Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG4

PCDH12, Protocadherin-12, humanhuman

Predictions only

Length 1,184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDH12Q9NPG4 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
PCDH12Q9NPG4 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PCDH12Q9NPG4 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PCDH12Q9NPG4 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
PCDH12Q9NPG4 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PCDH12Q9NPG4 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PCDH12Q9NPG4 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PCDH12Q9NPG4 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PCDH12Q9NPG4 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PCDH12Q9NPG4 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PCDH12Q9NPG4 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PCDH12Q9NPG4 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PCDH12Q9NPG4 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PCDH12Q9NPG4 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PCDH12Q9NPG4 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PCDH12Q9NPG4 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PCDH12Q9NPG4 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PCDH12Q9NPG4 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PCDH12Q9NPG4 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PCDH12Q9NPG4 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PCDH12Q9NPG4 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PCDH12Q9NPG4 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PCDH12Q9NPG4 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PCDH12Q9NPG4 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PCDH12Q9NPG4 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PCDH12Q9NPG4 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
PCDH12Q9NPG4 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PCDH12Q9NPG4 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PCDH12Q9NPG4 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PCDH12Q9NPG4 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PCDH12Q9NPG4 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PCDH12Q9NPG4 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PCDH12Q9NPG4 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PCDH12Q9NPG4 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PCDH12Q9NPG4 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PCDH12Q9NPG4 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PCDH12Q9NPG4 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PCDH12Q9NPG4 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PCDH12Q9NPG4 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PCDH12Q9NPG4 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PCDH12Q9NPG4 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PCDH12Q9NPG4 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PCDH12Q9NPG4 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PCDH12Q9NPG4 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PCDH12Q9NPG4 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PCDH12Q9NPG4 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PCDH12Q9NPG4 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PCDH12Q9NPG4 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PCDH12Q9NPG4 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PCDH12Q9NPG4 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PCDH12Q9NPG4 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PCDH12Q9NPG4 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PCDH12Q9NPG4 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PCDH12Q9NPG4 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PCDH12Q9NPG4 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PCDH12Q9NPG4 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PCDH12Q9NPG4 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PCDH12Q9NPG4 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PCDH12Q9NPG4 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PCDH12Q9NPG4 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PCDH12Q9NPG4 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PCDH12Q9NPG4 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PCDH12Q9NPG4 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PCDH12Q9NPG4 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
PCDH12Q9NPG4 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PCDH12Q9NPG4 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PCDH12Q9NPG4 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PCDH12Q9NPG4 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PCDH12Q9NPG4 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PCDH12Q9NPG4 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PCDH12Q9NPG4 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PCDH12Q9NPG4 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PCDH12Q9NPG4 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PCDH12Q9NPG4 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PCDH12Q9NPG4 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PCDH12Q9NPG4 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PCDH12Q9NPG4 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PCDH12Q9NPG4 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PCDH12Q9NPG4 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PCDH12Q9NPG4 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PCDH12Q9NPG4 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PCDH12Q9NPG4 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PCDH12Q9NPG4 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PCDH12Q9NPG4 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PCDH12Q9NPG4 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PCDH12Q9NPG4 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PCDH12Q9NPG4 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
PCDH12Q9NPG4 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PCDH12Q9NPG4 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PCDH12Q9NPG4 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PCDH12Q9NPG4 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
PCDH12Q9NPG4 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PCDH12Q9NPG4 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PCDH12Q9NPG4 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PCDH12Q9NPG4 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PCDH12Q9NPG4 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PCDH12Q9NPG4 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PCDH12Q9NPG4 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PCDH12Q9NPG4 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PCDH12Q9NPG4 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms