Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGL1

KDM5B, Lysine-specific demethylase 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5BQ9UGL1 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC42.88■■■■■ 4.46
KDM5BQ9UGL1 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC42.88■■■■■ 4.45
KDM5BQ9UGL1 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.86■■■■■ 4.45
KDM5BQ9UGL1 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.85■■■■■ 4.45
KDM5BQ9UGL1 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.84■■■■■ 4.45
KDM5BQ9UGL1 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC42.83■■■■■ 4.45
KDM5BQ9UGL1 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC42.82■■■■■ 4.45
KDM5BQ9UGL1 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.81■■■■■ 4.44
KDM5BQ9UGL1 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC42.81■■■■■ 4.44
KDM5BQ9UGL1 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC42.8■■■■■ 4.44
KDM5BQ9UGL1 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC42.8■■■■■ 4.44
KDM5BQ9UGL1 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC42.79■■■■■ 4.44
KDM5BQ9UGL1 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.79■■■■■ 4.44
KDM5BQ9UGL1 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.78■■■■■ 4.44
KDM5BQ9UGL1 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.77■■■■■ 4.44
KDM5BQ9UGL1 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC42.76■■■■■ 4.44
KDM5BQ9UGL1 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.76■■■■■ 4.44
KDM5BQ9UGL1 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.76■■■■■ 4.44
KDM5BQ9UGL1 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC42.76■■■■■ 4.44
KDM5BQ9UGL1 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC42.74■■■■■ 4.43
KDM5BQ9UGL1 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC42.74■■■■■ 4.43
KDM5BQ9UGL1 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.73■■■■■ 4.43
KDM5BQ9UGL1 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.72■■■■■ 4.43
KDM5BQ9UGL1 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.71■■■■■ 4.43
KDM5BQ9UGL1 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC42.7■■■■■ 4.43
KDM5BQ9UGL1 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.7■■■■■ 4.43
KDM5BQ9UGL1 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC42.67■■■■■ 4.42
KDM5BQ9UGL1 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC42.67■■■■■ 4.42
KDM5BQ9UGL1 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC42.66■■■■■ 4.42
KDM5BQ9UGL1 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC42.65■■■■■ 4.42
KDM5BQ9UGL1 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC42.65■■■■■ 4.42
KDM5BQ9UGL1 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.63■■■■■ 4.42
KDM5BQ9UGL1 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC42.63■■■■■ 4.42
KDM5BQ9UGL1 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC42.62■■■■■ 4.41
KDM5BQ9UGL1 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.62■■■■■ 4.41
KDM5BQ9UGL1 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC42.62■■■■■ 4.41
KDM5BQ9UGL1 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC42.62■■■■■ 4.41
KDM5BQ9UGL1 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.61■■■■■ 4.41
KDM5BQ9UGL1 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC42.61■■■■■ 4.41
KDM5BQ9UGL1 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.6■■■■■ 4.41
KDM5BQ9UGL1 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.6■■■■■ 4.41
KDM5BQ9UGL1 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC42.6■■■■■ 4.41
KDM5BQ9UGL1 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.59■■■■■ 4.41
KDM5BQ9UGL1 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC42.59■■■■■ 4.41
KDM5BQ9UGL1 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC42.58■■■■■ 4.41
KDM5BQ9UGL1 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC42.57■■■■■ 4.41
KDM5BQ9UGL1 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.55■■■■■ 4.4
KDM5BQ9UGL1 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.55■■■■■ 4.4
KDM5BQ9UGL1 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.54■■■■■ 4.4
KDM5BQ9UGL1 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.54■■■■■ 4.4
KDM5BQ9UGL1 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.54■■■■■ 4.4
KDM5BQ9UGL1 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC42.53■■■■■ 4.4
KDM5BQ9UGL1 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC42.51■■■■■ 4.39
KDM5BQ9UGL1 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.5■■■■■ 4.39
KDM5BQ9UGL1 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.5■■■■■ 4.39
KDM5BQ9UGL1 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC42.5■■■■■ 4.39
KDM5BQ9UGL1 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.48■■■■■ 4.39
KDM5BQ9UGL1 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC42.48■■■■■ 4.39
KDM5BQ9UGL1 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.47■■■■■ 4.39
KDM5BQ9UGL1 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.47■■■■■ 4.39
KDM5BQ9UGL1 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC42.46■■■■■ 4.39
KDM5BQ9UGL1 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC42.46■■■■■ 4.39
KDM5BQ9UGL1 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC42.45■■■■■ 4.39
KDM5BQ9UGL1 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.45■■■■■ 4.39
KDM5BQ9UGL1 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC42.45■■■■■ 4.39
KDM5BQ9UGL1 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.42■■■■■ 4.38
KDM5BQ9UGL1 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC42.42■■■■■ 4.38
KDM5BQ9UGL1 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC42.42■■■■■ 4.38
KDM5BQ9UGL1 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC42.42■■■■■ 4.38
KDM5BQ9UGL1 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC42.42■■■■■ 4.38
KDM5BQ9UGL1 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC42.42■■■■■ 4.38
KDM5BQ9UGL1 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC42.42■■■■■ 4.38
KDM5BQ9UGL1 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC42.42■■■■■ 4.38
KDM5BQ9UGL1 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC42.42■■■■■ 4.38
KDM5BQ9UGL1 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC42.42■■■■■ 4.38
KDM5BQ9UGL1 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC42.42■■■■■ 4.38
KDM5BQ9UGL1 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC42.41■■■■■ 4.38
KDM5BQ9UGL1 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.41■■■■■ 4.38
KDM5BQ9UGL1 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC42.41■■■■■ 4.38
KDM5BQ9UGL1 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC42.4■■■■■ 4.38
KDM5BQ9UGL1 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.4■■■■■ 4.38
KDM5BQ9UGL1 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC42.39■■■■■ 4.38
KDM5BQ9UGL1 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.37■■■■■ 4.37
KDM5BQ9UGL1 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC42.35■■■■■ 4.37
KDM5BQ9UGL1 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC42.34■■■■■ 4.37
KDM5BQ9UGL1 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.31■■■■■ 4.36
KDM5BQ9UGL1 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC42.31■■■■■ 4.36
KDM5BQ9UGL1 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC42.3■■■■■ 4.36
KDM5BQ9UGL1 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC42.3■■■■■ 4.36
KDM5BQ9UGL1 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC42.27■■■■■ 4.36
KDM5BQ9UGL1 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.27■■■■■ 4.36
KDM5BQ9UGL1 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.27■■■■■ 4.36
KDM5BQ9UGL1 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.26■■■■■ 4.36
KDM5BQ9UGL1 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC42.26■■■■■ 4.36
KDM5BQ9UGL1 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC42.25■■■■■ 4.35
KDM5BQ9UGL1 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC42.25■■■■■ 4.35
KDM5BQ9UGL1 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC42.25■■■■■ 4.35
KDM5BQ9UGL1 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC42.25■■■■■ 4.35
KDM5BQ9UGL1 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC42.25■■■■■ 4.35
KDM5BQ9UGL1 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.24■■■■■ 4.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 187.2 ms