Protein–RNA interactions for Protein: Q01196

RUNX1, Runt-related transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX1Q01196 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RUNX1Q01196 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RUNX1Q01196 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RUNX1Q01196 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RUNX1Q01196 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RUNX1Q01196 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RUNX1Q01196 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RUNX1Q01196 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RUNX1Q01196 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RUNX1Q01196 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RUNX1Q01196 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RUNX1Q01196 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RUNX1Q01196 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RUNX1Q01196 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RUNX1Q01196 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RUNX1Q01196 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RUNX1Q01196 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RUNX1Q01196 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
RUNX1Q01196 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RUNX1Q01196 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RUNX1Q01196 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RUNX1Q01196 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RUNX1Q01196 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RUNX1Q01196 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
RUNX1Q01196 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RUNX1Q01196 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RUNX1Q01196 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RUNX1Q01196 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RUNX1Q01196 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RUNX1Q01196 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RUNX1Q01196 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RUNX1Q01196 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RUNX1Q01196 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RUNX1Q01196 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RUNX1Q01196 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RUNX1Q01196 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RUNX1Q01196 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RUNX1Q01196 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RUNX1Q01196 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RUNX1Q01196 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RUNX1Q01196 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RUNX1Q01196 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
RUNX1Q01196 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RUNX1Q01196 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RUNX1Q01196 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RUNX1Q01196 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RUNX1Q01196 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RUNX1Q01196 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RUNX1Q01196 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RUNX1Q01196 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RUNX1Q01196 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
RUNX1Q01196 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RUNX1Q01196 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RUNX1Q01196 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RUNX1Q01196 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RUNX1Q01196 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RUNX1Q01196 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RUNX1Q01196 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RUNX1Q01196 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RUNX1Q01196 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RUNX1Q01196 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RUNX1Q01196 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RUNX1Q01196 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RUNX1Q01196 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
RUNX1Q01196 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
RUNX1Q01196 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RUNX1Q01196 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RUNX1Q01196 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RUNX1Q01196 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RUNX1Q01196 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RUNX1Q01196 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RUNX1Q01196 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RUNX1Q01196 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RUNX1Q01196 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RUNX1Q01196 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RUNX1Q01196 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RUNX1Q01196 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RUNX1Q01196 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RUNX1Q01196 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RUNX1Q01196 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RUNX1Q01196 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RUNX1Q01196 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RUNX1Q01196 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RUNX1Q01196 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RUNX1Q01196 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RUNX1Q01196 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RUNX1Q01196 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RUNX1Q01196 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RUNX1Q01196 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RUNX1Q01196 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC17■□□□□ 0.31
RUNX1Q01196 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RUNX1Q01196 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RUNX1Q01196 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RUNX1Q01196 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RUNX1Q01196 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RUNX1Q01196 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RUNX1Q01196 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RUNX1Q01196 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RUNX1Q01196 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RUNX1Q01196 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms