Protein–RNA interactions for Protein: Q15075

EEA1, Early endosome antigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEA1Q15075 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.07
EEA1Q15075 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
EEA1Q15075 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.07
EEA1Q15075 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.07
EEA1Q15075 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
EEA1Q15075 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
EEA1Q15075 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
EEA1Q15075 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
EEA1Q15075 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC34.25■■■■□ 3.07
EEA1Q15075 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
EEA1Q15075 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
EEA1Q15075 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC34.25■■■■□ 3.07
EEA1Q15075 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
EEA1Q15075 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
EEA1Q15075 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
EEA1Q15075 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
EEA1Q15075 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
EEA1Q15075 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
EEA1Q15075 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
EEA1Q15075 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
EEA1Q15075 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
EEA1Q15075 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
EEA1Q15075 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
EEA1Q15075 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
EEA1Q15075 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
EEA1Q15075 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
EEA1Q15075 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
EEA1Q15075 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
EEA1Q15075 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
EEA1Q15075 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC34.24■■■■□ 3.07
EEA1Q15075 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC34.23■■■■□ 3.07
EEA1Q15075 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC34.23■■■■□ 3.07
EEA1Q15075 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
EEA1Q15075 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
EEA1Q15075 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
EEA1Q15075 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
EEA1Q15075 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
EEA1Q15075 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
EEA1Q15075 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
EEA1Q15075 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC34.22■■■■□ 3.07
EEA1Q15075 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
EEA1Q15075 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
EEA1Q15075 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
EEA1Q15075 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
EEA1Q15075 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
EEA1Q15075 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
EEA1Q15075 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
EEA1Q15075 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
EEA1Q15075 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
EEA1Q15075 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
EEA1Q15075 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC34.21■■■■□ 3.07
EEA1Q15075 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
EEA1Q15075 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
EEA1Q15075 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
EEA1Q15075 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
EEA1Q15075 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
EEA1Q15075 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
EEA1Q15075 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
EEA1Q15075 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
EEA1Q15075 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC34.21■■■■□ 3.07
EEA1Q15075 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
EEA1Q15075 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
EEA1Q15075 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
EEA1Q15075 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
EEA1Q15075 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
EEA1Q15075 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
EEA1Q15075 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
EEA1Q15075 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
EEA1Q15075 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC34.2■■■■□ 3.07
EEA1Q15075 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
EEA1Q15075 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.06
EEA1Q15075 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.06
EEA1Q15075 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
EEA1Q15075 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
EEA1Q15075 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
EEA1Q15075 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
EEA1Q15075 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
EEA1Q15075 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
EEA1Q15075 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
EEA1Q15075 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
EEA1Q15075 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
EEA1Q15075 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
EEA1Q15075 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC34.18■■■■□ 3.06
EEA1Q15075 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
EEA1Q15075 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
EEA1Q15075 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC34.18■■■■□ 3.06
EEA1Q15075 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
EEA1Q15075 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
EEA1Q15075 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
EEA1Q15075 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
EEA1Q15075 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
EEA1Q15075 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
EEA1Q15075 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
EEA1Q15075 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
EEA1Q15075 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
EEA1Q15075 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC34.16■■■■□ 3.06
EEA1Q15075 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
EEA1Q15075 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
EEA1Q15075 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
EEA1Q15075 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
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