Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJU5

FOXD3, Forkhead box protein D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD3Q9UJU5 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FOXD3Q9UJU5 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FOXD3Q9UJU5 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FOXD3Q9UJU5 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FOXD3Q9UJU5 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FOXD3Q9UJU5 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FOXD3Q9UJU5 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FOXD3Q9UJU5 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FOXD3Q9UJU5 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FOXD3Q9UJU5 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FOXD3Q9UJU5 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FOXD3Q9UJU5 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FOXD3Q9UJU5 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FOXD3Q9UJU5 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FOXD3Q9UJU5 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FOXD3Q9UJU5 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FOXD3Q9UJU5 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FOXD3Q9UJU5 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FOXD3Q9UJU5 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FOXD3Q9UJU5 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FOXD3Q9UJU5 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FOXD3Q9UJU5 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FOXD3Q9UJU5 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FOXD3Q9UJU5 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FOXD3Q9UJU5 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FOXD3Q9UJU5 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FOXD3Q9UJU5 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
FOXD3Q9UJU5 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FOXD3Q9UJU5 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FOXD3Q9UJU5 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FOXD3Q9UJU5 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FOXD3Q9UJU5 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
FOXD3Q9UJU5 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
FOXD3Q9UJU5 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
FOXD3Q9UJU5 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
FOXD3Q9UJU5 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
FOXD3Q9UJU5 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
FOXD3Q9UJU5 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
FOXD3Q9UJU5 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FOXD3Q9UJU5 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FOXD3Q9UJU5 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FOXD3Q9UJU5 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
FOXD3Q9UJU5 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
FOXD3Q9UJU5 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
FOXD3Q9UJU5 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
FOXD3Q9UJU5 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
FOXD3Q9UJU5 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
FOXD3Q9UJU5 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
FOXD3Q9UJU5 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
FOXD3Q9UJU5 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
FOXD3Q9UJU5 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
FOXD3Q9UJU5 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
FOXD3Q9UJU5 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
FOXD3Q9UJU5 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
FOXD3Q9UJU5 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
FOXD3Q9UJU5 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
FOXD3Q9UJU5 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
FOXD3Q9UJU5 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
FOXD3Q9UJU5 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
FOXD3Q9UJU5 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
FOXD3Q9UJU5 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
FOXD3Q9UJU5 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
FOXD3Q9UJU5 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
FOXD3Q9UJU5 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
FOXD3Q9UJU5 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
FOXD3Q9UJU5 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
FOXD3Q9UJU5 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
FOXD3Q9UJU5 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
FOXD3Q9UJU5 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
FOXD3Q9UJU5 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
FOXD3Q9UJU5 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
FOXD3Q9UJU5 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
FOXD3Q9UJU5 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
FOXD3Q9UJU5 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
FOXD3Q9UJU5 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
FOXD3Q9UJU5 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
FOXD3Q9UJU5 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
FOXD3Q9UJU5 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
FOXD3Q9UJU5 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
FOXD3Q9UJU5 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
FOXD3Q9UJU5 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
FOXD3Q9UJU5 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
FOXD3Q9UJU5 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
FOXD3Q9UJU5 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
FOXD3Q9UJU5 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
FOXD3Q9UJU5 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
FOXD3Q9UJU5 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
FOXD3Q9UJU5 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
FOXD3Q9UJU5 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
FOXD3Q9UJU5 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
FOXD3Q9UJU5 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
FOXD3Q9UJU5 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
FOXD3Q9UJU5 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
FOXD3Q9UJU5 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
FOXD3Q9UJU5 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
FOXD3Q9UJU5 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
FOXD3Q9UJU5 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
FOXD3Q9UJU5 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
FOXD3Q9UJU5 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
FOXD3Q9UJU5 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms