nt3.91□□□□□ -1.78
MCD1Q12158 ERG28YER044C 447 nt3.91□□□□□ -1.78
MCD1Q12158 NOP19YGR251W 591 nt3.91□□□□□ -1.78
MCD1Q12158 RPS21BYJL136C 264 nt3.91□□□□□ -1.78
MCD1Q12158 YJR023CYJR023C 402 nt3.91□□□□□ -1.78
MCD1Q12158 RPL37AYLR185W 267 nt3.91□□□□□ -1.78
MCD1Q12158 ASC1YMR116C 960 nt3.91□□□□□ -1.78
MCD1Q12158 ECM16YMR128W 3804 nt3.91□□□□□ -1.78
MCD1Q12158 YNL043CYNL043C 321 nt3.91□□□□□ -1.78
MCD1Q12158 ZDS2YML109W 2829 nt3.91□□□□□ -1.78
MCD1Q12158 YDL180WYDL180W 1644 nt3.91□□□□□ -1.78
MCD1Q12158 GYL1YMR192W 2163 nt3.9□□□□□ -1.78
MCD1Q12158 MDM32YOR147W 1869 nt3.9□□□□□ -1.78
MCD1Q12158 HFM1YGL251C 3564 nt3.9□□□□□ -1.78
MCD1Q12158 snR65snR65 100 nt3.9□□□□□ -1.79
MCD1Q12158 YKL162C-AYKL162C-A 153 nt3.9□□□□□ -1.79
MCD1Q12158 YPL276WYPL276W 438 nt3.9□□□□□ -1.79
MCD1Q12158 STN1YDR082W 1485 nt3.9□□□□□ -1.79
MCD1Q12158 ATG2YNL242W 4779 nt3.9□□□□□ -1.79
MCD1Q12158 FAS1YKL182W 6156 nt3.9□□□□□ -1.79
MCD1Q12158 SPC72YAL047C 1869 nt3.9□□□□□ -1.79
MCD1Q12158 KIN4YOR233W 2403 nt3.9□□□□□ -1.79
MCD1Q12158 TMA108YIL137C 2841 nt3.89□□□□□ -1.79
MCD1Q12158 SWT1YOR166C 1377 nt3.89□□□□□ -1.79
MCD1Q12158 IRC4YDR540C 540 nt3.89□□□□□ -1.79
MCD1Q12158 RPC10YHR143W-A 213 nt3.89□□□□□ -1.79
MCD1Q12158 ATP3YBR039W 936 nt3.89□□□□□ -1.79
MCD1Q12158 RPS23BYPR132W 438 nt3.89□□□□□ -1.79
MCD1Q12158 PHO81YGR233C 3537 nt3.89□□□□□ -1.79
MCD1Q12158 PTA1YAL043C 2358 nt3.89□□□□□ -1.79
MCD1Q12158 NUP60YAR002W 1620 nt3.88□□□□□ -1.79
MCD1Q12158 PWP2YCR057C 2772 nt3.88□□□□□ -1.79
MCD1Q12158 XRN1YGL173C 4587 nt3.88□□□□□ -1.79
MCD1Q12158 SNF12YNR023W 1701 nt3.88□□□□□ -1.79
MCD1Q12158 YCG1YDR325W 3108 nt3.88□□□□□ -1.79
MCD1Q12158 YER076W-AYER076W-A 348 nt3.88□□□□□ -1.79
MCD1Q12158 YGR107WYGR107W 450 nt3.88□□□□□ -1.79
MCD1Q12158 YHR032C-AYHR032C-A 120 nt3.88□□□□□ -1.79
MCD1Q12158 YIR040CYIR040C 333 nt3.88□□□□□ -1.79
MCD1Q12158 JIP3YLR331C 378 nt3.88□□□□□ -1.79
MCD1Q12158 ATP22YDR350C 2055 nt3.88□□□□□ -1.79
MCD1Q12158 GCD10YNL062C 1437 nt3.87□□□□□ -1.79
MCD1Q12158 VHR2YER064C 1518 nt3.87□□□□□ -1.79
MCD1Q12158 TIF35YDR429C 825 nt3.87□□□□□ -1.79
MCD1Q12158 YJR140W-AYJR140W-A 150 nt3.87□□□□□ -1.79
MCD1Q12158 YBL108WYBL108W 306 nt3.87□□□□□ -1.79
