Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFU0

BEST4, Bestrophin-4, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST4Q8NFU0 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BEST4Q8NFU0 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BEST4Q8NFU0 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BEST4Q8NFU0 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BEST4Q8NFU0 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BEST4Q8NFU0 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BEST4Q8NFU0 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BEST4Q8NFU0 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BEST4Q8NFU0 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BEST4Q8NFU0 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BEST4Q8NFU0 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BEST4Q8NFU0 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BEST4Q8NFU0 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BEST4Q8NFU0 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BEST4Q8NFU0 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BEST4Q8NFU0 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BEST4Q8NFU0 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BEST4Q8NFU0 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BEST4Q8NFU0 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BEST4Q8NFU0 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BEST4Q8NFU0 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BEST4Q8NFU0 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BEST4Q8NFU0 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
BEST4Q8NFU0 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BEST4Q8NFU0 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BEST4Q8NFU0 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BEST4Q8NFU0 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BEST4Q8NFU0 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BEST4Q8NFU0 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BEST4Q8NFU0 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
BEST4Q8NFU0 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BEST4Q8NFU0 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BEST4Q8NFU0 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BEST4Q8NFU0 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BEST4Q8NFU0 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BEST4Q8NFU0 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BEST4Q8NFU0 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BEST4Q8NFU0 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BEST4Q8NFU0 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BEST4Q8NFU0 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BEST4Q8NFU0 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BEST4Q8NFU0 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BEST4Q8NFU0 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BEST4Q8NFU0 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BEST4Q8NFU0 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BEST4Q8NFU0 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BEST4Q8NFU0 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BEST4Q8NFU0 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BEST4Q8NFU0 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BEST4Q8NFU0 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BEST4Q8NFU0 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BEST4Q8NFU0 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BEST4Q8NFU0 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BEST4Q8NFU0 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BEST4Q8NFU0 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
BEST4Q8NFU0 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
BEST4Q8NFU0 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BEST4Q8NFU0 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BEST4Q8NFU0 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
BEST4Q8NFU0 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BEST4Q8NFU0 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BEST4Q8NFU0 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BEST4Q8NFU0 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BEST4Q8NFU0 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
BEST4Q8NFU0 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
BEST4Q8NFU0 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
BEST4Q8NFU0 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BEST4Q8NFU0 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BEST4Q8NFU0 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
BEST4Q8NFU0 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
BEST4Q8NFU0 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BEST4Q8NFU0 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
BEST4Q8NFU0 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
BEST4Q8NFU0 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BEST4Q8NFU0 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BEST4Q8NFU0 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BEST4Q8NFU0 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BEST4Q8NFU0 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BEST4Q8NFU0 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BEST4Q8NFU0 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
BEST4Q8NFU0 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BEST4Q8NFU0 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BEST4Q8NFU0 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
BEST4Q8NFU0 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BEST4Q8NFU0 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BEST4Q8NFU0 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
BEST4Q8NFU0 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
BEST4Q8NFU0 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BEST4Q8NFU0 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BEST4Q8NFU0 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BEST4Q8NFU0 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BEST4Q8NFU0 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BEST4Q8NFU0 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BEST4Q8NFU0 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BEST4Q8NFU0 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
BEST4Q8NFU0 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
BEST4Q8NFU0 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
BEST4Q8NFU0 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BEST4Q8NFU0 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BEST4Q8NFU0 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms