Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NEDD8Q15843 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NEDD8Q15843 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NEDD8Q15843 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NEDD8Q15843 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NEDD8Q15843 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NEDD8Q15843 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NEDD8Q15843 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NEDD8Q15843 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NEDD8Q15843 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NEDD8Q15843 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
NEDD8Q15843 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
NEDD8Q15843 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
NEDD8Q15843 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
NEDD8Q15843 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NEDD8Q15843 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NEDD8Q15843 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NEDD8Q15843 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NEDD8Q15843 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NEDD8Q15843 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NEDD8Q15843 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NEDD8Q15843 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NEDD8Q15843 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NEDD8Q15843 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NEDD8Q15843 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NEDD8Q15843 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NEDD8Q15843 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NEDD8Q15843 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NEDD8Q15843 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NEDD8Q15843 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NEDD8Q15843 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NEDD8Q15843 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NEDD8Q15843 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NEDD8Q15843 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NEDD8Q15843 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NEDD8Q15843 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NEDD8Q15843 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NEDD8Q15843 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NEDD8Q15843 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NEDD8Q15843 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
NEDD8Q15843 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NEDD8Q15843 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NEDD8Q15843 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NEDD8Q15843 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NEDD8Q15843 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NEDD8Q15843 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NEDD8Q15843 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NEDD8Q15843 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NEDD8Q15843 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NEDD8Q15843 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NEDD8Q15843 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NEDD8Q15843 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NEDD8Q15843 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NEDD8Q15843 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NEDD8Q15843 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NEDD8Q15843 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NEDD8Q15843 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NEDD8Q15843 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NEDD8Q15843 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NEDD8Q15843 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NEDD8Q15843 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NEDD8Q15843 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NEDD8Q15843 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NEDD8Q15843 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NEDD8Q15843 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NEDD8Q15843 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NEDD8Q15843 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NEDD8Q15843 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NEDD8Q15843 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NEDD8Q15843 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NEDD8Q15843 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NEDD8Q15843 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NEDD8Q15843 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NEDD8Q15843 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NEDD8Q15843 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NEDD8Q15843 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NEDD8Q15843 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NEDD8Q15843 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NEDD8Q15843 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NEDD8Q15843 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NEDD8Q15843 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NEDD8Q15843 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NEDD8Q15843 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NEDD8Q15843 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NEDD8Q15843 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NEDD8Q15843 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NEDD8Q15843 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NEDD8Q15843 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NEDD8Q15843 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NEDD8Q15843 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NEDD8Q15843 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
NEDD8Q15843 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NEDD8Q15843 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NEDD8Q15843 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
NEDD8Q15843 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NEDD8Q15843 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NEDD8Q15843 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NEDD8Q15843 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NEDD8Q15843 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NEDD8Q15843 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
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