RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509848.5

ARHGEF28-208, Transcript of Rho guanine nucleotide exchange factor 28, humanhuman

TSL 4

Gene ARHGEF28, Length 560 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF28-208ENST00000509848 NISCHQ9Y2I1 1504 aa49.28■■■■■ 5.48
ARHGEF28-208ENST00000509848 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa43.96■■■■■ 4.63
ARHGEF28-208ENST00000509848 ABCC9O60706 1549 aa43.94■■■■■ 4.63
ARHGEF28-208ENST00000509848 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa41.8■■■■■ 4.28
ARHGEF28-208ENST00000509848 DCAF8L2P0C7V8 631 aa41.7■■■■■ 4.27
ARHGEF28-208ENST00000509848 NACADO15069 1562 aa41.57■■■■■ 4.25
ARHGEF28-208ENST00000509848 DNAJC5BQ9UF47 199 aa41.07■■■■■ 4.17
ARHGEF28-208ENST00000509848 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP41.05■■■■■ 4.16
ARHGEF28-208ENST00000509848 MYO15BQ96JP2 1530 aa41.03■■■■■ 4.16
ARHGEF28-208ENST00000509848 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP40.87■■■■■ 4.13
ARHGEF28-208ENST00000509848 UNC13AQ9UPW8 1703 aa40.81■■■■■ 4.12
ARHGEF28-208ENST00000509848 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa40.62■■■■■ 4.09
ARHGEF28-208ENST00000509848 BICRAQ9NZM4 1560 aa40.62■■■■■ 4.09
ARHGEF28-208ENST00000509848 SCRIBQ14160 1630 aa40.24■■■■■ 4.03
ARHGEF28-208ENST00000509848 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa39.95■■■■□ 3.99
ARHGEF28-208ENST00000509848 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa39.62■■■■□ 3.93
ARHGEF28-208ENST00000509848 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP39.59■■■■□ 3.93
ARHGEF28-208ENST00000509848 CECR2Q9BXF3 1484 aa39.51■■■■□ 3.92
ARHGEF28-208ENST00000509848 NCAPD3P42695 1498 aa38.42■■■■□ 3.74
ARHGEF28-208ENST00000509848 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa38.37■■■■□ 3.73
ARHGEF28-208ENST00000509848 SMARCA4P51532 1647 aa38.35■■■■□ 3.73
ARHGEF28-208ENST00000509848 SMARCA2P51531 1590 aa38.21■■■■□ 3.71
ARHGEF28-208ENST00000509848 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP38.19■■■■□ 3.7
ARHGEF28-208ENST00000509848 HMGXB3Q12766 1538 aa38.1■■■■□ 3.69
ARHGEF28-208ENST00000509848 MROH2BQ7Z745 1585 aa38.02■■■■□ 3.68
ARHGEF28-208ENST00000509848 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP38.01■■■■□ 3.67
ARHGEF28-208ENST00000509848 PEG3Q9GZU2 1588 aa37.92■■■■□ 3.66
ARHGEF28-208ENST00000509848 ERCC6Q03468 1493 aa37.88■■■■□ 3.65
ARHGEF28-208ENST00000509848 NESP48681 1621 aa37.83■■■■□ 3.65
ARHGEF28-208ENST00000509848 CUX2O14529 1486 aa37.64■■■■□ 3.62
ARHGEF28-208ENST00000509848 WIZO95785 1651 aa37.56■■■■□ 3.6
ARHGEF28-208ENST00000509848 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa37.46■■■■□ 3.59
ARHGEF28-208ENST00000509848 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa37.44■■■■□ 3.58
ARHGEF28-208ENST00000509848 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP37.34■■■■□ 3.57
ARHGEF28-208ENST00000509848 CADPSQ9ULU8 1353 aa37.31■■■■□ 3.56
ARHGEF28-208ENST00000509848 PDS5BQ9NTI5 1447 aa37.3■■■■□ 3.56
ARHGEF28-208ENST00000509848 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP37.27■■■■□ 3.56
ARHGEF28-208ENST00000509848 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa37.23■■■■□ 3.55
ARHGEF28-208ENST00000509848 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP37.05■■■■□ 3.52
ARHGEF28-208ENST00000509848 MRC2Q9UBG0 1479 aa36.96■■■■□ 3.51
ARHGEF28-208ENST00000509848 CFTRP13569 1480 aa36.91■■■■□ 3.5
ARHGEF28-208ENST00000509848 FANCD2Q9BXW9 1451 aa36.88■■■■□ 3.5
ARHGEF28-208ENST00000509848 CEP164Q9UPV0 1460 aa36.88■■■■□ 3.49
ARHGEF28-208ENST00000509848 WDR62O43379 1518 aa36.83■■■■□ 3.49
ARHGEF28-208ENST00000509848 CCDC88BA6NC98 1476 aa36.71■■■■□ 3.47
ARHGEF28-208ENST00000509848 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP36.57■■■■□ 3.44
ARHGEF28-208ENST00000509848 PRDM2Q13029 1718 aa36.4■■■■□ 3.42
ARHGEF28-208ENST00000509848 TOPBP1Q92547 1522 aa36.2■■■■□ 3.39
ARHGEF28-208ENST00000509848 IFT140Q96RY7 1462 aa36.11■■■■□ 3.37
ARHGEF28-208ENST00000509848 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP36.11■■■■□ 3.37
ARHGEF28-208ENST00000509848 OSCARQ8IYS5 282 aa36.08■■■■□ 3.37
ARHGEF28-208ENST00000509848 ABCC8Q09428 1581 aa36.07■■■■□ 3.37
ARHGEF28-208ENST00000509848 DNMBPQ6XZF7 1577 aa36.05■■■■□ 3.36
ARHGEF28-208ENST00000509848 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP36.03■■■■□ 3.36
ARHGEF28-208ENST00000509848 TRIM41Q8WV44 630 aa36.01■■■■□ 3.36
ARHGEF28-208ENST00000509848 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP35.86■■■■□ 3.33
ARHGEF28-208ENST00000509848 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP35.84■■■■□ 3.33
ARHGEF28-208ENST00000509848 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP35.83■■■■□ 3.33
ARHGEF28-208ENST00000509848 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP35.83■■■■□ 3.33
ARHGEF28-208ENST00000509848 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa35.79■■■■□ 3.32
ARHGEF28-208ENST00000509848 SOGA1O94964 1423 aa35.74■■■■□ 3.31
ARHGEF28-208ENST00000509848 CUX1P39880 1505 aa35.7■■■■□ 3.31
ARHGEF28-208ENST00000509848 FGD5Q6ZNL6 1462 aa35.68■■■■□ 3.3
ARHGEF28-208ENST00000509848 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP35.68■■■■□ 3.3
ARHGEF28-208ENST00000509848 FBLN2P98095 1184 aa35.61■■■■□ 3.29
ARHGEF28-208ENST00000509848 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa35.5■■■■□ 3.27
ARHGEF28-208ENST00000509848 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa35.5■■■■□ 3.27
ARHGEF28-208ENST00000509848 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa35.5■■■■□ 3.27
ARHGEF28-208ENST00000509848 CHD1O14646 1710 aa35.5■■■■□ 3.27
ARHGEF28-208ENST00000509848 ARHGEF11O15085 1522 aa35.44■■■■□ 3.26
ARHGEF28-208ENST00000509848 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa35.43■■■■□ 3.26
ARHGEF28-208ENST00000509848 WDR97A6NE52 1622 aa35.36■■■■□ 3.25
ARHGEF28-208ENST00000509848 GRIN2BQ13224 1484 aa35.35■■■■□ 3.25
ARHGEF28-208ENST00000509848 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP35.34■■■■□ 3.25
ARHGEF28-208ENST00000509848 CYB5RLQ6IPT4 315 aa35.29■■■■□ 3.24
ARHGEF28-208ENST00000509848 GAPVD1Q14C86 1478 aa35.28■■■■□ 3.24
ARHGEF28-208ENST00000509848 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP35.28■■■■□ 3.24
ARHGEF28-208ENST00000509848 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa35.25■■■■□ 3.23
ARHGEF28-208ENST00000509848 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP35.2■■■■□ 3.23
ARHGEF28-208ENST00000509848 SYNJ2O15056 1496 aa35.19■■■■□ 3.22
ARHGEF28-208ENST00000509848 PBRM1Q86U86 1689 aa35.15■■■■□ 3.22
ARHGEF28-208ENST00000509848 SYNJ1O43426 1573 aa35.15■■■■□ 3.22
ARHGEF28-208ENST00000509848 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa35.14■■■■□ 3.22
ARHGEF28-208ENST00000509848 ARAP1Q96P48 1450 aa35.13■■■■□ 3.21
ARHGEF28-208ENST00000509848 TOP2BQ02880 1626 aa35.13■■■■□ 3.21
ARHGEF28-208ENST00000509848 CLASP1Q7Z460 1538 aa35.11■■■■□ 3.21
ARHGEF28-208ENST00000509848 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa35.1■■■■□ 3.21
ARHGEF28-208ENST00000509848 GRIN2AQ12879 1464 aa34.89■■■■□ 3.18
ARHGEF28-208ENST00000509848 ADAMTS12P58397 1594 aa34.87■■■■□ 3.17
ARHGEF28-208ENST00000509848 FHAD1B1AJZ9 1412 aa34.82■■■■□ 3.17
ARHGEF28-208ENST00000509848 TRHP20396 242 aaPredicted RBP34.82■■■■□ 3.16
ARHGEF28-208ENST00000509848 ERICH3Q5RHP9 1530 aa34.78■■■■□ 3.16
ARHGEF28-208ENST00000509848 CEP170Q5SW79 1584 aa34.76■■■■□ 3.16
ARHGEF28-208ENST00000509848 NUP160Q12769 1436 aa34.76■■■■□ 3.16
ARHGEF28-208ENST00000509848 ERCC6L2Q5T890 1561 aa34.68■■■■□ 3.14
ARHGEF28-208ENST00000509848 IGF1RP08069 1367 aa34.51■■■■□ 3.12
ARHGEF28-208ENST00000509848 SHROOM2Q13796 1616 aa34.51■■■■□ 3.11
ARHGEF28-208ENST00000509848 KIF27Q86VH2 1401 aa34.5■■■■□ 3.11
ARHGEF28-208ENST00000509848 JPH4Q96JJ6 628 aa34.5■■■■□ 3.11
ARHGEF28-208ENST00000509848 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP34.46■■■■□ 3.11
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