RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000291592.5

LRRC3-201, Transcript of leucine rich repeat containing 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LRRC3, Length 5,869 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC3-201ENST00000291592 DCAF8L2P0C7V8 631 aa28.64■■■□□ 2.18
LRRC3-201ENST00000291592 NISCHQ9Y2I1 1504 aa28.35■■■□□ 2.13
LRRC3-201ENST00000291592 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP27.23■■□□□ 1.95
LRRC3-201ENST00000291592 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa27■■□□□ 1.91
LRRC3-201ENST00000291592 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP26.85■■□□□ 1.89
LRRC3-201ENST00000291592 EHMT2Q96KQ7 1210 aa26.2■■□□□ 1.79
LRRC3-201ENST00000291592 APLP2Q06481 763 aa25.86■■□□□ 1.73
LRRC3-201ENST00000291592 ERICH6Q7L0X2 663 aa25.83■■□□□ 1.72
LRRC3-201ENST00000291592 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP25.62■■□□□ 1.69
LRRC3-201ENST00000291592 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP25.62■■□□□ 1.69
LRRC3-201ENST00000291592 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP25.57■■□□□ 1.68
LRRC3-201ENST00000291592 PCGF6Q9BYE7 350 aa25.45■■□□□ 1.66
LRRC3-201ENST00000291592 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP25.41■■□□□ 1.66
LRRC3-201ENST00000291592 TRIM41Q8WV44 630 aa25.26■■□□□ 1.63
LRRC3-201ENST00000291592 MYT1Q01538 1121 aa25.26■■□□□ 1.63
LRRC3-201ENST00000291592 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.63
LRRC3-201ENST00000291592 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.61
LRRC3-201ENST00000291592 NEFLP07196 543 aa25.08■■□□□ 1.61
LRRC3-201ENST00000291592 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP24.91■■□□□ 1.58
LRRC3-201ENST00000291592 UBTFP17480 764 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
LRRC3-201ENST00000291592 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP24.79■■□□□ 1.56
LRRC3-201ENST00000291592 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP24.55■■□□□ 1.52
LRRC3-201ENST00000291592 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP24.45■■□□□ 1.5
LRRC3-201ENST00000291592 CHIC1Q5VXU3 224 aa24.36■■□□□ 1.49
LRRC3-201ENST00000291592 ABCC9O60706 1549 aa24.31■■□□□ 1.48
LRRC3-201ENST00000291592 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa24.27■■□□□ 1.47
LRRC3-201ENST00000291592 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP24.27■■□□□ 1.47
LRRC3-201ENST00000291592 HRCP23327 699 aa24.23■■□□□ 1.47
LRRC3-201ENST00000291592 POLR3GLQ9BT43 218 aa24.13■■□□□ 1.45
LRRC3-201ENST00000291592 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP24.08■■□□□ 1.45
LRRC3-201ENST00000291592 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP24.03■■□□□ 1.44
LRRC3-201ENST00000291592 ITGAEP38570 1179 aa24■■□□□ 1.43
LRRC3-201ENST00000291592 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP23.95■■□□□ 1.43
LRRC3-201ENST00000291592 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP23.95■■□□□ 1.43
LRRC3-201ENST00000291592 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP23.94■■□□□ 1.42
LRRC3-201ENST00000291592 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP23.91■■□□□ 1.42
LRRC3-201ENST00000291592 MYT1LQ9UL68 1186 aa23.85■■□□□ 1.41
LRRC3-201ENST00000291592 CLSPNQ9HAW4 1339 aa23.83■■□□□ 1.4
LRRC3-201ENST00000291592 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP23.64■■□□□ 1.38
LRRC3-201ENST00000291592 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
LRRC3-201ENST00000291592 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
LRRC3-201ENST00000291592 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
LRRC3-201ENST00000291592 SCRIBQ14160 1630 aa23.46■■□□□ 1.35
LRRC3-201ENST00000291592 BCANQ96GW7 911 aa23.44■■□□□ 1.34
LRRC3-201ENST00000291592 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa23.39■■□□□ 1.34
LRRC3-201ENST00000291592 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
LRRC3-201ENST00000291592 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa23.34■■□□□ 1.33
LRRC3-201ENST00000291592 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP23.26■■□□□ 1.31
LRRC3-201ENST00000291592 TRIM52Q96A61 297 aa23.26■■□□□ 1.31
LRRC3-201ENST00000291592 CSRNP3Q8WYN3 585 aa23.24■■□□□ 1.31
LRRC3-201ENST00000291592 FBLN2P98095 1184 aa23.21■■□□□ 1.31
LRRC3-201ENST00000291592 NEUROD1Q13562 356 aa23.18■■□□□ 1.3
LRRC3-201ENST00000291592 ANP32CO43423 234 aa23.18■■□□□ 1.3
LRRC3-201ENST00000291592 P3H3Q8IVL6 736 aa23.11■■□□□ 1.29
LRRC3-201ENST00000291592 CANXP27824 592 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
LRRC3-201ENST00000291592 BCL11AQ9H165 835 aa23.04■■□□□ 1.28
LRRC3-201ENST00000291592 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP23.03■■□□□ 1.28
LRRC3-201ENST00000291592 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP23.02■■□□□ 1.28
LRRC3-201ENST00000291592 ARID3CA6NKF2 412 aa22.98■■□□□ 1.27
LRRC3-201ENST00000291592 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
LRRC3-201ENST00000291592 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
LRRC3-201ENST00000291592 SLC24A1O60721 1099 aa22.91■■□□□ 1.26
LRRC3-201ENST00000291592 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.26
LRRC3-201ENST00000291592 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa22.85■■□□□ 1.25
LRRC3-201ENST00000291592 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
LRRC3-201ENST00000291592 NEFMP07197 916 aa22.83■■□□□ 1.24
LRRC3-201ENST00000291592 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
LRRC3-201ENST00000291592 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa22.74■■□□□ 1.23
LRRC3-201ENST00000291592 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa22.74■■□□□ 1.23
LRRC3-201ENST00000291592 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
LRRC3-201ENST00000291592 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
LRRC3-201ENST00000291592 NACADO15069 1562 aa22.65■■□□□ 1.22
LRRC3-201ENST00000291592 FKBP8Q14318 412 aa22.63■■□□□ 1.21
LRRC3-201ENST00000291592 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
LRRC3-201ENST00000291592 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
LRRC3-201ENST00000291592 TONSLQ96HA7 1378 aa22.48■■□□□ 1.19
LRRC3-201ENST00000291592 MYO15BQ96JP2 1530 aa22.47■■□□□ 1.19
LRRC3-201ENST00000291592 NBR1Q14596 966 aa22.47■■□□□ 1.19
LRRC3-201ENST00000291592 CLIP1P30622 1438 aa22.46■■□□□ 1.19
LRRC3-201ENST00000291592 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP22.44■■□□□ 1.18
LRRC3-201ENST00000291592 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
LRRC3-201ENST00000291592 CHIC2Q9UKJ5 165 aa22.42■■□□□ 1.18
LRRC3-201ENST00000291592 ARXQ96QS3 562 aa22.4■■□□□ 1.18
LRRC3-201ENST00000291592 EEA1Q15075 1411 aa22.38■■□□□ 1.17
LRRC3-201ENST00000291592 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP22.38■■□□□ 1.17
LRRC3-201ENST00000291592 MTUS2Q5JR59 1369 aa22.37■■□□□ 1.17
LRRC3-201ENST00000291592 GOLGA3Q08378 1498 aa22.37■■□□□ 1.17
LRRC3-201ENST00000291592 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
LRRC3-201ENST00000291592 FAM9BQ8IZU0 186 aa22.36■■□□□ 1.17
LRRC3-201ENST00000291592 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP22.35■■□□□ 1.17
LRRC3-201ENST00000291592 CCDC136Q96JN2 1154 aa22.34■■□□□ 1.17
LRRC3-201ENST00000291592 CEP162Q5TB80 1403 aa22.32■■□□□ 1.16
LRRC3-201ENST00000291592 CHGAP10645 457 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
LRRC3-201ENST00000291592 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
LRRC3-201ENST00000291592 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
LRRC3-201ENST00000291592 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
LRRC3-201ENST00000291592 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
LRRC3-201ENST00000291592 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
LRRC3-201ENST00000291592 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP22.25■■□□□ 1.15
LRRC3-201ENST00000291592 CECR2Q9BXF3 1484 aa22.25■■□□□ 1.15
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