RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000329565.5

SNN-201, Transcript of stannin, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SNN, Length 3,312 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNN-201ENST00000329565 NISCHQ9Y2I1 1504 aa35.69■■■■□ 3.3
SNN-201ENST00000329565 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa31.93■■■□□ 2.7
SNN-201ENST00000329565 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP31.65■■■□□ 2.66
SNN-201ENST00000329565 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP31.22■■■□□ 2.59
SNN-201ENST00000329565 HRCP23327 699 aa31.21■■■□□ 2.59
SNN-201ENST00000329565 PCGF6Q9BYE7 350 aa31.08■■■□□ 2.57
SNN-201ENST00000329565 MYO15BQ96JP2 1530 aa30.73■■■□□ 2.51
SNN-201ENST00000329565 CHIC1Q5VXU3 224 aa30.67■■■□□ 2.5
SNN-201ENST00000329565 DCAF8L2P0C7V8 631 aa30.59■■■□□ 2.49
SNN-201ENST00000329565 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP30.23■■■□□ 2.43
SNN-201ENST00000329565 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa30.19■■■□□ 2.42
SNN-201ENST00000329565 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP29.88■■■□□ 2.37
SNN-201ENST00000329565 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP29.82■■■□□ 2.36
SNN-201ENST00000329565 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa29.66■■■□□ 2.34
SNN-201ENST00000329565 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP29.64■■■□□ 2.34
SNN-201ENST00000329565 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa29.57■■■□□ 2.32
SNN-201ENST00000329565 EHMT2Q96KQ7 1210 aa29.5■■■□□ 2.31
SNN-201ENST00000329565 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP29.38■■■□□ 2.29
SNN-201ENST00000329565 TRIM41Q8WV44 630 aa29.13■■■□□ 2.25
SNN-201ENST00000329565 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP29.1■■■□□ 2.25
SNN-201ENST00000329565 NEUROD1Q13562 356 aa29.05■■■□□ 2.24
SNN-201ENST00000329565 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa28.97■■■□□ 2.23
SNN-201ENST00000329565 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP28.9■■■□□ 2.22
SNN-201ENST00000329565 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP28.79■■■□□ 2.2
SNN-201ENST00000329565 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP28.7■■■□□ 2.18
SNN-201ENST00000329565 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP28.7■■■□□ 2.18
SNN-201ENST00000329565 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP28.66■■■□□ 2.18
SNN-201ENST00000329565 ABCC9O60706 1549 aa28.63■■■□□ 2.17
SNN-201ENST00000329565 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP28.63■■■□□ 2.17
SNN-201ENST00000329565 SCRIBQ14160 1630 aa28.57■■■□□ 2.16
SNN-201ENST00000329565 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa28.57■■■□□ 2.16
SNN-201ENST00000329565 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP28.54■■■□□ 2.16
SNN-201ENST00000329565 MYT1Q01538 1121 aa28.54■■■□□ 2.16
SNN-201ENST00000329565 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP28.53■■■□□ 2.16
SNN-201ENST00000329565 CECR2Q9BXF3 1484 aa28.15■■■□□ 2.1
SNN-201ENST00000329565 MROH2BQ7Z745 1585 aa27.99■■■□□ 2.07
SNN-201ENST00000329565 WIZO95785 1651 aa27.89■■■□□ 2.06
SNN-201ENST00000329565 MIER1Q8N108 512 aa27.86■■■□□ 2.05
SNN-201ENST00000329565 UBTFP17480 764 aaKnown RBP27.8■■■□□ 2.04
SNN-201ENST00000329565 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP27.79■■■□□ 2.04
SNN-201ENST00000329565 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP27.73■■■□□ 2.03
SNN-201ENST00000329565 ABCC8Q09428 1581 aa27.71■■■□□ 2.03
SNN-201ENST00000329565 CEP162Q5TB80 1403 aa27.7■■■□□ 2.03
SNN-201ENST00000329565 CCDC88BA6NC98 1476 aa27.68■■■□□ 2.02
SNN-201ENST00000329565 SOGA1O94964 1423 aa27.62■■■□□ 2.01
SNN-201ENST00000329565 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP27.55■■■□□ 2
SNN-201ENST00000329565 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP27.51■■□□□ 1.99
SNN-201ENST00000329565 CSRNP3Q8WYN3 585 aa27.5■■□□□ 1.99
SNN-201ENST00000329565 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa27.49■■□□□ 1.99
SNN-201ENST00000329565 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP27.45■■□□□ 1.98
SNN-201ENST00000329565 BCL11AQ9H165 835 aa27.43■■□□□ 1.98
SNN-201ENST00000329565 TNIKQ9UKE5 1360 aa27.43■■□□□ 1.98
SNN-201ENST00000329565 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP27.4■■□□□ 1.98
SNN-201ENST00000329565 BCANQ96GW7 911 aa27.37■■□□□ 1.97
SNN-201ENST00000329565 NACADO15069 1562 aa27.37■■□□□ 1.97
SNN-201ENST00000329565 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP27.32■■□□□ 1.96
SNN-201ENST00000329565 ANP32EQ9BTT0 268 aa27.25■■□□□ 1.95
SNN-201ENST00000329565 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa27.23■■□□□ 1.95
SNN-201ENST00000329565 APLP2Q06481 763 aa27.23■■□□□ 1.95
SNN-201ENST00000329565 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP27.16■■□□□ 1.94
SNN-201ENST00000329565 GOLGA3Q08378 1498 aa27.15■■□□□ 1.94
SNN-201ENST00000329565 SMARCA2P51531 1590 aa27.15■■□□□ 1.94
SNN-201ENST00000329565 CLIP1P30622 1438 aa27.06■■□□□ 1.92
SNN-201ENST00000329565 EEA1Q15075 1411 aa27.05■■□□□ 1.92
SNN-201ENST00000329565 SMARCA4P51532 1647 aa27.01■■□□□ 1.91
SNN-201ENST00000329565 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP27■■□□□ 1.91
SNN-201ENST00000329565 KCNH8Q96L42 1107 aa26.96■■□□□ 1.91
SNN-201ENST00000329565 CEP164Q9UPV0 1460 aa26.89■■□□□ 1.89
SNN-201ENST00000329565 ITGAEP38570 1179 aa26.88■■□□□ 1.89
SNN-201ENST00000329565 VPS8Q8N3P4 1428 aa26.88■■□□□ 1.89
SNN-201ENST00000329565 FKBP8Q14318 412 aa26.85■■□□□ 1.89
SNN-201ENST00000329565 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa26.82■■□□□ 1.88
SNN-201ENST00000329565 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP26.77■■□□□ 1.88
SNN-201ENST00000329565 SYNJ1O43426 1573 aa26.76■■□□□ 1.87
SNN-201ENST00000329565 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP26.76■■□□□ 1.87
SNN-201ENST00000329565 KIF21BO75037 1637 aa26.65■■□□□ 1.86
SNN-201ENST00000329565 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP26.64■■□□□ 1.85
SNN-201ENST00000329565 TRIM52Q96A61 297 aa26.56■■□□□ 1.84
SNN-201ENST00000329565 UNC13AQ9UPW8 1703 aa26.55■■□□□ 1.84
SNN-201ENST00000329565 CLSPNQ9HAW4 1339 aa26.55■■□□□ 1.84
SNN-201ENST00000329565 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP26.51■■□□□ 1.83
SNN-201ENST00000329565 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP26.5■■□□□ 1.83
SNN-201ENST00000329565 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP26.5■■□□□ 1.83
SNN-201ENST00000329565 NEFLP07196 543 aa26.5■■□□□ 1.83
SNN-201ENST00000329565 ERICH6Q7L0X2 663 aa26.45■■□□□ 1.82
SNN-201ENST00000329565 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP26.45■■□□□ 1.82
SNN-201ENST00000329565 MSH5O43196 834 aa26.41■■□□□ 1.82
SNN-201ENST00000329565 ARAP1Q96P48 1450 aa26.39■■□□□ 1.82
SNN-201ENST00000329565 SIN3AQ96ST3 1273 aa26.37■■□□□ 1.81
SNN-201ENST00000329565 CCNB3Q8WWL7 1395 aa26.34■■□□□ 1.81
SNN-201ENST00000329565 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa26.29■■□□□ 1.8
SNN-201ENST00000329565 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP26.27■■□□□ 1.8
SNN-201ENST00000329565 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP26.27■■□□□ 1.8
SNN-201ENST00000329565 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa26.26■■□□□ 1.79
SNN-201ENST00000329565 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP26.25■■□□□ 1.79
SNN-201ENST00000329565 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP26.24■■□□□ 1.79
SNN-201ENST00000329565 BICRAQ9NZM4 1560 aa26.22■■□□□ 1.79
SNN-201ENST00000329565 PRXQ9BXM0 1461 aa26.19■■□□□ 1.78
SNN-201ENST00000329565 TOP2BQ02880 1626 aa26.16■■□□□ 1.78
SNN-201ENST00000329565 P3H3Q8IVL6 736 aa26.15■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.4 ms