Protein–RNA interactions for Protein: P36871

PGM1, Phosphoglucomutase-1, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGM1P36871 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PGM1P36871 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PGM1P36871 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PGM1P36871 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PGM1P36871 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PGM1P36871 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PGM1P36871 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PGM1P36871 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PGM1P36871 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PGM1P36871 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PGM1P36871 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PGM1P36871 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PGM1P36871 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PGM1P36871 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PGM1P36871 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PGM1P36871 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PGM1P36871 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PGM1P36871 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PGM1P36871 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PGM1P36871 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PGM1P36871 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PGM1P36871 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PGM1P36871 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PGM1P36871 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PGM1P36871 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PGM1P36871 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PGM1P36871 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PGM1P36871 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PGM1P36871 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PGM1P36871 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PGM1P36871 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PGM1P36871 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PGM1P36871 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PGM1P36871 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PGM1P36871 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PGM1P36871 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PGM1P36871 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PGM1P36871 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PGM1P36871 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PGM1P36871 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PGM1P36871 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PGM1P36871 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PGM1P36871 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PGM1P36871 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PGM1P36871 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PGM1P36871 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PGM1P36871 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PGM1P36871 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PGM1P36871 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PGM1P36871 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PGM1P36871 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PGM1P36871 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PGM1P36871 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PGM1P36871 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PGM1P36871 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PGM1P36871 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PGM1P36871 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PGM1P36871 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PGM1P36871 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PGM1P36871 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PGM1P36871 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PGM1P36871 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PGM1P36871 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PGM1P36871 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PGM1P36871 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PGM1P36871 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PGM1P36871 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PGM1P36871 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PGM1P36871 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PGM1P36871 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PGM1P36871 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PGM1P36871 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PGM1P36871 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PGM1P36871 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PGM1P36871 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PGM1P36871 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PGM1P36871 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PGM1P36871 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PGM1P36871 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PGM1P36871 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PGM1P36871 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PGM1P36871 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PGM1P36871 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PGM1P36871 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PGM1P36871 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PGM1P36871 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PGM1P36871 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PGM1P36871 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PGM1P36871 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PGM1P36871 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PGM1P36871 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PGM1P36871 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PGM1P36871 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PGM1P36871 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PGM1P36871 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PGM1P36871 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PGM1P36871 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PGM1P36871 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PGM1P36871 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PGM1P36871 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.3 ms