Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5F1

PCDHB12, Protocadherin beta-12, humanhuman

Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB12Q9Y5F1 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PCDHB12Q9Y5F1 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PCDHB12Q9Y5F1 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PCDHB12Q9Y5F1 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PCDHB12Q9Y5F1 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PCDHB12Q9Y5F1 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PCDHB12Q9Y5F1 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
PCDHB12Q9Y5F1 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PCDHB12Q9Y5F1 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
PCDHB12Q9Y5F1 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
PCDHB12Q9Y5F1 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PCDHB12Q9Y5F1 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PCDHB12Q9Y5F1 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PCDHB12Q9Y5F1 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PCDHB12Q9Y5F1 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PCDHB12Q9Y5F1 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PCDHB12Q9Y5F1 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PCDHB12Q9Y5F1 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PCDHB12Q9Y5F1 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PCDHB12Q9Y5F1 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PCDHB12Q9Y5F1 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PCDHB12Q9Y5F1 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PCDHB12Q9Y5F1 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PCDHB12Q9Y5F1 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PCDHB12Q9Y5F1 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PCDHB12Q9Y5F1 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
PCDHB12Q9Y5F1 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
PCDHB12Q9Y5F1 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PCDHB12Q9Y5F1 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PCDHB12Q9Y5F1 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PCDHB12Q9Y5F1 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PCDHB12Q9Y5F1 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PCDHB12Q9Y5F1 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PCDHB12Q9Y5F1 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PCDHB12Q9Y5F1 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PCDHB12Q9Y5F1 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PCDHB12Q9Y5F1 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
PCDHB12Q9Y5F1 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PCDHB12Q9Y5F1 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PCDHB12Q9Y5F1 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
PCDHB12Q9Y5F1 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PCDHB12Q9Y5F1 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PCDHB12Q9Y5F1 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PCDHB12Q9Y5F1 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PCDHB12Q9Y5F1 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PCDHB12Q9Y5F1 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
PCDHB12Q9Y5F1 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
PCDHB12Q9Y5F1 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
PCDHB12Q9Y5F1 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PCDHB12Q9Y5F1 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PCDHB12Q9Y5F1 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PCDHB12Q9Y5F1 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PCDHB12Q9Y5F1 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PCDHB12Q9Y5F1 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PCDHB12Q9Y5F1 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PCDHB12Q9Y5F1 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PCDHB12Q9Y5F1 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PCDHB12Q9Y5F1 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
PCDHB12Q9Y5F1 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PCDHB12Q9Y5F1 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PCDHB12Q9Y5F1 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PCDHB12Q9Y5F1 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PCDHB12Q9Y5F1 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PCDHB12Q9Y5F1 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PCDHB12Q9Y5F1 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PCDHB12Q9Y5F1 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PCDHB12Q9Y5F1 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PCDHB12Q9Y5F1 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PCDHB12Q9Y5F1 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
PCDHB12Q9Y5F1 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PCDHB12Q9Y5F1 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PCDHB12Q9Y5F1 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PCDHB12Q9Y5F1 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PCDHB12Q9Y5F1 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PCDHB12Q9Y5F1 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PCDHB12Q9Y5F1 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PCDHB12Q9Y5F1 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PCDHB12Q9Y5F1 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PCDHB12Q9Y5F1 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PCDHB12Q9Y5F1 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PCDHB12Q9Y5F1 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PCDHB12Q9Y5F1 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PCDHB12Q9Y5F1 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PCDHB12Q9Y5F1 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PCDHB12Q9Y5F1 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PCDHB12Q9Y5F1 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PCDHB12Q9Y5F1 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PCDHB12Q9Y5F1 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PCDHB12Q9Y5F1 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PCDHB12Q9Y5F1 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PCDHB12Q9Y5F1 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PCDHB12Q9Y5F1 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
PCDHB12Q9Y5F1 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PCDHB12Q9Y5F1 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PCDHB12Q9Y5F1 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PCDHB12Q9Y5F1 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PCDHB12Q9Y5F1 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PCDHB12Q9Y5F1 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PCDHB12Q9Y5F1 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PCDHB12Q9Y5F1 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms