Protein–RNA interactions for Protein: Q13425

SNTB2, Beta-2-syntrophin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTB2Q13425 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNTB2Q13425 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNTB2Q13425 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNTB2Q13425 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNTB2Q13425 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNTB2Q13425 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNTB2Q13425 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNTB2Q13425 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNTB2Q13425 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNTB2Q13425 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNTB2Q13425 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNTB2Q13425 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNTB2Q13425 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNTB2Q13425 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNTB2Q13425 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNTB2Q13425 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNTB2Q13425 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNTB2Q13425 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNTB2Q13425 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNTB2Q13425 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNTB2Q13425 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SNTB2Q13425 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNTB2Q13425 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SNTB2Q13425 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNTB2Q13425 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNTB2Q13425 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNTB2Q13425 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNTB2Q13425 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNTB2Q13425 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNTB2Q13425 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNTB2Q13425 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNTB2Q13425 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNTB2Q13425 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNTB2Q13425 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNTB2Q13425 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNTB2Q13425 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNTB2Q13425 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNTB2Q13425 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNTB2Q13425 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNTB2Q13425 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNTB2Q13425 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNTB2Q13425 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SNTB2Q13425 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNTB2Q13425 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNTB2Q13425 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNTB2Q13425 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNTB2Q13425 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNTB2Q13425 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNTB2Q13425 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNTB2Q13425 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SNTB2Q13425 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNTB2Q13425 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNTB2Q13425 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNTB2Q13425 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNTB2Q13425 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNTB2Q13425 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNTB2Q13425 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNTB2Q13425 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNTB2Q13425 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNTB2Q13425 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNTB2Q13425 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SNTB2Q13425 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNTB2Q13425 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNTB2Q13425 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNTB2Q13425 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNTB2Q13425 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNTB2Q13425 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNTB2Q13425 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNTB2Q13425 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNTB2Q13425 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNTB2Q13425 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNTB2Q13425 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNTB2Q13425 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNTB2Q13425 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNTB2Q13425 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNTB2Q13425 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNTB2Q13425 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNTB2Q13425 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNTB2Q13425 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNTB2Q13425 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNTB2Q13425 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNTB2Q13425 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNTB2Q13425 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNTB2Q13425 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNTB2Q13425 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNTB2Q13425 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNTB2Q13425 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNTB2Q13425 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNTB2Q13425 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNTB2Q13425 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNTB2Q13425 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNTB2Q13425 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNTB2Q13425 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNTB2Q13425 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNTB2Q13425 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNTB2Q13425 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNTB2Q13425 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNTB2Q13425 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNTB2Q13425 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNTB2Q13425 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.2 ms