Protein–RNA interactions for Protein: O75164

KDM4A, Lysine-specific demethylase 4A, humanhuman

Predictions only

Length 1,064 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM4AO75164 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KDM4AO75164 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
KDM4AO75164 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KDM4AO75164 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KDM4AO75164 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KDM4AO75164 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
KDM4AO75164 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
KDM4AO75164 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
KDM4AO75164 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
KDM4AO75164 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
KDM4AO75164 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
KDM4AO75164 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
KDM4AO75164 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
KDM4AO75164 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
KDM4AO75164 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
KDM4AO75164 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
KDM4AO75164 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
KDM4AO75164 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KDM4AO75164 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KDM4AO75164 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KDM4AO75164 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KDM4AO75164 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KDM4AO75164 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KDM4AO75164 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KDM4AO75164 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KDM4AO75164 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KDM4AO75164 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KDM4AO75164 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KDM4AO75164 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KDM4AO75164 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KDM4AO75164 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KDM4AO75164 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KDM4AO75164 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KDM4AO75164 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
KDM4AO75164 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KDM4AO75164 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KDM4AO75164 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KDM4AO75164 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KDM4AO75164 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KDM4AO75164 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KDM4AO75164 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KDM4AO75164 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KDM4AO75164 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KDM4AO75164 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KDM4AO75164 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KDM4AO75164 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KDM4AO75164 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KDM4AO75164 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KDM4AO75164 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KDM4AO75164 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KDM4AO75164 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KDM4AO75164 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KDM4AO75164 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KDM4AO75164 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KDM4AO75164 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KDM4AO75164 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KDM4AO75164 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KDM4AO75164 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KDM4AO75164 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KDM4AO75164 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KDM4AO75164 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KDM4AO75164 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KDM4AO75164 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KDM4AO75164 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KDM4AO75164 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KDM4AO75164 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KDM4AO75164 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KDM4AO75164 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KDM4AO75164 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KDM4AO75164 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KDM4AO75164 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KDM4AO75164 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KDM4AO75164 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KDM4AO75164 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
KDM4AO75164 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KDM4AO75164 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KDM4AO75164 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KDM4AO75164 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KDM4AO75164 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KDM4AO75164 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KDM4AO75164 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KDM4AO75164 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KDM4AO75164 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KDM4AO75164 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KDM4AO75164 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KDM4AO75164 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KDM4AO75164 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KDM4AO75164 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
KDM4AO75164 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KDM4AO75164 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KDM4AO75164 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KDM4AO75164 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KDM4AO75164 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
KDM4AO75164 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KDM4AO75164 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KDM4AO75164 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KDM4AO75164 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KDM4AO75164 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KDM4AO75164 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KDM4AO75164 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms