Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKI3

VPREB3, Pre-B lymphocyte protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB3Q9UKI3 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VPREB3Q9UKI3 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VPREB3Q9UKI3 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VPREB3Q9UKI3 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
VPREB3Q9UKI3 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VPREB3Q9UKI3 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VPREB3Q9UKI3 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VPREB3Q9UKI3 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VPREB3Q9UKI3 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VPREB3Q9UKI3 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
VPREB3Q9UKI3 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VPREB3Q9UKI3 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VPREB3Q9UKI3 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VPREB3Q9UKI3 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VPREB3Q9UKI3 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VPREB3Q9UKI3 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VPREB3Q9UKI3 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VPREB3Q9UKI3 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VPREB3Q9UKI3 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VPREB3Q9UKI3 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VPREB3Q9UKI3 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VPREB3Q9UKI3 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VPREB3Q9UKI3 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VPREB3Q9UKI3 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VPREB3Q9UKI3 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VPREB3Q9UKI3 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VPREB3Q9UKI3 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VPREB3Q9UKI3 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VPREB3Q9UKI3 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VPREB3Q9UKI3 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VPREB3Q9UKI3 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VPREB3Q9UKI3 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VPREB3Q9UKI3 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VPREB3Q9UKI3 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VPREB3Q9UKI3 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VPREB3Q9UKI3 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VPREB3Q9UKI3 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VPREB3Q9UKI3 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VPREB3Q9UKI3 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VPREB3Q9UKI3 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VPREB3Q9UKI3 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VPREB3Q9UKI3 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VPREB3Q9UKI3 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VPREB3Q9UKI3 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VPREB3Q9UKI3 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VPREB3Q9UKI3 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VPREB3Q9UKI3 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VPREB3Q9UKI3 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VPREB3Q9UKI3 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VPREB3Q9UKI3 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VPREB3Q9UKI3 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VPREB3Q9UKI3 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VPREB3Q9UKI3 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VPREB3Q9UKI3 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VPREB3Q9UKI3 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
VPREB3Q9UKI3 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VPREB3Q9UKI3 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VPREB3Q9UKI3 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VPREB3Q9UKI3 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VPREB3Q9UKI3 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VPREB3Q9UKI3 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VPREB3Q9UKI3 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VPREB3Q9UKI3 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VPREB3Q9UKI3 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VPREB3Q9UKI3 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VPREB3Q9UKI3 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VPREB3Q9UKI3 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VPREB3Q9UKI3 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VPREB3Q9UKI3 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VPREB3Q9UKI3 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VPREB3Q9UKI3 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VPREB3Q9UKI3 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VPREB3Q9UKI3 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VPREB3Q9UKI3 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VPREB3Q9UKI3 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VPREB3Q9UKI3 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VPREB3Q9UKI3 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
VPREB3Q9UKI3 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VPREB3Q9UKI3 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VPREB3Q9UKI3 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VPREB3Q9UKI3 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VPREB3Q9UKI3 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VPREB3Q9UKI3 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VPREB3Q9UKI3 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VPREB3Q9UKI3 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VPREB3Q9UKI3 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VPREB3Q9UKI3 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VPREB3Q9UKI3 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
VPREB3Q9UKI3 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VPREB3Q9UKI3 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VPREB3Q9UKI3 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VPREB3Q9UKI3 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VPREB3Q9UKI3 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VPREB3Q9UKI3 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VPREB3Q9UKI3 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VPREB3Q9UKI3 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VPREB3Q9UKI3 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VPREB3Q9UKI3 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VPREB3Q9UKI3 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VPREB3Q9UKI3 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms