Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZ95

NSD3, Histone-lysine N-methyltransferase NSD3, humanhuman

Predictions only

Length 1,437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSD3Q9BZ95 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
NSD3Q9BZ95 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.65■■■■□ 3.46
NSD3Q9BZ95 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC36.65■■■■□ 3.46
NSD3Q9BZ95 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.64■■■■□ 3.46
NSD3Q9BZ95 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
NSD3Q9BZ95 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC36.64■■■■□ 3.46
NSD3Q9BZ95 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC36.63■■■■□ 3.45
NSD3Q9BZ95 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
NSD3Q9BZ95 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC36.62■■■■□ 3.45
NSD3Q9BZ95 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
NSD3Q9BZ95 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC36.59■■■■□ 3.45
NSD3Q9BZ95 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
NSD3Q9BZ95 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.45
NSD3Q9BZ95 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
NSD3Q9BZ95 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
NSD3Q9BZ95 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC36.57■■■■□ 3.44
NSD3Q9BZ95 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
NSD3Q9BZ95 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
NSD3Q9BZ95 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
NSD3Q9BZ95 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
NSD3Q9BZ95 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC36.56■■■■□ 3.44
NSD3Q9BZ95 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.56■■■■□ 3.44
NSD3Q9BZ95 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
NSD3Q9BZ95 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
NSD3Q9BZ95 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
NSD3Q9BZ95 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.54■■■■□ 3.44
NSD3Q9BZ95 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
NSD3Q9BZ95 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
NSD3Q9BZ95 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC36.53■■■■□ 3.44
NSD3Q9BZ95 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
NSD3Q9BZ95 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
NSD3Q9BZ95 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.51■■■■□ 3.43
NSD3Q9BZ95 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
NSD3Q9BZ95 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
NSD3Q9BZ95 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC36.48■■■■□ 3.43
NSD3Q9BZ95 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
NSD3Q9BZ95 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
NSD3Q9BZ95 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
NSD3Q9BZ95 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC36.46■■■■□ 3.43
NSD3Q9BZ95 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC36.45■■■■□ 3.43
NSD3Q9BZ95 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
NSD3Q9BZ95 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
NSD3Q9BZ95 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
NSD3Q9BZ95 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
NSD3Q9BZ95 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC36.43■■■■□ 3.42
NSD3Q9BZ95 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.43■■■■□ 3.42
NSD3Q9BZ95 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.43■■■■□ 3.42
NSD3Q9BZ95 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC36.43■■■■□ 3.42
NSD3Q9BZ95 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
NSD3Q9BZ95 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
NSD3Q9BZ95 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
NSD3Q9BZ95 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
NSD3Q9BZ95 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC36.42■■■■□ 3.42
NSD3Q9BZ95 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
NSD3Q9BZ95 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
NSD3Q9BZ95 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.41■■■■□ 3.42
NSD3Q9BZ95 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.41■■■■□ 3.42
NSD3Q9BZ95 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC36.4■■■■□ 3.42
NSD3Q9BZ95 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC36.4■■■■□ 3.42
NSD3Q9BZ95 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.39■■■■□ 3.42
NSD3Q9BZ95 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC36.39■■■■□ 3.42
NSD3Q9BZ95 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC36.38■■■■□ 3.41
NSD3Q9BZ95 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
NSD3Q9BZ95 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
NSD3Q9BZ95 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC36.36■■■■□ 3.41
NSD3Q9BZ95 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC36.35■■■■□ 3.41
NSD3Q9BZ95 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
NSD3Q9BZ95 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
NSD3Q9BZ95 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC36.34■■■■□ 3.41
NSD3Q9BZ95 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC36.34■■■■□ 3.41
NSD3Q9BZ95 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
NSD3Q9BZ95 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC36.34■■■■□ 3.41
NSD3Q9BZ95 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
NSD3Q9BZ95 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
NSD3Q9BZ95 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC36.33■■■■□ 3.41
NSD3Q9BZ95 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
NSD3Q9BZ95 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
NSD3Q9BZ95 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
NSD3Q9BZ95 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.4
NSD3Q9BZ95 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
NSD3Q9BZ95 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC36.3■■■■□ 3.4
NSD3Q9BZ95 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
NSD3Q9BZ95 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
NSD3Q9BZ95 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
NSD3Q9BZ95 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC36.28■■■■□ 3.4
NSD3Q9BZ95 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC36.28■■■■□ 3.4
NSD3Q9BZ95 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
NSD3Q9BZ95 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
NSD3Q9BZ95 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
NSD3Q9BZ95 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC36.27■■■■□ 3.4
NSD3Q9BZ95 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
NSD3Q9BZ95 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
NSD3Q9BZ95 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
NSD3Q9BZ95 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC36.24■■■■□ 3.39
NSD3Q9BZ95 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
NSD3Q9BZ95 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
NSD3Q9BZ95 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC36.24■■■■□ 3.39
NSD3Q9BZ95 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC36.23■■■■□ 3.39
NSD3Q9BZ95 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
NSD3Q9BZ95 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC36.22■■■■□ 3.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms