Protein–RNA interactions for Protein: A6NIN4

Putative uncharacterized protein FLJ38447, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A6NIN4 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
A6NIN4 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
A6NIN4 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
A6NIN4 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
A6NIN4 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
A6NIN4 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
A6NIN4 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
A6NIN4 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
A6NIN4 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
A6NIN4 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
A6NIN4 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
A6NIN4 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
A6NIN4 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
A6NIN4 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
A6NIN4 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
A6NIN4 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
A6NIN4 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
A6NIN4 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
A6NIN4 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
A6NIN4 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
A6NIN4 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
A6NIN4 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
A6NIN4 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
A6NIN4 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
A6NIN4 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
A6NIN4 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
A6NIN4 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
A6NIN4 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
A6NIN4 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
A6NIN4 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
A6NIN4 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
A6NIN4 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
A6NIN4 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
A6NIN4 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
A6NIN4 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
A6NIN4 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
A6NIN4 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
A6NIN4 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
A6NIN4 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
A6NIN4 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
A6NIN4 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
A6NIN4 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
A6NIN4 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
A6NIN4 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
A6NIN4 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
A6NIN4 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
A6NIN4 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
A6NIN4 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
A6NIN4 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
A6NIN4 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
A6NIN4 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
A6NIN4 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
A6NIN4 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
A6NIN4 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
A6NIN4 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
A6NIN4 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
A6NIN4 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
A6NIN4 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
A6NIN4 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
A6NIN4 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
A6NIN4 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
A6NIN4 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
A6NIN4 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
A6NIN4 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
A6NIN4 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
A6NIN4 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
A6NIN4 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
A6NIN4 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
A6NIN4 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
A6NIN4 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
A6NIN4 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
A6NIN4 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
A6NIN4 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
A6NIN4 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
A6NIN4 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
A6NIN4 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
A6NIN4 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
A6NIN4 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
A6NIN4 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
A6NIN4 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
A6NIN4 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
A6NIN4 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
A6NIN4 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
A6NIN4 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
A6NIN4 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
A6NIN4 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
A6NIN4 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
A6NIN4 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
A6NIN4 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
A6NIN4 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
A6NIN4 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
A6NIN4 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
A6NIN4 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
A6NIN4 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
A6NIN4 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
A6NIN4 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
A6NIN4 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
A6NIN4 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
A6NIN4 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
A6NIN4 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms