Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SS18Q15532 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SS18Q15532 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SS18Q15532 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SS18Q15532 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SS18Q15532 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SS18Q15532 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SS18Q15532 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
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SS18Q15532 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
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SS18Q15532 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SS18Q15532 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SS18Q15532 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
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SS18Q15532 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
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SS18Q15532 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SS18Q15532 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SS18Q15532 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SS18Q15532 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SS18Q15532 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SS18Q15532 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SS18Q15532 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SS18Q15532 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SS18Q15532 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SS18Q15532 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SS18Q15532 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SS18Q15532 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SS18Q15532 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SS18Q15532 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SS18Q15532 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SS18Q15532 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SS18Q15532 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SS18Q15532 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SS18Q15532 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
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SS18Q15532 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
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SS18Q15532 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
SS18Q15532 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
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SS18Q15532 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SS18Q15532 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SS18Q15532 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SS18Q15532 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SS18Q15532 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SS18Q15532 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SS18Q15532 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SS18Q15532 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SS18Q15532 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
SS18Q15532 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SS18Q15532 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SS18Q15532 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
SS18Q15532 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
SS18Q15532 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SS18Q15532 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
SS18Q15532 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SS18Q15532 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.2□□□□□ -0.14
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