Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6U6

BCAS3, Breast carcinoma-amplified sequence 3, humanhuman

Predictions only

Length 928 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCAS3Q9H6U6 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC30.3■■■□□ 2.44
BCAS3Q9H6U6 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
BCAS3Q9H6U6 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
BCAS3Q9H6U6 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
BCAS3Q9H6U6 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
BCAS3Q9H6U6 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC30.27■■■□□ 2.44
BCAS3Q9H6U6 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
BCAS3Q9H6U6 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
BCAS3Q9H6U6 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
BCAS3Q9H6U6 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
BCAS3Q9H6U6 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC30.25■■■□□ 2.43
BCAS3Q9H6U6 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
BCAS3Q9H6U6 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
BCAS3Q9H6U6 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
BCAS3Q9H6U6 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
BCAS3Q9H6U6 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
BCAS3Q9H6U6 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC30.24■■■□□ 2.43
BCAS3Q9H6U6 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
BCAS3Q9H6U6 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
BCAS3Q9H6U6 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
BCAS3Q9H6U6 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
BCAS3Q9H6U6 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
BCAS3Q9H6U6 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
BCAS3Q9H6U6 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
BCAS3Q9H6U6 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
BCAS3Q9H6U6 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
BCAS3Q9H6U6 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
BCAS3Q9H6U6 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
BCAS3Q9H6U6 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
BCAS3Q9H6U6 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
BCAS3Q9H6U6 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
BCAS3Q9H6U6 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
BCAS3Q9H6U6 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
BCAS3Q9H6U6 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
BCAS3Q9H6U6 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC30.15■■■□□ 2.42
BCAS3Q9H6U6 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
BCAS3Q9H6U6 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
BCAS3Q9H6U6 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
BCAS3Q9H6U6 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
BCAS3Q9H6U6 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
BCAS3Q9H6U6 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
BCAS3Q9H6U6 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
BCAS3Q9H6U6 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
BCAS3Q9H6U6 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
BCAS3Q9H6U6 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
BCAS3Q9H6U6 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
BCAS3Q9H6U6 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
BCAS3Q9H6U6 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
BCAS3Q9H6U6 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
BCAS3Q9H6U6 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
BCAS3Q9H6U6 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
BCAS3Q9H6U6 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
BCAS3Q9H6U6 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
BCAS3Q9H6U6 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC30.08■■■□□ 2.41
BCAS3Q9H6U6 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
BCAS3Q9H6U6 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
BCAS3Q9H6U6 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
BCAS3Q9H6U6 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
BCAS3Q9H6U6 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
BCAS3Q9H6U6 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
BCAS3Q9H6U6 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
BCAS3Q9H6U6 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
BCAS3Q9H6U6 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
BCAS3Q9H6U6 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
BCAS3Q9H6U6 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
BCAS3Q9H6U6 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC30.04■■■□□ 2.4
BCAS3Q9H6U6 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
BCAS3Q9H6U6 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
BCAS3Q9H6U6 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
BCAS3Q9H6U6 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
BCAS3Q9H6U6 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
BCAS3Q9H6U6 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
BCAS3Q9H6U6 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
BCAS3Q9H6U6 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
BCAS3Q9H6U6 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
BCAS3Q9H6U6 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
BCAS3Q9H6U6 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC29.99■■■□□ 2.39
BCAS3Q9H6U6 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
BCAS3Q9H6U6 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
BCAS3Q9H6U6 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
BCAS3Q9H6U6 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
BCAS3Q9H6U6 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
BCAS3Q9H6U6 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
BCAS3Q9H6U6 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
BCAS3Q9H6U6 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
BCAS3Q9H6U6 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
BCAS3Q9H6U6 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
BCAS3Q9H6U6 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
BCAS3Q9H6U6 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC29.96■■■□□ 2.39
BCAS3Q9H6U6 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
BCAS3Q9H6U6 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
BCAS3Q9H6U6 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
BCAS3Q9H6U6 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
BCAS3Q9H6U6 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
BCAS3Q9H6U6 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
BCAS3Q9H6U6 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
BCAS3Q9H6U6 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
BCAS3Q9H6U6 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
BCAS3Q9H6U6 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
BCAS3Q9H6U6 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms