Protein–RNA interactions for Protein: P53849

GIS2, Zinc finger protein GIS2, yeastyeast

Known RBP RIP-Chip data

Length 153 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
GIS2P53849 YIL171WYIL171W 330 nt2.78□□□□□ -1.96
GIS2P53849 YKL065W-AYKL065W-A 222 nt2.78□□□□□ -1.96
GIS2P53849 TDA5YLR426W 981 nt2.78□□□□□ -1.96
GIS2P53849 PAI3YMR174C 207 nt2.78□□□□□ -1.96
GIS2P53849 RPS10AYOR293W 318 nt2.78□□□□□ -1.96
GIS2P53849 YOR331CYOR331C 558 nt2.78□□□□□ -1.96 RIP-Chip
GIS2P53849 YOR365CYOR365C 2112 nt2.78□□□□□ -1.96
GIS2P53849 RIM21YNL294C 1602 nt2.78□□□□□ -1.96
GIS2P53849 UBX5YDR330W 1503 nt2.78□□□□□ -1.97
GIS2P53849 SSH1YBR283C 1473 nt2.77□□□□□ -1.97 RIP-Chip
GIS2P53849 ALE1YOR175C 1860 nt2.77□□□□□ -1.97 RIP-Chip
GIS2P53849 FPK1YNR047W 2682 nt2.77□□□□□ -1.97
GIS2P53849 SPB4YFL002C 1821 nt2.77□□□□□ -1.97
GIS2P53849 DBF2YGR092W 1719 nt2.77□□□□□ -1.97
GIS2P53849 HRD1YOL013C 1656 nt2.77□□□□□ -1.97 RIP-Chip
GIS2P53849 YDR090CYDR090C 933 nt2.77□□□□□ -1.97
GIS2P53849 CNL1YDR357C 369 nt2.77□□□□□ -1.97
GIS2P53849 NTF2YER009W 378 nt2.77□□□□□ -1.97 RIP-Chip
GIS2P53849 GOS1YHL031C 672 nt2.77□□□□□ -1.97
GIS2P53849 YLR269CYLR269C 351 nt2.77□□□□□ -1.97
GIS2P53849 CSR1YLR380W 1227 nt2.77□□□□□ -1.97
GIS2P53849 IMP4YNL075W 873 nt2.77□□□□□ -1.97 RIP-Chip
GIS2P53849 NOP15YNL110C 663 nt2.77□□□□□ -1.97
GIS2P53849 CDC33YOL139C 642 nt2.77□□□□□ -1.97
GIS2P53849 ATP3YBR039W 936 nt2.77□□□□□ -1.97
GIS2P53849 FYV5YCL058C 459 nt2.77□□□□□ -1.97
GIS2P53849 RPN3YER021W 1572 nt2.77□□□□□ -1.97
GIS2P53849 SDS23YGL056C 1584 nt2.77□□□□□ -1.97
GIS2P53849 CHA4YLR098C 1947 nt2.77□□□□□ -1.97
GIS2P53849 GAS3YMR215W 1575 nt2.77□□□□□ -1.97
GIS2P53849 CDC6YJL194W 1542 nt2.77□□□□□ -1.97
GIS2P53849 YNR063WYNR063W 1824 nt2.77□□□□□ -1.97
GIS2P53849 ATG2YNL242W 4779 nt2.77□□□□□ -1.97
GIS2P53849 SOF1YLL011W 1470 nt2.77□□□□□ -1.97
GIS2P53849 FRE1YLR214W 2061 nt2.77□□□□□ -1.97
GIS2P53849 BFR1YOR198C 1413 nt2.76□□□□□ -1.97
GIS2P53849 BLM10YFL007W 6432 nt2.76□□□□□ -1.97
GIS2P53849 SIN3YOL004W 4611 nt2.76□□□□□ -1.97
GIS2P53849 TPA1YER049W 1935 nt2.76□□□□□ -1.97
GIS2P53849 LRG1YDL240W 3054 nt2.76□□□□□ -1.97
GIS2P53849 AHC2YCR082W 387 nt2.76□□□□□ -1.97
GIS2P53849 YDL094CYDL094C 510 nt2.76□□□□□ -1.97
GIS2P53849 tC(GCA)BtC(GCA)B 72 nt2.76□□□□□ -1.97
GIS2P53849 tC(GCA)GtC(GCA)G 72 nt2.76□□□□□ -1.97
GIS2P53849 tC(GCA)P1tC(GCA)P1 72 nt2.76□□□□□ -1.97
GIS2P53849 tC(GCA)P2tC(GCA)P2 72 nt2.76□□□□□ -1.97
GIS2P53849 AHA1YDR214W 1053 nt2.76□□□□□ -1.97
GIS2P53849 RIM4YHL024W 2142 nt2.76□□□□□ -1.97
GIS2P53849 PIR1YKL164C 1026 nt2.76□□□□□ -1.97
GIS2P53849 YMR046W-AYMR046W-A 129 nt2.76□□□□□ -1.97 RIP-Chip
GIS2P53849 HHT2YNL031C 411 nt2.76□□□□□ -1.97
GIS2P53849 RPS11BYBR048W 471 nt2.76□□□□□ -1.97
GIS2P53849 YPL107WYPL107W 747 nt2.76□□□□□ -1.97
GIS2P53849 YPR039WYPR039W 336 nt2.76□□□□□ -1.97
GIS2P53849 YPR096CYPR096C 303 nt2.76□□□□□ -1.97
GIS2P53849 MBA1YBR185C 837 nt2.76□□□□□ -1.97
GIS2P53849 MNN4YKL201C 3537 nt2.76□□□□□ -1.97 RIP-Chip
GIS2P53849 PHO84YML123C 1764 nt2.76□□□□□ -1.97
GIS2P53849 YND1YER005W 1893 nt2.75□□□□□ -1.97
GIS2P53849 YCF1YDR135C 4548 nt2.75□□□□□ -1.97 RIP-Chip
GIS2P53849 LYS9YNR050C 1341 nt2.75□□□□□ -1.97
GIS2P53849 SEN1YLR430W 6696 nt2.75□□□□□ -1.97
GIS2P53849 YRB1YDR002W 606 nt2.75□□□□□ -1.97 RIP-Chip
GIS2P53849 YDR406W-AYDR406W-A 246 nt2.75□□□□□ -1.97
GIS2P53849 NBL1YHR199C-A 222 nt2.75□□□□□ -1.97
GIS2P53849 PFD1YJL179W 330 nt2.75□□□□□ -1.97
GIS2P53849 YKL068W-AYKL068W-A 237 nt2.75□□□□□ -1.97
GIS2P53849 YKL162C-AYKL162C-A 153 nt2.75□□□□□ -1.97
GIS2P53849 RDN5-1RDN5-1 121 nt2.75□□□□□ -1.97
GIS2P53849 RPL22AYLR061W 366 nt2.75□□□□□ -1.97
GIS2P53849 RDN5-6RDN5-6 121 nt2.75□□□□□ -1.97
GIS2P53849 PIN3YPR154W 648 nt2.75□□□□□ -1.97
GIS2P53849 SHG1YBR258C 429 nt2.75□□□□□ -1.97
GIS2P53849 PTA1YAL043C 2358 nt2.75□□□□□ -1.97
GIS2P53849 CDC48YDL126C 2508 nt2.75□□□□□ -1.97 RIP-Chip
GIS2P53849 PRP3YDR473C 1410 nt2.75□□□□□ -1.97
GIS2P53849 TIF4632YGL049C 2745 nt2.75□□□□□ -1.97
GIS2P53849 FUS2YMR232W 2034 nt2.75□□□□□ -1.97
GIS2P53849 PHO87YCR037C 2772 nt2.74□□□□□ -1.97
GIS2P53849 MSS4YDR208W 2340 nt2.74□□□□□ -1.97
GIS2P53849 LST4YKL176C 2487 nt2.74□□□□□ -1.97
GIS2P53849 RTS1YOR014W 2274 nt2.74□□□□□ -1.97
GIS2P53849 PPQ1YPL179W 1650 nt2.74□□□□□ -1.97
GIS2P53849 GNT1YOR320C 1476 nt2.74□□□□□ -1.97
GIS2P53849 snR80snR80 171 nt2.74□□□□□ -1.97
GIS2P53849 HOM2YDR158W 1098 nt2.74□□□□□ -1.97
GIS2P53849 SDH7YDR511W 402 nt2.74□□□□□ -1.97
GIS2P53849 PMI40YER003C 1290 nt2.74□□□□□ -1.97
GIS2P53849 YGR190CYGR190C 366 nt2.74□□□□□ -1.97
GIS2P53849 BIO2YGR286C 1128 nt2.74□□□□□ -1.97
GIS2P53849 PCL5YHR071W 690 nt2.74□□□□□ -1.97
GIS2P53849 YHR193C-AYHR193C-A 375 nt2.74□□□□□ -1.97
GIS2P53849 EFB1YAL003W 621 nt2.74□□□□□ -1.97
GIS2P53849 LSM8YJR022W 330 nt2.74□□□□□ -1.97
GIS2P53849 YKL033W-AYKL033W-A 711 nt2.74□□□□□ -1.97 RIP-Chip
GIS2P53849 YLR031WYLR031W 561 nt2.74□□□□□ -1.97
GIS2P53849 KIN4YOR233W 2403 nt2.74□□□□□ -1.97
GIS2P53849 THI7YLR237W 1797 nt2.74□□□□□ -1.97
GIS2P53849 TDA11YHR159W 1515 nt2.73□□□□□ -1.97
GIS2P53849 STE5YDR103W 2754 nt2.73□□□□□ -1.97
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