MCD1Q12158 RPO31YOR116C 4383 nt3.86□□□□□ -1.79
MCD1Q12158 GPI8YDR331W 1236 nt3.86□□□□□ -1.79
MCD1Q12158 YKL111CYKL111C 336 nt3.86□□□□□ -1.79
MCD1Q12158 RFC3YNL290W 1023 nt3.86□□□□□ -1.79
MCD1Q12158 PEX11YOL147C 711 nt3.86□□□□□ -1.79
MCD1Q12158 FSH3YOR280C 801 nt3.86□□□□□ -1.79
MCD1Q12158 CWC22YGR278W 1734 nt3.86□□□□□ -1.79
MCD1Q12158 TRZ1YKR079C 2517 nt3.86□□□□□ -1.79
MCD1Q12158 NDT80YHR124W 1884 nt3.86□□□□□ -1.79
MCD1Q12158 YGL140CYGL140C 3660 nt3.85□□□□□ -1.79
MCD1Q12158 CHS3YBR023C 3498 nt3.85□□□□□ -1.79
MCD1Q12158 HSP30YCR021C 999 nt3.85□□□□□ -1.79
MCD1Q12158 YER066C-AYER066C-A 501 nt3.85□□□□□ -1.79
MCD1Q12158 YER188C-AYER188C-A 300 nt3.85□□□□□ -1.79
MCD1Q12158 LSM8YJR022W 330 nt3.85□□□□□ -1.79
MCD1Q12158 ISU1YPL135W 498 nt3.85□□□□□ -1.79
MCD1Q12158 SRP72YPL210C 1923 nt3.85□□□□□ -1.79
MCD1Q12158 MYO3YKL129C 3819 nt3.85□□□□□ -1.79
MCD1Q12158 BNI4YNL233W 2679 nt3.85□□□□□ -1.79
MCD1Q12158 SEC15YGL233W 2733 nt3.84□□□□□ -1.79
MCD1Q12158 MRH1YDR033W 963 nt3.84□□□□□ -1.79
MCD1Q12158 YDR102CYDR102C 333 nt3.84□□□□□ -1.79
MCD1Q12158 LSM1YJL124C 519 nt3.84□□□□□ -1.79
MCD1Q12158 ROD1YOR018W 2514 nt3.84□□□□□ -1.8
MCD1Q12158 YSW1YBR148W 1830 nt3.84□□□□□ -1.8
MCD1Q12158 ELM1YKL048C 1923 nt3.83□□□□□ -1.8
MCD1Q12158 VBA4YDR119W 2307 nt3.83□□□□□ -1.8
MCD1Q12158 HMRA2YCR096C 360 nt3.83□□□□□ -1.8
MCD1Q12158 TIR2YOR010C 756 nt3.83□□□□□ -1.8
MCD1Q12158 TIM18YOR297C 579 nt3.83□□□□□ -1.8
MCD1Q12158 BIL1YOR304C-A 231 nt3.83□□□□□ -1.8
MCD1Q12158 OST1YJL002C 1431 nt3.83□□□□□ -1.8
MCD1Q12158 MNT3YIL014W 1893 nt3.83□□□□□ -1.8
MCD1Q12158 KAP95YLR347C 2586 nt3.82□□□□□ -1.8
MCD1Q12158 ABP140YOR239W 1887 nt3.82□□□□□ -1.8
MCD1Q12158 snR8snR8 190 nt3.82□□□□□ -1.8
MCD1Q12158 TSA2YDR453C 591 nt3.82□□□□□ -1.8
MCD1Q12158 YER107W-AYER107W-A 321 nt3.82□□□□□ -1.8
MCD1Q12158 YAR029WYAR029W 225 nt3.82□□□□□ -1.8
MCD1Q12158 RPL19BYBL027W 570 nt3.82□□□□□ -1.8
MCD1Q12158 YPL238CYPL238C 390 nt3.82□□□□□ -1.8
MCD1Q12158 ROX1YPR065W 1107 nt3.82□□□□□ -1.8
MCD1Q12158 COP1YDL145C 3606 nt3.82□□□□□ -1.8
MCD1Q12158 SNX41YDR425W 1878 nt3.81□□□□□ -1.8
MCD1Q12158 REC104YHR157W 549 nt3.81□□□□□ -1.8
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 59 ms