RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467472.1

SIMC1-206, Transcript of SUMO interacting motifs containing 1, humanhuman

TSL 5

Gene SIMC1, Length 364 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIMC1-206ENST00000467472 NISCHQ9Y2I1 1504 aa58.68■■■■■ 6.98
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SIMC1-206ENST00000467472 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa50.51■■■■■ 5.68
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SIMC1-206ENST00000467472 NACADO15069 1562 aa50.09■■■■■ 5.61
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SIMC1-206ENST00000467472 DCAF8L2P0C7V8 631 aa49.45■■■■■ 5.51
SIMC1-206ENST00000467472 MYO15BQ96JP2 1530 aa49.31■■■■■ 5.48
SIMC1-206ENST00000467472 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP49.31■■■■■ 5.48
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SIMC1-206ENST00000467472 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa48.42■■■■■ 5.34
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SIMC1-206ENST00000467472 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa48.07■■■■■ 5.29
SIMC1-206ENST00000467472 CECR2Q9BXF3 1484 aa47.93■■■■■ 5.26
SIMC1-206ENST00000467472 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP47.88■■■■■ 5.25
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SIMC1-206ENST00000467472 SMARCA4P51532 1647 aa45.9■■■■■ 4.94
SIMC1-206ENST00000467472 ERCC6Q03468 1493 aa45.9■■■■■ 4.94
SIMC1-206ENST00000467472 SMARCA2P51531 1590 aa45.88■■■■■ 4.94
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SIMC1-206ENST00000467472 PEG3Q9GZU2 1588 aa45.51■■■■■ 4.88
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SIMC1-206ENST00000467472 MROH2BQ7Z745 1585 aa45.18■■■■■ 4.82
SIMC1-206ENST00000467472 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa45.09■■■■■ 4.81
SIMC1-206ENST00000467472 PDS5BQ9NTI5 1447 aa44.93■■■■■ 4.78
SIMC1-206ENST00000467472 CADPSQ9ULU8 1353 aa44.72■■■■■ 4.75
SIMC1-206ENST00000467472 WIZO95785 1651 aa44.67■■■■■ 4.74
SIMC1-206ENST00000467472 MRC2Q9UBG0 1479 aa44.59■■■■■ 4.73
SIMC1-206ENST00000467472 WDR62O43379 1518 aa44.55■■■■■ 4.72
SIMC1-206ENST00000467472 CEP164Q9UPV0 1460 aa44.34■■■■■ 4.69
SIMC1-206ENST00000467472 FANCD2Q9BXW9 1451 aa44.23■■■■■ 4.67
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SIMC1-206ENST00000467472 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP43.92■■■■■ 4.62
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SIMC1-206ENST00000467472 OSCARQ8IYS5 282 aa43.76■■■■■ 4.6
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SIMC1-206ENST00000467472 IFT140Q96RY7 1462 aa43.46■■■■■ 4.55
SIMC1-206ENST00000467472 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP43.41■■■■■ 4.54
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SIMC1-206ENST00000467472 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa43.37■■■■■ 4.53
SIMC1-206ENST00000467472 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa43.37■■■■■ 4.53
SIMC1-206ENST00000467472 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa43.37■■■■■ 4.53
SIMC1-206ENST00000467472 ABCC8Q09428 1581 aa43.29■■■■■ 4.52
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SIMC1-206ENST00000467472 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa42.7■■■■■ 4.43
SIMC1-206ENST00000467472 ARAP1Q96P48 1450 aa42.68■■■■■ 4.42
SIMC1-206ENST00000467472 WDR97A6NE52 1622 aa42.68■■■■■ 4.42
SIMC1-206ENST00000467472 SOGA1O94964 1423 aa42.64■■■■■ 4.42
SIMC1-206ENST00000467472 FBLN2P98095 1184 aa42.63■■■■■ 4.41
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SIMC1-206ENST00000467472 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa42.52■■■■■ 4.4
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SIMC1-206ENST00000467472 GRIN2BQ13224 1484 aa42.36■■■■■ 4.37
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SIMC1-206ENST00000467472 SYNJ2O15056 1496 aa42.29■■■■■ 4.36
SIMC1-206ENST00000467472 GAPVD1Q14C86 1478 aa42.16■■■■■ 4.34
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SIMC1-206ENST00000467472 ERCC6L2Q5T890 1561 aa41.75■■■■■ 4.27
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SIMC1-206ENST00000467472 NUP160Q12769 1436 aa41.72■■■■■ 4.27
SIMC1-206ENST00000467472 SHROOM2Q13796 1616 aa41.67■■■■■ 4.26
SIMC1-206ENST00000467472 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP41.67■■■■■ 4.26
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SIMC1-206ENST00000467472 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP41.4■■■■■ 4.22
SIMC1-206ENST00000467472 KIF13AQ9H1H9 1805 aa41.37■■■■■ 4.21
SIMC1-206ENST00000467472 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP41.28■■■■■ 4.2
SIMC1-206ENST00000467472 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa41.24■■■■■ 4.19
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