Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX63

CHCHD3, MICOS complex subunit MIC19, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD3Q9NX63 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHCHD3Q9NX63 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHCHD3Q9NX63 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHCHD3Q9NX63 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHCHD3Q9NX63 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHCHD3Q9NX63 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHCHD3Q9NX63 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CHCHD3Q9NX63 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHCHD3Q9NX63 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHCHD3Q9NX63 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHCHD3Q9NX63 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHCHD3Q9NX63 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHCHD3Q9NX63 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHCHD3Q9NX63 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHCHD3Q9NX63 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHCHD3Q9NX63 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHCHD3Q9NX63 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHCHD3Q9NX63 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHCHD3Q9NX63 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHCHD3Q9NX63 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CHCHD3Q9NX63 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CHCHD3Q9NX63 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CHCHD3Q9NX63 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CHCHD3Q9NX63 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CHCHD3Q9NX63 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CHCHD3Q9NX63 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CHCHD3Q9NX63 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CHCHD3Q9NX63 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CHCHD3Q9NX63 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CHCHD3Q9NX63 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CHCHD3Q9NX63 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CHCHD3Q9NX63 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CHCHD3Q9NX63 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CHCHD3Q9NX63 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CHCHD3Q9NX63 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CHCHD3Q9NX63 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CHCHD3Q9NX63 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CHCHD3Q9NX63 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CHCHD3Q9NX63 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CHCHD3Q9NX63 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHCHD3Q9NX63 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHCHD3Q9NX63 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHCHD3Q9NX63 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHCHD3Q9NX63 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHCHD3Q9NX63 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHCHD3Q9NX63 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHCHD3Q9NX63 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHCHD3Q9NX63 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHCHD3Q9NX63 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHCHD3Q9NX63 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CHCHD3Q9NX63 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHCHD3Q9NX63 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHCHD3Q9NX63 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHCHD3Q9NX63 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHCHD3Q9NX63 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHCHD3Q9NX63 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHCHD3Q9NX63 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHCHD3Q9NX63 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHCHD3Q9NX63 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHCHD3Q9NX63 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHCHD3Q9NX63 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
CHCHD3Q9NX63 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CHCHD3Q9NX63 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CHCHD3Q9NX63 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHCHD3Q9NX63 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHCHD3Q9NX63 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHCHD3Q9NX63 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CHCHD3Q9NX63 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHCHD3Q9NX63 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHCHD3Q9NX63 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CHCHD3Q9NX63 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHCHD3Q9NX63 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHCHD3Q9NX63 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHCHD3Q9NX63 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHCHD3Q9NX63 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHCHD3Q9NX63 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHCHD3Q9NX63 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHCHD3Q9NX63 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHCHD3Q9NX63 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHCHD3Q9NX63 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHCHD3Q9NX63 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHCHD3Q9NX63 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHCHD3Q9NX63 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHCHD3Q9NX63 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CHCHD3Q9NX63 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHCHD3Q9NX63 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHCHD3Q9NX63 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHCHD3Q9NX63 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CHCHD3Q9NX63 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHCHD3Q9NX63 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHCHD3Q9NX63 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHCHD3Q9NX63 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHCHD3Q9NX63 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHCHD3Q9NX63 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHCHD3Q9NX63 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHCHD3Q9NX63 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHCHD3Q9NX63 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHCHD3Q9NX63 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHCHD3Q9NX63 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHCHD3Q9NX63 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms