Protein–RNA interactions for Protein: Q96MT4

LINC01600, Uncharacterized protein encoded by LINC01600, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01600Q96MT4 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LINC01600Q96MT4 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LINC01600Q96MT4 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LINC01600Q96MT4 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LINC01600Q96MT4 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LINC01600Q96MT4 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LINC01600Q96MT4 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
LINC01600Q96MT4 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LINC01600Q96MT4 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LINC01600Q96MT4 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LINC01600Q96MT4 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LINC01600Q96MT4 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LINC01600Q96MT4 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LINC01600Q96MT4 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LINC01600Q96MT4 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LINC01600Q96MT4 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LINC01600Q96MT4 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
LINC01600Q96MT4 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LINC01600Q96MT4 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LINC01600Q96MT4 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LINC01600Q96MT4 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LINC01600Q96MT4 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LINC01600Q96MT4 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LINC01600Q96MT4 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LINC01600Q96MT4 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LINC01600Q96MT4 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LINC01600Q96MT4 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LINC01600Q96MT4 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LINC01600Q96MT4 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LINC01600Q96MT4 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LINC01600Q96MT4 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LINC01600Q96MT4 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LINC01600Q96MT4 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LINC01600Q96MT4 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
LINC01600Q96MT4 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
LINC01600Q96MT4 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LINC01600Q96MT4 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LINC01600Q96MT4 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LINC01600Q96MT4 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LINC01600Q96MT4 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LINC01600Q96MT4 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LINC01600Q96MT4 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC01600Q96MT4 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC01600Q96MT4 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LINC01600Q96MT4 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LINC01600Q96MT4 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LINC01600Q96MT4 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LINC01600Q96MT4 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LINC01600Q96MT4 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LINC01600Q96MT4 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LINC01600Q96MT4 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LINC01600Q96MT4 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LINC01600Q96MT4 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LINC01600Q96MT4 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LINC01600Q96MT4 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LINC01600Q96MT4 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LINC01600Q96MT4 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LINC01600Q96MT4 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LINC01600Q96MT4 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LINC01600Q96MT4 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
LINC01600Q96MT4 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
LINC01600Q96MT4 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
LINC01600Q96MT4 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINC01600Q96MT4 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
LINC01600Q96MT4 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINC01600Q96MT4 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC01600Q96MT4 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC01600Q96MT4 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC01600Q96MT4 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC01600Q96MT4 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC01600Q96MT4 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC01600Q96MT4 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC01600Q96MT4 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC01600Q96MT4 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC01600Q96MT4 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC01600Q96MT4 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC01600Q96MT4 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC01600Q96MT4 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC01600Q96MT4 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC01600Q96MT4 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC01600Q96MT4 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LINC01600Q96MT4 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC01600Q96MT4 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC01600Q96MT4 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC01600Q96MT4 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC01600Q96MT4 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC01600Q96MT4 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC01600Q96MT4 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC01600Q96MT4 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC01600Q96MT4 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC01600Q96MT4 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC01600Q96MT4 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC01600Q96MT4 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC01600Q96MT4 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC01600Q96MT4 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC01600Q96MT4 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC01600Q96MT4 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LINC01600Q96MT4 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LINC01600Q96MT4 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LINC01600Q96MT4 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms