Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFU0

BEST4, Bestrophin-4, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST4Q8NFU0 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BEST4Q8NFU0 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BEST4Q8NFU0 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BEST4Q8NFU0 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BEST4Q8NFU0 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BEST4Q8NFU0 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BEST4Q8NFU0 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BEST4Q8NFU0 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BEST4Q8NFU0 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BEST4Q8NFU0 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BEST4Q8NFU0 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BEST4Q8NFU0 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
BEST4Q8NFU0 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BEST4Q8NFU0 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BEST4Q8NFU0 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
BEST4Q8NFU0 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BEST4Q8NFU0 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BEST4Q8NFU0 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BEST4Q8NFU0 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BEST4Q8NFU0 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BEST4Q8NFU0 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BEST4Q8NFU0 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BEST4Q8NFU0 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BEST4Q8NFU0 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BEST4Q8NFU0 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BEST4Q8NFU0 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BEST4Q8NFU0 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
BEST4Q8NFU0 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BEST4Q8NFU0 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BEST4Q8NFU0 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BEST4Q8NFU0 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BEST4Q8NFU0 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BEST4Q8NFU0 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
BEST4Q8NFU0 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BEST4Q8NFU0 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BEST4Q8NFU0 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BEST4Q8NFU0 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BEST4Q8NFU0 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BEST4Q8NFU0 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BEST4Q8NFU0 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BEST4Q8NFU0 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BEST4Q8NFU0 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
BEST4Q8NFU0 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BEST4Q8NFU0 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BEST4Q8NFU0 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BEST4Q8NFU0 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BEST4Q8NFU0 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BEST4Q8NFU0 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BEST4Q8NFU0 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BEST4Q8NFU0 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BEST4Q8NFU0 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BEST4Q8NFU0 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BEST4Q8NFU0 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BEST4Q8NFU0 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BEST4Q8NFU0 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BEST4Q8NFU0 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BEST4Q8NFU0 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BEST4Q8NFU0 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BEST4Q8NFU0 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BEST4Q8NFU0 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BEST4Q8NFU0 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BEST4Q8NFU0 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BEST4Q8NFU0 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BEST4Q8NFU0 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BEST4Q8NFU0 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BEST4Q8NFU0 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BEST4Q8NFU0 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BEST4Q8NFU0 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BEST4Q8NFU0 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BEST4Q8NFU0 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BEST4Q8NFU0 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BEST4Q8NFU0 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BEST4Q8NFU0 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BEST4Q8NFU0 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BEST4Q8NFU0 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BEST4Q8NFU0 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BEST4Q8NFU0 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BEST4Q8NFU0 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BEST4Q8NFU0 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BEST4Q8NFU0 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BEST4Q8NFU0 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BEST4Q8NFU0 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BEST4Q8NFU0 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BEST4Q8NFU0 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
BEST4Q8NFU0 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
BEST4Q8NFU0 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
BEST4Q8NFU0 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
BEST4Q8NFU0 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
BEST4Q8NFU0 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
BEST4Q8NFU0 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.43
BEST4Q8NFU0 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
BEST4Q8NFU0 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BEST4Q8NFU0 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BEST4Q8NFU0 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BEST4Q8NFU0 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BEST4Q8NFU0 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BEST4Q8NFU0 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BEST4Q8NFU0 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BEST4Q8NFU0 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BEST4Q8NFU0 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms