Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKE5

TNIK, TRAF2 and NCK-interacting protein kinase, humanhuman

Predictions only

Length 1,360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIKQ9UKE5 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.07■■■■■ 4.65
TNIKQ9UKE5 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.06■■■■■ 4.64
TNIKQ9UKE5 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC44.06■■■■■ 4.64
TNIKQ9UKE5 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.06■■■■■ 4.64
TNIKQ9UKE5 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC44.06■■■■■ 4.64
TNIKQ9UKE5 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.05■■■■■ 4.64
TNIKQ9UKE5 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC44.05■■■■■ 4.64
TNIKQ9UKE5 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.03■■■■■ 4.64
TNIKQ9UKE5 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC44.03■■■■■ 4.64
TNIKQ9UKE5 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.02■■■■■ 4.64
TNIKQ9UKE5 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC44.02■■■■■ 4.64
TNIKQ9UKE5 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC44■■■■■ 4.63
TNIKQ9UKE5 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC43.99■■■■■ 4.63
TNIKQ9UKE5 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.98■■■■■ 4.63
TNIKQ9UKE5 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC43.97■■■■■ 4.63
TNIKQ9UKE5 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.95■■■■■ 4.63
TNIKQ9UKE5 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC43.94■■■■■ 4.63
TNIKQ9UKE5 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC43.94■■■■■ 4.62
TNIKQ9UKE5 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC43.93■■■■■ 4.62
TNIKQ9UKE5 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC43.93■■■■■ 4.62
TNIKQ9UKE5 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC43.92■■■■■ 4.62
TNIKQ9UKE5 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.9■■■■■ 4.62
TNIKQ9UKE5 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC43.9■■■■■ 4.62
TNIKQ9UKE5 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.88■■■■■ 4.62
TNIKQ9UKE5 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC43.88■■■■■ 4.62
TNIKQ9UKE5 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC43.88■■■■■ 4.61
TNIKQ9UKE5 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC43.87■■■■■ 4.61
TNIKQ9UKE5 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC43.86■■■■■ 4.61
TNIKQ9UKE5 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC43.85■■■■■ 4.61
TNIKQ9UKE5 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC43.84■■■■■ 4.61
TNIKQ9UKE5 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.83■■■■■ 4.61
TNIKQ9UKE5 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC43.82■■■■■ 4.61
TNIKQ9UKE5 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC43.82■■■■■ 4.61
TNIKQ9UKE5 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC43.81■■■■■ 4.6
TNIKQ9UKE5 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.81■■■■■ 4.6
TNIKQ9UKE5 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC43.8■■■■■ 4.6
TNIKQ9UKE5 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.78■■■■■ 4.6
TNIKQ9UKE5 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC43.77■■■■■ 4.6
TNIKQ9UKE5 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.76■■■■■ 4.6
TNIKQ9UKE5 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.75■■■■■ 4.59
TNIKQ9UKE5 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC43.75■■■■■ 4.59
TNIKQ9UKE5 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC43.75■■■■■ 4.59
TNIKQ9UKE5 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.75■■■■■ 4.59
TNIKQ9UKE5 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.74■■■■■ 4.59
TNIKQ9UKE5 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.73■■■■■ 4.59
TNIKQ9UKE5 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC43.73■■■■■ 4.59
TNIKQ9UKE5 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC43.73■■■■■ 4.59
TNIKQ9UKE5 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.72■■■■■ 4.59
TNIKQ9UKE5 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC43.72■■■■■ 4.59
TNIKQ9UKE5 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC43.72■■■■■ 4.59
TNIKQ9UKE5 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.7■■■■■ 4.59
TNIKQ9UKE5 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC43.69■■■■■ 4.59
TNIKQ9UKE5 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC43.67■■■■■ 4.58
TNIKQ9UKE5 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.67■■■■■ 4.58
TNIKQ9UKE5 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC43.67■■■■■ 4.58
TNIKQ9UKE5 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC43.66■■■■■ 4.58
TNIKQ9UKE5 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC43.64■■■■■ 4.58
TNIKQ9UKE5 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.62■■■■■ 4.57
TNIKQ9UKE5 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC43.62■■■■■ 4.57
TNIKQ9UKE5 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC43.61■■■■■ 4.57
TNIKQ9UKE5 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.6■■■■■ 4.57
TNIKQ9UKE5 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.6■■■■■ 4.57
TNIKQ9UKE5 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.59■■■■■ 4.57
TNIKQ9UKE5 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC43.58■■■■■ 4.57
TNIKQ9UKE5 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.58■■■■■ 4.57
TNIKQ9UKE5 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.58■■■■■ 4.57
TNIKQ9UKE5 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.56■■■■■ 4.56
TNIKQ9UKE5 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC43.56■■■■■ 4.56
TNIKQ9UKE5 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC43.56■■■■■ 4.56
TNIKQ9UKE5 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC43.56■■■■■ 4.56
TNIKQ9UKE5 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.56■■■■■ 4.56
TNIKQ9UKE5 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.55■■■■■ 4.56
TNIKQ9UKE5 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.55■■■■■ 4.56
TNIKQ9UKE5 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC43.55■■■■■ 4.56
TNIKQ9UKE5 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC43.54■■■■■ 4.56
TNIKQ9UKE5 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC43.54■■■■■ 4.56
TNIKQ9UKE5 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.53■■■■■ 4.56
TNIKQ9UKE5 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.52■■■■■ 4.56
TNIKQ9UKE5 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.52■■■■■ 4.56
TNIKQ9UKE5 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.51■■■■■ 4.56
TNIKQ9UKE5 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC43.5■■■■■ 4.55
TNIKQ9UKE5 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC43.49■■■■■ 4.55
TNIKQ9UKE5 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.48■■■■■ 4.55
TNIKQ9UKE5 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC43.48■■■■■ 4.55
TNIKQ9UKE5 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC43.48■■■■■ 4.55
TNIKQ9UKE5 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC43.48■■■■■ 4.55
TNIKQ9UKE5 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC43.48■■■■■ 4.55
TNIKQ9UKE5 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC43.48■■■■■ 4.55
TNIKQ9UKE5 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC43.48■■■■■ 4.55
TNIKQ9UKE5 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC43.47■■■■■ 4.55
TNIKQ9UKE5 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC43.47■■■■■ 4.55
TNIKQ9UKE5 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.46■■■■■ 4.55
TNIKQ9UKE5 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC43.45■■■■■ 4.55
TNIKQ9UKE5 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC43.43■■■■■ 4.54
TNIKQ9UKE5 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC43.41■■■■■ 4.54
TNIKQ9UKE5 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.4■■■■■ 4.54
TNIKQ9UKE5 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.4■■■■■ 4.54
TNIKQ9UKE5 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.4■■■■■ 4.54
TNIKQ9UKE5 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC43.39■■■■■ 4.54
TNIKQ9UKE5 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC43.38■■■■■ 4.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms