Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4D8

HECTD4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HECTD4, humanhuman

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Length 3,996 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECTD4Q9Y4D8 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HECTD4Q9Y4D8 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HECTD4Q9Y4D8 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HECTD4Q9Y4D8 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HECTD4Q9Y4D8 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HECTD4Q9Y4D8 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HECTD4Q9Y4D8 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
HECTD4Q9Y4D8 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HECTD4Q9Y4D8 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HECTD4Q9Y4D8 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HECTD4Q9Y4D8 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HECTD4Q9Y4D8 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HECTD4Q9Y4D8 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HECTD4Q9Y4D8 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HECTD4Q9Y4D8 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HECTD4Q9Y4D8 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HECTD4Q9Y4D8 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HECTD4Q9Y4D8 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HECTD4Q9Y4D8 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
HECTD4Q9Y4D8 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HECTD4Q9Y4D8 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HECTD4Q9Y4D8 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HECTD4Q9Y4D8 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HECTD4Q9Y4D8 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HECTD4Q9Y4D8 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HECTD4Q9Y4D8 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HECTD4Q9Y4D8 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HECTD4Q9Y4D8 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HECTD4Q9Y4D8 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
HECTD4Q9Y4D8 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
HECTD4Q9Y4D8 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
HECTD4Q9Y4D8 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HECTD4Q9Y4D8 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HECTD4Q9Y4D8 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HECTD4Q9Y4D8 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HECTD4Q9Y4D8 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HECTD4Q9Y4D8 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HECTD4Q9Y4D8 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HECTD4Q9Y4D8 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HECTD4Q9Y4D8 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HECTD4Q9Y4D8 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HECTD4Q9Y4D8 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HECTD4Q9Y4D8 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
HECTD4Q9Y4D8 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
HECTD4Q9Y4D8 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HECTD4Q9Y4D8 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
HECTD4Q9Y4D8 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HECTD4Q9Y4D8 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HECTD4Q9Y4D8 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HECTD4Q9Y4D8 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HECTD4Q9Y4D8 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
HECTD4Q9Y4D8 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HECTD4Q9Y4D8 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
HECTD4Q9Y4D8 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
HECTD4Q9Y4D8 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
HECTD4Q9Y4D8 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
HECTD4Q9Y4D8 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
HECTD4Q9Y4D8 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
HECTD4Q9Y4D8 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
HECTD4Q9Y4D8 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
HECTD4Q9Y4D8 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HECTD4Q9Y4D8 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HECTD4Q9Y4D8 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HECTD4Q9Y4D8 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HECTD4Q9Y4D8 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HECTD4Q9Y4D8 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HECTD4Q9Y4D8 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HECTD4Q9Y4D8 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HECTD4Q9Y4D8 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HECTD4Q9Y4D8 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HECTD4Q9Y4D8 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HECTD4Q9Y4D8 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HECTD4Q9Y4D8 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HECTD4Q9Y4D8 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HECTD4Q9Y4D8 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HECTD4Q9Y4D8 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HECTD4Q9Y4D8 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HECTD4Q9Y4D8 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HECTD4Q9Y4D8 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HECTD4Q9Y4D8 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HECTD4Q9Y4D8 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HECTD4Q9Y4D8 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HECTD4Q9Y4D8 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HECTD4Q9Y4D8 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HECTD4Q9Y4D8 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HECTD4Q9Y4D8 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HECTD4Q9Y4D8 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HECTD4Q9Y4D8 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HECTD4Q9Y4D8 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HECTD4Q9Y4D8 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HECTD4Q9Y4D8 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HECTD4Q9Y4D8 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HECTD4Q9Y4D8 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HECTD4Q9Y4D8 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HECTD4Q9Y4D8 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HECTD4Q9Y4D8 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HECTD4Q9Y4D8 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HECTD4Q9Y4D8 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HECTD4Q9Y4D8 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HECTD4Q9Y4D8 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
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