Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4X4

KLF12, Krueppel-like factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF12Q9Y4X4 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLF12Q9Y4X4 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLF12Q9Y4X4 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
KLF12Q9Y4X4 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLF12Q9Y4X4 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
KLF12Q9Y4X4 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLF12Q9Y4X4 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLF12Q9Y4X4 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLF12Q9Y4X4 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
KLF12Q9Y4X4 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLF12Q9Y4X4 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLF12Q9Y4X4 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLF12Q9Y4X4 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLF12Q9Y4X4 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLF12Q9Y4X4 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLF12Q9Y4X4 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLF12Q9Y4X4 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLF12Q9Y4X4 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
KLF12Q9Y4X4 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
KLF12Q9Y4X4 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
KLF12Q9Y4X4 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
KLF12Q9Y4X4 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLF12Q9Y4X4 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLF12Q9Y4X4 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLF12Q9Y4X4 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLF12Q9Y4X4 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLF12Q9Y4X4 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLF12Q9Y4X4 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLF12Q9Y4X4 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLF12Q9Y4X4 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLF12Q9Y4X4 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLF12Q9Y4X4 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLF12Q9Y4X4 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLF12Q9Y4X4 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
KLF12Q9Y4X4 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLF12Q9Y4X4 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLF12Q9Y4X4 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLF12Q9Y4X4 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLF12Q9Y4X4 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLF12Q9Y4X4 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLF12Q9Y4X4 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
KLF12Q9Y4X4 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KLF12Q9Y4X4 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KLF12Q9Y4X4 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KLF12Q9Y4X4 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KLF12Q9Y4X4 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KLF12Q9Y4X4 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
KLF12Q9Y4X4 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KLF12Q9Y4X4 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KLF12Q9Y4X4 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KLF12Q9Y4X4 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KLF12Q9Y4X4 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KLF12Q9Y4X4 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KLF12Q9Y4X4 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KLF12Q9Y4X4 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KLF12Q9Y4X4 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KLF12Q9Y4X4 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
KLF12Q9Y4X4 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KLF12Q9Y4X4 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KLF12Q9Y4X4 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLF12Q9Y4X4 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLF12Q9Y4X4 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLF12Q9Y4X4 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLF12Q9Y4X4 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLF12Q9Y4X4 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLF12Q9Y4X4 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLF12Q9Y4X4 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLF12Q9Y4X4 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLF12Q9Y4X4 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLF12Q9Y4X4 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLF12Q9Y4X4 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLF12Q9Y4X4 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
KLF12Q9Y4X4 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLF12Q9Y4X4 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLF12Q9Y4X4 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLF12Q9Y4X4 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLF12Q9Y4X4 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLF12Q9Y4X4 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLF12Q9Y4X4 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLF12Q9Y4X4 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLF12Q9Y4X4 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLF12Q9Y4X4 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLF12Q9Y4X4 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLF12Q9Y4X4 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLF12Q9Y4X4 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLF12Q9Y4X4 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLF12Q9Y4X4 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLF12Q9Y4X4 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLF12Q9Y4X4 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLF12Q9Y4X4 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLF12Q9Y4X4 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLF12Q9Y4X4 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLF12Q9Y4X4 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLF12Q9Y4X4 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLF12Q9Y4X4 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLF12Q9Y4X4 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLF12Q9Y4X4 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLF12Q9Y4X4 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLF12Q9Y4X4 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLF12Q9Y4X4 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97 ms