Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWQ6

YIPF2, Protein YIPF2, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YIPF2Q9BWQ6 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
YIPF2Q9BWQ6 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
YIPF2Q9BWQ6 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
YIPF2Q9BWQ6 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
YIPF2Q9BWQ6 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
YIPF2Q9BWQ6 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
YIPF2Q9BWQ6 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
YIPF2Q9BWQ6 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
YIPF2Q9BWQ6 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
YIPF2Q9BWQ6 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
YIPF2Q9BWQ6 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
YIPF2Q9BWQ6 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
YIPF2Q9BWQ6 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
YIPF2Q9BWQ6 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
YIPF2Q9BWQ6 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
YIPF2Q9BWQ6 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
YIPF2Q9BWQ6 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
YIPF2Q9BWQ6 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
YIPF2Q9BWQ6 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
YIPF2Q9BWQ6 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
YIPF2Q9BWQ6 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
YIPF2Q9BWQ6 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
YIPF2Q9BWQ6 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
YIPF2Q9BWQ6 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
YIPF2Q9BWQ6 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
YIPF2Q9BWQ6 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
YIPF2Q9BWQ6 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
YIPF2Q9BWQ6 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
YIPF2Q9BWQ6 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
YIPF2Q9BWQ6 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
YIPF2Q9BWQ6 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
YIPF2Q9BWQ6 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
YIPF2Q9BWQ6 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
YIPF2Q9BWQ6 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
YIPF2Q9BWQ6 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
YIPF2Q9BWQ6 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
YIPF2Q9BWQ6 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
YIPF2Q9BWQ6 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
YIPF2Q9BWQ6 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
YIPF2Q9BWQ6 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
YIPF2Q9BWQ6 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
YIPF2Q9BWQ6 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
YIPF2Q9BWQ6 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
YIPF2Q9BWQ6 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
YIPF2Q9BWQ6 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
YIPF2Q9BWQ6 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
YIPF2Q9BWQ6 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
YIPF2Q9BWQ6 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
YIPF2Q9BWQ6 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
YIPF2Q9BWQ6 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
YIPF2Q9BWQ6 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
YIPF2Q9BWQ6 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
YIPF2Q9BWQ6 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
YIPF2Q9BWQ6 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
YIPF2Q9BWQ6 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
YIPF2Q9BWQ6 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
YIPF2Q9BWQ6 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
YIPF2Q9BWQ6 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
YIPF2Q9BWQ6 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
YIPF2Q9BWQ6 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
YIPF2Q9BWQ6 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
YIPF2Q9BWQ6 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
YIPF2Q9BWQ6 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
YIPF2Q9BWQ6 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
YIPF2Q9BWQ6 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
YIPF2Q9BWQ6 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
YIPF2Q9BWQ6 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
YIPF2Q9BWQ6 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
YIPF2Q9BWQ6 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
YIPF2Q9BWQ6 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
YIPF2Q9BWQ6 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
YIPF2Q9BWQ6 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
YIPF2Q9BWQ6 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
YIPF2Q9BWQ6 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
YIPF2Q9BWQ6 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
YIPF2Q9BWQ6 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
YIPF2Q9BWQ6 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
YIPF2Q9BWQ6 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
YIPF2Q9BWQ6 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
YIPF2Q9BWQ6 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
YIPF2Q9BWQ6 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
YIPF2Q9BWQ6 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
YIPF2Q9BWQ6 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
YIPF2Q9BWQ6 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
YIPF2Q9BWQ6 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
YIPF2Q9BWQ6 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
YIPF2Q9BWQ6 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
YIPF2Q9BWQ6 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
YIPF2Q9BWQ6 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
YIPF2Q9BWQ6 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
YIPF2Q9BWQ6 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
YIPF2Q9BWQ6 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
YIPF2Q9BWQ6 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
YIPF2Q9BWQ6 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
YIPF2Q9BWQ6 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
YIPF2Q9BWQ6 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
YIPF2Q9BWQ6 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
YIPF2Q9BWQ6 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
YIPF2Q9BWQ6 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
YIPF2Q9BWQ6 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms