Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
GRIN2AQ12879 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
GRIN2AQ12879 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.94■■■■□ 3.02
GRIN2AQ12879 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC33.94■■■■□ 3.02
GRIN2AQ12879 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
GRIN2AQ12879 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC33.93■■■■□ 3.02
GRIN2AQ12879 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
GRIN2AQ12879 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
GRIN2AQ12879 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
GRIN2AQ12879 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
GRIN2AQ12879 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
GRIN2AQ12879 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC33.93■■■■□ 3.02
GRIN2AQ12879 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
GRIN2AQ12879 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.92■■■■□ 3.02
GRIN2AQ12879 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
GRIN2AQ12879 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
GRIN2AQ12879 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
GRIN2AQ12879 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
GRIN2AQ12879 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
GRIN2AQ12879 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
GRIN2AQ12879 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
GRIN2AQ12879 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
GRIN2AQ12879 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
GRIN2AQ12879 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
GRIN2AQ12879 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC33.91■■■■□ 3.02
GRIN2AQ12879 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
GRIN2AQ12879 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
GRIN2AQ12879 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
GRIN2AQ12879 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
GRIN2AQ12879 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
GRIN2AQ12879 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
GRIN2AQ12879 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
GRIN2AQ12879 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
GRIN2AQ12879 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
GRIN2AQ12879 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
GRIN2AQ12879 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
GRIN2AQ12879 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
GRIN2AQ12879 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
GRIN2AQ12879 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
GRIN2AQ12879 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
GRIN2AQ12879 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
GRIN2AQ12879 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC33.89■■■■□ 3.02
GRIN2AQ12879 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
GRIN2AQ12879 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
GRIN2AQ12879 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.89■■■■□ 3.02
GRIN2AQ12879 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
GRIN2AQ12879 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
GRIN2AQ12879 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
GRIN2AQ12879 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
GRIN2AQ12879 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
GRIN2AQ12879 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
GRIN2AQ12879 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
GRIN2AQ12879 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
GRIN2AQ12879 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
GRIN2AQ12879 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
GRIN2AQ12879 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC33.88■■■■□ 3.01
GRIN2AQ12879 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
GRIN2AQ12879 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
GRIN2AQ12879 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
GRIN2AQ12879 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
GRIN2AQ12879 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
GRIN2AQ12879 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
GRIN2AQ12879 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC33.88■■■■□ 3.01
GRIN2AQ12879 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
GRIN2AQ12879 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
GRIN2AQ12879 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
GRIN2AQ12879 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
GRIN2AQ12879 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
GRIN2AQ12879 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
GRIN2AQ12879 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
GRIN2AQ12879 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
GRIN2AQ12879 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
GRIN2AQ12879 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
GRIN2AQ12879 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
GRIN2AQ12879 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
GRIN2AQ12879 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
GRIN2AQ12879 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
GRIN2AQ12879 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
GRIN2AQ12879 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
GRIN2AQ12879 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
GRIN2AQ12879 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
GRIN2AQ12879 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
GRIN2AQ12879 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
GRIN2AQ12879 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
GRIN2AQ12879 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
GRIN2AQ12879 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.86■■■■□ 3.01
GRIN2AQ12879 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
GRIN2AQ12879 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.86■■■■□ 3.01
GRIN2AQ12879 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC33.86■■■■□ 3.01
GRIN2AQ12879 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
GRIN2AQ12879 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
GRIN2AQ12879 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
GRIN2AQ12879 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
GRIN2AQ12879 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
GRIN2AQ12879 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
GRIN2AQ12879 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
GRIN2AQ12879 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
GRIN2AQ12879 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC33.85■■■■□ 3.01
GRIN2AQ12879 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
GRIN2AQ12879 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms