Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.91
CDKN3Q16667 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CDKN3Q16667 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CDKN3Q16667 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CDKN3Q16667 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CDKN3Q16667 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CDKN3Q16667 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CDKN3Q16667 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CDKN3Q16667 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CDKN3Q16667 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
CDKN3Q16667 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CDKN3Q16667 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CDKN3Q16667 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CDKN3Q16667 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CDKN3Q16667 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CDKN3Q16667 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CDKN3Q16667 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CDKN3Q16667 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CDKN3Q16667 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CDKN3Q16667 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
CDKN3Q16667 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CDKN3Q16667 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CDKN3Q16667 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CDKN3Q16667 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CDKN3Q16667 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CDKN3Q16667 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CDKN3Q16667 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CDKN3Q16667 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CDKN3Q16667 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CDKN3Q16667 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CDKN3Q16667 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CDKN3Q16667 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CDKN3Q16667 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CDKN3Q16667 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CDKN3Q16667 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CDKN3Q16667 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CDKN3Q16667 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CDKN3Q16667 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CDKN3Q16667 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
CDKN3Q16667 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CDKN3Q16667 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CDKN3Q16667 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CDKN3Q16667 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
CDKN3Q16667 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CDKN3Q16667 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CDKN3Q16667 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CDKN3Q16667 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
CDKN3Q16667 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CDKN3Q16667 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CDKN3Q16667 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CDKN3Q16667 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CDKN3Q16667 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CDKN3Q16667 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CDKN3Q16667 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CDKN3Q16667 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CDKN3Q16667 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CDKN3Q16667 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CDKN3Q16667 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CDKN3Q16667 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CDKN3Q16667 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CDKN3Q16667 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
CDKN3Q16667 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CDKN3Q16667 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CDKN3Q16667 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
CDKN3Q16667 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CDKN3Q16667 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CDKN3Q16667 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CDKN3Q16667 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CDKN3Q16667 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CDKN3Q16667 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CDKN3Q16667 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
CDKN3Q16667 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CDKN3Q16667 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CDKN3Q16667 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CDKN3Q16667 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CDKN3Q16667 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CDKN3Q16667 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CDKN3Q16667 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
CDKN3Q16667 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CDKN3Q16667 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CDKN3Q16667 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
CDKN3Q16667 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CDKN3Q16667 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CDKN3Q16667 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CDKN3Q16667 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CDKN3Q16667 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CDKN3Q16667 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CDKN3Q16667 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CDKN3Q16667 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CDKN3Q16667 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CDKN3Q16667 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CDKN3Q16667 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CDKN3Q16667 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CDKN3Q16667 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CDKN3Q16667 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CDKN3Q16667 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CDKN3Q16667 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CDKN3Q16667 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CDKN3Q16667 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CDKN3Q16667 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.9 ms