Protein–RNA interactions for Protein: P48729

CSNK1A1, Casein kinase I isoform alpha, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1A1P48729 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CSNK1A1P48729 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CSNK1A1P48729 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CSNK1A1P48729 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CSNK1A1P48729 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CSNK1A1P48729 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CSNK1A1P48729 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CSNK1A1P48729 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CSNK1A1P48729 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CSNK1A1P48729 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CSNK1A1P48729 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CSNK1A1P48729 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CSNK1A1P48729 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CSNK1A1P48729 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CSNK1A1P48729 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CSNK1A1P48729 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CSNK1A1P48729 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CSNK1A1P48729 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CSNK1A1P48729 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CSNK1A1P48729 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CSNK1A1P48729 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CSNK1A1P48729 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CSNK1A1P48729 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CSNK1A1P48729 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CSNK1A1P48729 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CSNK1A1P48729 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CSNK1A1P48729 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CSNK1A1P48729 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CSNK1A1P48729 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CSNK1A1P48729 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CSNK1A1P48729 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CSNK1A1P48729 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CSNK1A1P48729 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CSNK1A1P48729 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CSNK1A1P48729 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CSNK1A1P48729 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CSNK1A1P48729 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CSNK1A1P48729 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CSNK1A1P48729 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CSNK1A1P48729 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CSNK1A1P48729 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CSNK1A1P48729 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CSNK1A1P48729 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CSNK1A1P48729 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CSNK1A1P48729 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CSNK1A1P48729 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CSNK1A1P48729 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CSNK1A1P48729 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CSNK1A1P48729 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CSNK1A1P48729 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CSNK1A1P48729 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CSNK1A1P48729 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CSNK1A1P48729 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CSNK1A1P48729 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CSNK1A1P48729 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CSNK1A1P48729 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CSNK1A1P48729 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CSNK1A1P48729 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CSNK1A1P48729 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CSNK1A1P48729 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CSNK1A1P48729 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CSNK1A1P48729 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CSNK1A1P48729 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CSNK1A1P48729 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CSNK1A1P48729 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CSNK1A1P48729 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CSNK1A1P48729 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CSNK1A1P48729 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CSNK1A1P48729 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CSNK1A1P48729 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CSNK1A1P48729 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CSNK1A1P48729 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CSNK1A1P48729 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CSNK1A1P48729 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CSNK1A1P48729 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CSNK1A1P48729 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CSNK1A1P48729 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CSNK1A1P48729 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CSNK1A1P48729 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CSNK1A1P48729 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CSNK1A1P48729 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CSNK1A1P48729 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CSNK1A1P48729 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CSNK1A1P48729 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CSNK1A1P48729 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CSNK1A1P48729 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CSNK1A1P48729 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CSNK1A1P48729 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CSNK1A1P48729 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CSNK1A1P48729 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CSNK1A1P48729 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CSNK1A1P48729 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CSNK1A1P48729 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CSNK1A1P48729 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSNK1A1P48729 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSNK1A1P48729 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSNK1A1P48729 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSNK1A1P48729 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSNK1A1P48729 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CSNK1A1P48729 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms