Protein–RNA interactions for Protein: Q3LHN0

KRTAP25-1, Keratin-associated protein 25-1, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP25-1Q3LHN0 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC9.67□□□□□ -0.86
KRTAP25-1Q3LHN0 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
KRTAP25-1Q3LHN0 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
KRTAP25-1Q3LHN0 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
KRTAP25-1Q3LHN0 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
KRTAP25-1Q3LHN0 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
KRTAP25-1Q3LHN0 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
KRTAP25-1Q3LHN0 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
KRTAP25-1Q3LHN0 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
KRTAP25-1Q3LHN0 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
KRTAP25-1Q3LHN0 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
KRTAP25-1Q3LHN0 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
KRTAP25-1Q3LHN0 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
KRTAP25-1Q3LHN0 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
KRTAP25-1Q3LHN0 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC9.67□□□□□ -0.86
KRTAP25-1Q3LHN0 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
KRTAP25-1Q3LHN0 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
KRTAP25-1Q3LHN0 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
KRTAP25-1Q3LHN0 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
KRTAP25-1Q3LHN0 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
KRTAP25-1Q3LHN0 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
KRTAP25-1Q3LHN0 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
KRTAP25-1Q3LHN0 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
KRTAP25-1Q3LHN0 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
KRTAP25-1Q3LHN0 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
KRTAP25-1Q3LHN0 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
KRTAP25-1Q3LHN0 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
KRTAP25-1Q3LHN0 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
KRTAP25-1Q3LHN0 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
KRTAP25-1Q3LHN0 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
KRTAP25-1Q3LHN0 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
KRTAP25-1Q3LHN0 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
KRTAP25-1Q3LHN0 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
KRTAP25-1Q3LHN0 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
KRTAP25-1Q3LHN0 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
KRTAP25-1Q3LHN0 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
KRTAP25-1Q3LHN0 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
KRTAP25-1Q3LHN0 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC9.66□□□□□ -0.86
KRTAP25-1Q3LHN0 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
KRTAP25-1Q3LHN0 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
KRTAP25-1Q3LHN0 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
KRTAP25-1Q3LHN0 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
KRTAP25-1Q3LHN0 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
KRTAP25-1Q3LHN0 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
KRTAP25-1Q3LHN0 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
KRTAP25-1Q3LHN0 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
KRTAP25-1Q3LHN0 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
KRTAP25-1Q3LHN0 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
KRTAP25-1Q3LHN0 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
KRTAP25-1Q3LHN0 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
KRTAP25-1Q3LHN0 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
KRTAP25-1Q3LHN0 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
KRTAP25-1Q3LHN0 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
KRTAP25-1Q3LHN0 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
KRTAP25-1Q3LHN0 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
KRTAP25-1Q3LHN0 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC9.65□□□□□ -0.86
KRTAP25-1Q3LHN0 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
KRTAP25-1Q3LHN0 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
KRTAP25-1Q3LHN0 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
KRTAP25-1Q3LHN0 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
KRTAP25-1Q3LHN0 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
KRTAP25-1Q3LHN0 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
KRTAP25-1Q3LHN0 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
KRTAP25-1Q3LHN0 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
KRTAP25-1Q3LHN0 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
KRTAP25-1Q3LHN0 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
KRTAP25-1Q3LHN0 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
KRTAP25-1Q3LHN0 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
KRTAP25-1Q3LHN0 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
KRTAP25-1Q3LHN0 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
KRTAP25-1Q3LHN0 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
KRTAP25-1Q3LHN0 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
KRTAP25-1Q3LHN0 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
KRTAP25-1Q3LHN0 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
KRTAP25-1Q3LHN0 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
KRTAP25-1Q3LHN0 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
KRTAP25-1Q3LHN0 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
KRTAP25-1Q3LHN0 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
KRTAP25-1Q3LHN0 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
KRTAP25-1Q3LHN0 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC9.65□□□□□ -0.87
KRTAP25-1Q3LHN0 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC9.65□□□□□ -0.87
KRTAP25-1Q3LHN0 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
KRTAP25-1Q3LHN0 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
KRTAP25-1Q3LHN0 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
KRTAP25-1Q3LHN0 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.87
KRTAP25-1Q3LHN0 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
KRTAP25-1Q3LHN0 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
KRTAP25-1Q3LHN0 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
KRTAP25-1Q3LHN0 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
KRTAP25-1Q3LHN0 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
KRTAP25-1Q3LHN0 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
KRTAP25-1Q3LHN0 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
KRTAP25-1Q3LHN0 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
KRTAP25-1Q3LHN0 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
KRTAP25-1Q3LHN0 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
KRTAP25-1Q3LHN0 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
KRTAP25-1Q3LHN0 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
KRTAP25-1Q3LHN0 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
KRTAP25-1Q3LHN0 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
KRTAP25-1Q3LHN0 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.4 ms