Protein–RNA interactions for Protein: O00515

LAD1, Ladinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAD1O00515 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LAD1O00515 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LAD1O00515 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LAD1O00515 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LAD1O00515 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LAD1O00515 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LAD1O00515 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LAD1O00515 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LAD1O00515 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LAD1O00515 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LAD1O00515 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LAD1O00515 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LAD1O00515 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LAD1O00515 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LAD1O00515 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LAD1O00515 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LAD1O00515 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
LAD1O00515 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LAD1O00515 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LAD1O00515 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LAD1O00515 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LAD1O00515 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LAD1O00515 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LAD1O00515 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LAD1O00515 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LAD1O00515 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LAD1O00515 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LAD1O00515 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LAD1O00515 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LAD1O00515 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LAD1O00515 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LAD1O00515 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LAD1O00515 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LAD1O00515 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LAD1O00515 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LAD1O00515 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LAD1O00515 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LAD1O00515 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LAD1O00515 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LAD1O00515 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LAD1O00515 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LAD1O00515 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LAD1O00515 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LAD1O00515 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LAD1O00515 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LAD1O00515 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
LAD1O00515 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LAD1O00515 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LAD1O00515 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LAD1O00515 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LAD1O00515 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LAD1O00515 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LAD1O00515 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
LAD1O00515 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LAD1O00515 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LAD1O00515 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LAD1O00515 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LAD1O00515 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LAD1O00515 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LAD1O00515 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
LAD1O00515 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LAD1O00515 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LAD1O00515 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LAD1O00515 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LAD1O00515 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LAD1O00515 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LAD1O00515 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
LAD1O00515 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LAD1O00515 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LAD1O00515 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LAD1O00515 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
LAD1O00515 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LAD1O00515 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LAD1O00515 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LAD1O00515 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LAD1O00515 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LAD1O00515 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LAD1O00515 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LAD1O00515 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LAD1O00515 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LAD1O00515 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LAD1O00515 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LAD1O00515 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LAD1O00515 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LAD1O00515 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LAD1O00515 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LAD1O00515 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LAD1O00515 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
LAD1O00515 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LAD1O00515 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LAD1O00515 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LAD1O00515 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LAD1O00515 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LAD1O00515 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
LAD1O00515 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LAD1O00515 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LAD1O00515 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LAD1O00515 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LAD1O00515 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LAD1O00515 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms