Protein–RNA interactions for Protein: Q2M2E3

ODF4, Outer dense fiber protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF4Q2M2E3 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ODF4Q2M2E3 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ODF4Q2M2E3 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ODF4Q2M2E3 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ODF4Q2M2E3 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ODF4Q2M2E3 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ODF4Q2M2E3 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ODF4Q2M2E3 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ODF4Q2M2E3 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ODF4Q2M2E3 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ODF4Q2M2E3 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ODF4Q2M2E3 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ODF4Q2M2E3 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ODF4Q2M2E3 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ODF4Q2M2E3 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ODF4Q2M2E3 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ODF4Q2M2E3 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ODF4Q2M2E3 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ODF4Q2M2E3 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ODF4Q2M2E3 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ODF4Q2M2E3 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ODF4Q2M2E3 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ODF4Q2M2E3 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ODF4Q2M2E3 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ODF4Q2M2E3 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ODF4Q2M2E3 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ODF4Q2M2E3 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ODF4Q2M2E3 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ODF4Q2M2E3 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ODF4Q2M2E3 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ODF4Q2M2E3 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ODF4Q2M2E3 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ODF4Q2M2E3 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ODF4Q2M2E3 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ODF4Q2M2E3 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ODF4Q2M2E3 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ODF4Q2M2E3 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ODF4Q2M2E3 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ODF4Q2M2E3 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ODF4Q2M2E3 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ODF4Q2M2E3 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ODF4Q2M2E3 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ODF4Q2M2E3 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ODF4Q2M2E3 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ODF4Q2M2E3 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ODF4Q2M2E3 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ODF4Q2M2E3 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ODF4Q2M2E3 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ODF4Q2M2E3 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ODF4Q2M2E3 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ODF4Q2M2E3 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ODF4Q2M2E3 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ODF4Q2M2E3 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ODF4Q2M2E3 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ODF4Q2M2E3 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ODF4Q2M2E3 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ODF4Q2M2E3 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ODF4Q2M2E3 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ODF4Q2M2E3 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ODF4Q2M2E3 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ODF4Q2M2E3 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ODF4Q2M2E3 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ODF4Q2M2E3 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ODF4Q2M2E3 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ODF4Q2M2E3 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ODF4Q2M2E3 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ODF4Q2M2E3 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ODF4Q2M2E3 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ODF4Q2M2E3 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ODF4Q2M2E3 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ODF4Q2M2E3 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ODF4Q2M2E3 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ODF4Q2M2E3 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ODF4Q2M2E3 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ODF4Q2M2E3 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ODF4Q2M2E3 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ODF4Q2M2E3 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ODF4Q2M2E3 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ODF4Q2M2E3 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ODF4Q2M2E3 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ODF4Q2M2E3 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ODF4Q2M2E3 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ODF4Q2M2E3 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ODF4Q2M2E3 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ODF4Q2M2E3 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ODF4Q2M2E3 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ODF4Q2M2E3 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ODF4Q2M2E3 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ODF4Q2M2E3 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
ODF4Q2M2E3 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ODF4Q2M2E3 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ODF4Q2M2E3 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ODF4Q2M2E3 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ODF4Q2M2E3 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ODF4Q2M2E3 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ODF4Q2M2E3 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ODF4Q2M2E3 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
ODF4Q2M2E3 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ODF4Q2M2E3 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ODF4Q2M2E3 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.5 ms