Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUL5

RYDEN, Repressor of yield of DENV protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYDENQ9NUL5 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RYDENQ9NUL5 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RYDENQ9NUL5 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RYDENQ9NUL5 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RYDENQ9NUL5 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RYDENQ9NUL5 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RYDENQ9NUL5 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RYDENQ9NUL5 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RYDENQ9NUL5 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RYDENQ9NUL5 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RYDENQ9NUL5 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
RYDENQ9NUL5 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RYDENQ9NUL5 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RYDENQ9NUL5 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RYDENQ9NUL5 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RYDENQ9NUL5 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RYDENQ9NUL5 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RYDENQ9NUL5 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RYDENQ9NUL5 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RYDENQ9NUL5 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RYDENQ9NUL5 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RYDENQ9NUL5 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RYDENQ9NUL5 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RYDENQ9NUL5 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RYDENQ9NUL5 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RYDENQ9NUL5 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RYDENQ9NUL5 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RYDENQ9NUL5 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RYDENQ9NUL5 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RYDENQ9NUL5 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RYDENQ9NUL5 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RYDENQ9NUL5 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RYDENQ9NUL5 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RYDENQ9NUL5 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RYDENQ9NUL5 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RYDENQ9NUL5 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RYDENQ9NUL5 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RYDENQ9NUL5 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RYDENQ9NUL5 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RYDENQ9NUL5 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RYDENQ9NUL5 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RYDENQ9NUL5 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RYDENQ9NUL5 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
RYDENQ9NUL5 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RYDENQ9NUL5 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RYDENQ9NUL5 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RYDENQ9NUL5 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RYDENQ9NUL5 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RYDENQ9NUL5 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RYDENQ9NUL5 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RYDENQ9NUL5 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RYDENQ9NUL5 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RYDENQ9NUL5 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RYDENQ9NUL5 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RYDENQ9NUL5 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RYDENQ9NUL5 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RYDENQ9NUL5 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RYDENQ9NUL5 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RYDENQ9NUL5 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RYDENQ9NUL5 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RYDENQ9NUL5 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RYDENQ9NUL5 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RYDENQ9NUL5 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RYDENQ9NUL5 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RYDENQ9NUL5 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RYDENQ9NUL5 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RYDENQ9NUL5 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RYDENQ9NUL5 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RYDENQ9NUL5 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RYDENQ9NUL5 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RYDENQ9NUL5 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RYDENQ9NUL5 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RYDENQ9NUL5 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RYDENQ9NUL5 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RYDENQ9NUL5 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RYDENQ9NUL5 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RYDENQ9NUL5 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RYDENQ9NUL5 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RYDENQ9NUL5 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RYDENQ9NUL5 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
RYDENQ9NUL5 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RYDENQ9NUL5 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
RYDENQ9NUL5 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
RYDENQ9NUL5 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RYDENQ9NUL5 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RYDENQ9NUL5 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RYDENQ9NUL5 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RYDENQ9NUL5 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RYDENQ9NUL5 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RYDENQ9NUL5 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RYDENQ9NUL5 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RYDENQ9NUL5 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RYDENQ9NUL5 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
RYDENQ9NUL5 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RYDENQ9NUL5 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RYDENQ9NUL5 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RYDENQ9NUL5 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RYDENQ9NUL5 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RYDENQ9NUL5 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RYDENQ9NUL5 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms