Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2L5

RASSF4, Ras association domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASSF4Q9H2L5 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RASSF4Q9H2L5 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RASSF4Q9H2L5 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RASSF4Q9H2L5 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RASSF4Q9H2L5 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RASSF4Q9H2L5 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RASSF4Q9H2L5 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RASSF4Q9H2L5 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RASSF4Q9H2L5 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RASSF4Q9H2L5 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RASSF4Q9H2L5 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RASSF4Q9H2L5 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RASSF4Q9H2L5 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RASSF4Q9H2L5 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RASSF4Q9H2L5 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RASSF4Q9H2L5 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RASSF4Q9H2L5 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RASSF4Q9H2L5 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RASSF4Q9H2L5 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RASSF4Q9H2L5 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RASSF4Q9H2L5 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RASSF4Q9H2L5 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RASSF4Q9H2L5 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RASSF4Q9H2L5 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RASSF4Q9H2L5 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RASSF4Q9H2L5 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RASSF4Q9H2L5 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RASSF4Q9H2L5 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RASSF4Q9H2L5 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RASSF4Q9H2L5 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RASSF4Q9H2L5 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RASSF4Q9H2L5 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RASSF4Q9H2L5 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
RASSF4Q9H2L5 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RASSF4Q9H2L5 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RASSF4Q9H2L5 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RASSF4Q9H2L5 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RASSF4Q9H2L5 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RASSF4Q9H2L5 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RASSF4Q9H2L5 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RASSF4Q9H2L5 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RASSF4Q9H2L5 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RASSF4Q9H2L5 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RASSF4Q9H2L5 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RASSF4Q9H2L5 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RASSF4Q9H2L5 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RASSF4Q9H2L5 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RASSF4Q9H2L5 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
RASSF4Q9H2L5 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RASSF4Q9H2L5 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RASSF4Q9H2L5 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RASSF4Q9H2L5 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RASSF4Q9H2L5 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RASSF4Q9H2L5 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RASSF4Q9H2L5 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RASSF4Q9H2L5 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RASSF4Q9H2L5 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RASSF4Q9H2L5 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RASSF4Q9H2L5 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RASSF4Q9H2L5 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RASSF4Q9H2L5 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RASSF4Q9H2L5 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RASSF4Q9H2L5 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RASSF4Q9H2L5 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RASSF4Q9H2L5 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RASSF4Q9H2L5 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RASSF4Q9H2L5 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RASSF4Q9H2L5 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RASSF4Q9H2L5 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RASSF4Q9H2L5 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RASSF4Q9H2L5 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RASSF4Q9H2L5 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RASSF4Q9H2L5 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RASSF4Q9H2L5 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RASSF4Q9H2L5 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RASSF4Q9H2L5 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RASSF4Q9H2L5 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RASSF4Q9H2L5 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RASSF4Q9H2L5 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RASSF4Q9H2L5 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RASSF4Q9H2L5 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RASSF4Q9H2L5 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RASSF4Q9H2L5 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
RASSF4Q9H2L5 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
RASSF4Q9H2L5 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RASSF4Q9H2L5 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RASSF4Q9H2L5 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RASSF4Q9H2L5 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RASSF4Q9H2L5 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RASSF4Q9H2L5 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RASSF4Q9H2L5 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RASSF4Q9H2L5 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RASSF4Q9H2L5 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RASSF4Q9H2L5 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RASSF4Q9H2L5 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RASSF4Q9H2L5 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RASSF4Q9H2L5 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RASSF4Q9H2L5 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RASSF4Q9H2L5 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RASSF4Q9H2L5 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms