Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0L9

PKD2L1, Polycystic kidney disease 2-like 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 805 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2L1Q9P0L9 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
PKD2L1Q9P0L9 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC30.24■■■□□ 2.43
PKD2L1Q9P0L9 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
PKD2L1Q9P0L9 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
PKD2L1Q9P0L9 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
PKD2L1Q9P0L9 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
PKD2L1Q9P0L9 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
PKD2L1Q9P0L9 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
PKD2L1Q9P0L9 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
PKD2L1Q9P0L9 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
PKD2L1Q9P0L9 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
PKD2L1Q9P0L9 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.42
PKD2L1Q9P0L9 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
PKD2L1Q9P0L9 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
PKD2L1Q9P0L9 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
PKD2L1Q9P0L9 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
PKD2L1Q9P0L9 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PKD2L1Q9P0L9 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PKD2L1Q9P0L9 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC30.17■■■□□ 2.42
PKD2L1Q9P0L9 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
PKD2L1Q9P0L9 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
PKD2L1Q9P0L9 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
PKD2L1Q9P0L9 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
PKD2L1Q9P0L9 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
PKD2L1Q9P0L9 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
PKD2L1Q9P0L9 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
PKD2L1Q9P0L9 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
PKD2L1Q9P0L9 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
PKD2L1Q9P0L9 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC30.1■■■□□ 2.41
PKD2L1Q9P0L9 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
PKD2L1Q9P0L9 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PKD2L1Q9P0L9 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PKD2L1Q9P0L9 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
PKD2L1Q9P0L9 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
PKD2L1Q9P0L9 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
PKD2L1Q9P0L9 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
PKD2L1Q9P0L9 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
PKD2L1Q9P0L9 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
PKD2L1Q9P0L9 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
PKD2L1Q9P0L9 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
PKD2L1Q9P0L9 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
PKD2L1Q9P0L9 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
PKD2L1Q9P0L9 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
PKD2L1Q9P0L9 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
PKD2L1Q9P0L9 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
PKD2L1Q9P0L9 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
PKD2L1Q9P0L9 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PKD2L1Q9P0L9 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
PKD2L1Q9P0L9 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
PKD2L1Q9P0L9 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC30.04■■■□□ 2.4
PKD2L1Q9P0L9 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
PKD2L1Q9P0L9 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
PKD2L1Q9P0L9 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC30.02■■■□□ 2.4
PKD2L1Q9P0L9 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
PKD2L1Q9P0L9 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
PKD2L1Q9P0L9 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC30.01■■■□□ 2.39
PKD2L1Q9P0L9 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
PKD2L1Q9P0L9 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
PKD2L1Q9P0L9 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
PKD2L1Q9P0L9 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
PKD2L1Q9P0L9 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
PKD2L1Q9P0L9 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
PKD2L1Q9P0L9 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
PKD2L1Q9P0L9 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PKD2L1Q9P0L9 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PKD2L1Q9P0L9 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PKD2L1Q9P0L9 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
PKD2L1Q9P0L9 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PKD2L1Q9P0L9 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
PKD2L1Q9P0L9 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
PKD2L1Q9P0L9 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
PKD2L1Q9P0L9 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
PKD2L1Q9P0L9 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
PKD2L1Q9P0L9 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
PKD2L1Q9P0L9 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PKD2L1Q9P0L9 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PKD2L1Q9P0L9 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PKD2L1Q9P0L9 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
PKD2L1Q9P0L9 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
PKD2L1Q9P0L9 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PKD2L1Q9P0L9 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PKD2L1Q9P0L9 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PKD2L1Q9P0L9 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC29.93■■■□□ 2.38
PKD2L1Q9P0L9 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PKD2L1Q9P0L9 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PKD2L1Q9P0L9 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
PKD2L1Q9P0L9 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PKD2L1Q9P0L9 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
PKD2L1Q9P0L9 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
PKD2L1Q9P0L9 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
PKD2L1Q9P0L9 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PKD2L1Q9P0L9 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PKD2L1Q9P0L9 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PKD2L1Q9P0L9 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PKD2L1Q9P0L9 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
PKD2L1Q9P0L9 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
PKD2L1Q9P0L9 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
PKD2L1Q9P0L9 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PKD2L1Q9P0L9 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
PKD2L1Q9P0L9 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms