Protein–RNA interactions for Protein: Q969Z0

TBRG4, Protein TBRG4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 631 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBRG4Q969Z0 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.729e-7■■■■■ 113.4
TBRG4Q969Z0 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.649e-7■■■■■ 113.4
TBRG4Q969Z0 CHST11-204ENST00000549016 573 ntTSL 411.33□□□□□ -0.69e-7■■■■■ 113.4
TBRG4Q969Z0 CRIM1-203ENST00000426856 667 ntTSL 314.67□□□□□ -0.066e-7■■■■■ 112.5
TBRG4Q969Z0 MPRIP-202ENST00000341712 3846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.226e-7■■■■■ 112.5
TBRG4Q969Z0 MPRIP-205ENST00000395811 10960 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.416e-7■■■■■ 112.5
TBRG4Q969Z0 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.322e-8■■■■■ 111.1
TBRG4Q969Z0 FAM53B-203ENST00000392754 3557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.282e-8■■■■■ 111.1
TBRG4Q969Z0 LINC01749-201ENST00000606208 943 ntTSL 1 (best)14.47□□□□□ -0.097e-14■■■■■ 110
TBRG4Q969Z0 LINC01749-202ENST00000607802 3408 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.357e-14■■■■■ 110
TBRG4Q969Z0 ZNF107-204ENST00000423627 5773 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.977e-14■■■■■ 110
TBRG4Q969Z0 ZNF107-202ENST00000360117 1061 ntTSL 1 (best)7.95□□□□□ -1.147e-14■■■■■ 110
TBRG4Q969Z0 ZNF107-206ENST00000620827 5685 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC7.92□□□□□ -1.147e-14■■■■■ 110
TBRG4Q969Z0 ZNF107-201ENST00000344930 5174 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.417e-14■■■■■ 110
TBRG4Q969Z0 ZNF107-205ENST00000613690 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.497e-14■■■■■ 110
TBRG4Q969Z0 ZNF782-202ENST00000430274 562 ntTSL 326.59■■□□□ 1.857e-13■■■■■ 109.8
TBRG4Q969Z0 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.487e-13■■■■■ 109.8
TBRG4Q969Z0 ZNF782-204ENST00000478850 932 ntTSL 523.78■■□□□ 1.47e-13■■■■■ 109.8
TBRG4Q969Z0 SIMC1-211ENST00000514128 697 ntTSL 223.72■■□□□ 1.397e-13■■■■■ 109.8
TBRG4Q969Z0 SIMC1-210ENST00000508769 461 ntTSL 322.64■■□□□ 1.217e-13■■■■■ 109.8
TBRG4Q969Z0 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.27e-13■■■■■ 109.8
TBRG4Q969Z0 SIMC1-208ENST00000495423 913 ntTSL 222.27■■□□□ 1.167e-13■■■■■ 109.8
TBRG4Q969Z0 SIMC1-206ENST00000467472 364 ntTSL 522.27■■□□□ 1.167e-13■■■■■ 109.8
TBRG4Q969Z0 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.137e-13■■■■■ 109.8
TBRG4Q969Z0 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.077e-13■■■■■ 109.8
TBRG4Q969Z0 GAB2-206ENST00000530915 567 ntTSL 421.57■■□□□ 1.047e-13■■■■■ 109.8
TBRG4Q969Z0 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.787e-13■■■■■ 109.8
TBRG4Q969Z0 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.777e-13■■■■■ 109.8
TBRG4Q969Z0 GAB2-203ENST00000526030 650 ntTSL 319.83■□□□□ 0.777e-13■■■■■ 109.8
TBRG4Q969Z0 GAB2-207ENST00000534823 568 ntTSL 319.31■□□□□ 0.687e-13■■■■■ 109.8
TBRG4Q969Z0 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.687e-13■■■■■ 109.8
TBRG4Q969Z0 ARHGEF28-208ENST00000509848 560 ntTSL 419.21■□□□□ 0.677e-13■■■■■ 109.8
TBRG4Q969Z0 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.417e-13■■■■■ 109.8
TBRG4Q969Z0 JPT2-213ENST00000569256 911 ntTSL 1 (best)17.61■□□□□ 0.417e-13■■■■■ 109.8
TBRG4Q969Z0 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.357e-13■■■■■ 109.8
TBRG4Q969Z0 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.37e-13■■■■■ 109.8
TBRG4Q969Z0 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.37e-13■■■■■ 109.8
TBRG4Q969Z0 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.277e-13■■■■■ 109.8
TBRG4Q969Z0 EDC3-216ENST00000569561 658 ntTSL 516.21■□□□□ 0.197e-13■■■■■ 109.8
TBRG4Q969Z0 JPT2-209ENST00000566742 593 ntTSL 415.91■□□□□ 0.147e-13■■■■■ 109.8
TBRG4Q969Z0 NSD3-210ENST00000529223 1032 ntTSL 515.63■□□□□ 0.097e-13■■■■■ 109.8
TBRG4Q969Z0 EDC3-206ENST00000563009 967 ntTSL 315.04■□□□□ -07e-13■■■■■ 109.8
TBRG4Q969Z0 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.067e-13■■■■■ 109.8
TBRG4Q969Z0 GAB2-202ENST00000361507 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.17e-13■■■■■ 109.8
TBRG4Q969Z0 ANKRD36-204ENST00000461153 6102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.127e-13■■■■■ 109.8
TBRG4Q969Z0 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.147e-13■■■■■ 109.8
TBRG4Q969Z0 JPT2-214ENST00000569765 782 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.177e-13■■■■■ 109.8
TBRG4Q969Z0 GZF1-202ENST00000377051 4740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.217e-13■■■■■ 109.8
TBRG4Q969Z0 DEDD-202ENST00000368006 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.277e-13■■■■■ 109.8
TBRG4Q969Z0 CSNK1G1-205ENST00000607537 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.297e-13■■■■■ 109.8
TBRG4Q969Z0 GZF1-201ENST00000338121 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.297e-13■■■■■ 109.8
TBRG4Q969Z0 DEDD-208ENST00000486041 1068 ntTSL 313.23□□□□□ -0.297e-13■■■■■ 109.8
TBRG4Q969Z0 CSNK1G1-209ENST00000634811 2592 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.317e-13■■■■■ 109.8
TBRG4Q969Z0 DEDD-205ENST00000464113 964 ntTSL 313.04□□□□□ -0.327e-13■■■■■ 109.8
TBRG4Q969Z0 ANKRD36-201ENST00000420699 6269 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.367e-13■■■■■ 109.8
TBRG4Q969Z0 DEDD-203ENST00000458050 2300 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.427e-13■■■■■ 109.8
TBRG4Q969Z0 JPT2-206ENST00000562684 3185 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.437e-13■■■■■ 109.8
TBRG4Q969Z0 DEDD-211ENST00000496632 875 ntTSL 312.15□□□□□ -0.467e-13■■■■■ 109.8
TBRG4Q969Z0 JPT2-201ENST00000248098 3718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.517e-13■■■■■ 109.8
TBRG4Q969Z0 ZNF782-203ENST00000466833 628 ntTSL 311.79□□□□□ -0.527e-13■■■■■ 109.8
TBRG4Q969Z0 DEDD-210ENST00000490843 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.547e-13■■■■■ 109.8
TBRG4Q969Z0 CRTC3-203ENST00000558005 570 ntTSL 411.63□□□□□ -0.557e-13■■■■■ 109.8
TBRG4Q969Z0 CRTC3-213ENST00000561255 520 ntTSL 511.61□□□□□ -0.557e-13■■■■■ 109.8
TBRG4Q969Z0 JPT2-202ENST00000382710 962 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.577e-13■■■■■ 109.8
TBRG4Q969Z0 ANKRD36-206ENST00000620383 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.67e-13■■■■■ 109.8
TBRG4Q969Z0 CSNK1G1-207ENST00000634654 2485 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.617e-13■■■■■ 109.8
TBRG4Q969Z0 CSNK1G1-203ENST00000606225 1950 ntTSL 1 (best)11.25□□□□□ -0.617e-13■■■■■ 109.8
TBRG4Q969Z0 ARID1B-225ENST00000637532 445 ntTSL 511.24□□□□□ -0.617e-13■■■■■ 109.8
TBRG4Q969Z0 DEDD-204ENST00000463227 954 ntTSL 211.13□□□□□ -0.637e-13■■■■■ 109.8
TBRG4Q969Z0 ARID1B-209ENST00000494260 696 ntTSL 311.09□□□□□ -0.637e-13■■■■■ 109.8
TBRG4Q969Z0 GZF1-204ENST00000461789 675 ntTSL 311.03□□□□□ -0.647e-13■■■■■ 109.8
TBRG4Q969Z0 ZNF782-207ENST00000498811 698 ntTSL 310.57□□□□□ -0.727e-13■■■■■ 109.8
TBRG4Q969Z0 AL133367.1-201ENST00000568177 4063 ntBASIC10.55□□□□□ -0.727e-13■■■■■ 109.8
TBRG4Q969Z0 DEDD-201ENST00000368005 1256 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.767e-13■■■■■ 109.8
TBRG4Q969Z0 CSNK1G1-211ENST00000635142 5548 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.777e-13■■■■■ 109.8
TBRG4Q969Z0 CSNK1G1-201ENST00000303052 8179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.87e-13■■■■■ 109.8
TBRG4Q969Z0 DEDD-207ENST00000473679 869 ntTSL 39.75□□□□□ -0.857e-13■■■■■ 109.8
TBRG4Q969Z0 ARID1B-218ENST00000636748 8853 ntTSL 29.66□□□□□ -0.867e-13■■■■■ 109.8
TBRG4Q969Z0 GAB2-205ENST00000528886 543 ntTSL 49.24□□□□□ -0.937e-13■■■■■ 109.8
TBRG4Q969Z0 LZTFL1-206ENST00000448111 1376 ntTSL 28.89□□□□□ -0.997e-13■■■■■ 109.8
TBRG4Q969Z0 ZDHHC14-201ENST00000340347 328 ntTSL 58.78□□□□□ -17e-13■■■■■ 109.8
TBRG4Q969Z0 CRTC3-211ENST00000561119 630 ntTSL 58.78□□□□□ -17e-13■■■■■ 109.8
TBRG4Q969Z0 LZTFL1-203ENST00000418700 2014 ntTSL 28.73□□□□□ -1.017e-13■■■■■ 109.8
TBRG4Q969Z0 ARID1B-235ENST00000638000 1401 ntTSL 58.48□□□□□ -1.057e-13■■■■■ 109.8
TBRG4Q969Z0 CSNK1G1-206ENST00000634302 712 ntTSL 58.34□□□□□ -1.077e-13■■■■■ 109.8
TBRG4Q969Z0 CSGALNACT1-209ENST00000522573 405 ntTSL 58.16□□□□□ -1.11e-7■■■■■ 109.8
TBRG4Q969Z0 ARID1B-217ENST00000636607 406 ntTSL 37.07□□□□□ -1.287e-13■■■■■ 109.8
TBRG4Q969Z0 ARID1B-213ENST00000636205 824 ntTSL 26.89□□□□□ -1.317e-13■■■■■ 109.8
TBRG4Q969Z0 NSD3-206ENST00000527502 4471 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.337e-13■■■■■ 109.8
TBRG4Q969Z0 CSNK1G1-202ENST00000561349 1756 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.347e-13■■■■■ 109.8
TBRG4Q969Z0 JPT2-205ENST00000562569 458 ntTSL 36.44□□□□□ -1.387e-13■■■■■ 109.8
TBRG4Q969Z0 LZTFL1-208ENST00000472635 558 ntTSL 46.3□□□□□ -1.47e-13■■■■■ 109.8
TBRG4Q969Z0 AC087632.1-201ENST00000634251 1973 ntTSL 1 (best)6.07□□□□□ -1.447e-13■■■■■ 109.8
TBRG4Q969Z0 LZTFL1-215ENST00000536047 4342 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.447e-13■■■■■ 109.8
TBRG4Q969Z0 CSNK1G1-204ENST00000606793 1658 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.457e-13■■■■■ 109.8
TBRG4Q969Z0 DEDD-209ENST00000489249 1116 ntTSL 25.8□□□□□ -1.487e-13■■■■■ 109.8
TBRG4Q969Z0 AC087632.1-202ENST00000634847 1821 ntTSL 55.39□□□□□ -1.557e-13■■■■■ 109.8
TBRG4Q969Z0 ZNF782-208ENST00000535338 3296 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.567e-13■■■■■ 109.8
TBRG4Q969Z0 ZNF782-201ENST00000289032 2355 ntTSL 25.21□□□□□ -1.577e-13■■■■■ 109.8
TBRG4Q969Z0 LZTFL1-213ENST00000492333 537 ntTSL 44.75□□□□□ -1.657e-13■■■■■ 109.8
Retrieved 100 of 20,769 protein–RNA pairs in 573.6 ms