Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC9

NPC1L1, Niemann-Pick C1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPC1L1Q9UHC9 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
NPC1L1Q9UHC9 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
NPC1L1Q9UHC9 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC36.4■■■■□ 3.42
NPC1L1Q9UHC9 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC36.4■■■■□ 3.42
NPC1L1Q9UHC9 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
NPC1L1Q9UHC9 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
NPC1L1Q9UHC9 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
NPC1L1Q9UHC9 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC36.4■■■■□ 3.42
NPC1L1Q9UHC9 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC36.39■■■■□ 3.42
NPC1L1Q9UHC9 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
NPC1L1Q9UHC9 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
NPC1L1Q9UHC9 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC36.38■■■■□ 3.41
NPC1L1Q9UHC9 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
NPC1L1Q9UHC9 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.37■■■■□ 3.41
NPC1L1Q9UHC9 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
NPC1L1Q9UHC9 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.36■■■■□ 3.41
NPC1L1Q9UHC9 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC36.36■■■■□ 3.41
NPC1L1Q9UHC9 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.35■■■■□ 3.41
NPC1L1Q9UHC9 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
NPC1L1Q9UHC9 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC36.35■■■■□ 3.41
NPC1L1Q9UHC9 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
NPC1L1Q9UHC9 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
NPC1L1Q9UHC9 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.32■■■■□ 3.41
NPC1L1Q9UHC9 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC36.32■■■■□ 3.4
NPC1L1Q9UHC9 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
NPC1L1Q9UHC9 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
NPC1L1Q9UHC9 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC36.31■■■■□ 3.4
NPC1L1Q9UHC9 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
NPC1L1Q9UHC9 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC36.31■■■■□ 3.4
NPC1L1Q9UHC9 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
NPC1L1Q9UHC9 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
NPC1L1Q9UHC9 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC36.29■■■■□ 3.4
NPC1L1Q9UHC9 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC36.28■■■■□ 3.4
NPC1L1Q9UHC9 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
NPC1L1Q9UHC9 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC36.25■■■■□ 3.39
NPC1L1Q9UHC9 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
NPC1L1Q9UHC9 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
NPC1L1Q9UHC9 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
NPC1L1Q9UHC9 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
NPC1L1Q9UHC9 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
NPC1L1Q9UHC9 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
NPC1L1Q9UHC9 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC36.21■■■■□ 3.39
NPC1L1Q9UHC9 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
NPC1L1Q9UHC9 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
NPC1L1Q9UHC9 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.39
NPC1L1Q9UHC9 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC36.19■■■■□ 3.38
NPC1L1Q9UHC9 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC36.19■■■■□ 3.38
NPC1L1Q9UHC9 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC36.15■■■■□ 3.38
NPC1L1Q9UHC9 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
NPC1L1Q9UHC9 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
NPC1L1Q9UHC9 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
NPC1L1Q9UHC9 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
NPC1L1Q9UHC9 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
NPC1L1Q9UHC9 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC36.14■■■■□ 3.38
NPC1L1Q9UHC9 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.38
NPC1L1Q9UHC9 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC36.13■■■■□ 3.37
NPC1L1Q9UHC9 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
NPC1L1Q9UHC9 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
NPC1L1Q9UHC9 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
NPC1L1Q9UHC9 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
NPC1L1Q9UHC9 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
NPC1L1Q9UHC9 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
NPC1L1Q9UHC9 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
NPC1L1Q9UHC9 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
NPC1L1Q9UHC9 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37
NPC1L1Q9UHC9 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37
NPC1L1Q9UHC9 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC36.09■■■■□ 3.37
NPC1L1Q9UHC9 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
NPC1L1Q9UHC9 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC36.07■■■■□ 3.36
NPC1L1Q9UHC9 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
NPC1L1Q9UHC9 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
NPC1L1Q9UHC9 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.06■■■■□ 3.36
NPC1L1Q9UHC9 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
NPC1L1Q9UHC9 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.06■■■■□ 3.36
NPC1L1Q9UHC9 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
NPC1L1Q9UHC9 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC36.05■■■■□ 3.36
NPC1L1Q9UHC9 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
NPC1L1Q9UHC9 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
NPC1L1Q9UHC9 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
NPC1L1Q9UHC9 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
NPC1L1Q9UHC9 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
NPC1L1Q9UHC9 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC36.01■■■■□ 3.36
NPC1L1Q9UHC9 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC36.01■■■■□ 3.36
NPC1L1Q9UHC9 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
NPC1L1Q9UHC9 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
NPC1L1Q9UHC9 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.99■■■■□ 3.35
NPC1L1Q9UHC9 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
NPC1L1Q9UHC9 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
NPC1L1Q9UHC9 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
NPC1L1Q9UHC9 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
NPC1L1Q9UHC9 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC35.97■■■■□ 3.35
NPC1L1Q9UHC9 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC35.96■■■■□ 3.35
NPC1L1Q9UHC9 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
NPC1L1Q9UHC9 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
NPC1L1Q9UHC9 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
NPC1L1Q9UHC9 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC35.92■■■■□ 3.34
NPC1L1Q9UHC9 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
NPC1L1Q9UHC9 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
NPC1L1Q9UHC9 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC35.91■■■■□ 3.34
NPC1L1Q9UHC9 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.7 ms