Protein–RNA interactions for Protein: Q92858

ATOH1, Protein atonal homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATOH1Q92858 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ATOH1Q92858 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
ATOH1Q92858 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ATOH1Q92858 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ATOH1Q92858 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
ATOH1Q92858 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ATOH1Q92858 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ATOH1Q92858 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ATOH1Q92858 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ATOH1Q92858 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ATOH1Q92858 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ATOH1Q92858 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
ATOH1Q92858 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ATOH1Q92858 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ATOH1Q92858 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ATOH1Q92858 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ATOH1Q92858 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ATOH1Q92858 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ATOH1Q92858 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ATOH1Q92858 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ATOH1Q92858 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ATOH1Q92858 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ATOH1Q92858 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ATOH1Q92858 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ATOH1Q92858 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ATOH1Q92858 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ATOH1Q92858 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ATOH1Q92858 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ATOH1Q92858 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ATOH1Q92858 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ATOH1Q92858 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ATOH1Q92858 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ATOH1Q92858 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ATOH1Q92858 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ATOH1Q92858 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ATOH1Q92858 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ATOH1Q92858 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ATOH1Q92858 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ATOH1Q92858 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ATOH1Q92858 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATOH1Q92858 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATOH1Q92858 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
ATOH1Q92858 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATOH1Q92858 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATOH1Q92858 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATOH1Q92858 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATOH1Q92858 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATOH1Q92858 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATOH1Q92858 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATOH1Q92858 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATOH1Q92858 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATOH1Q92858 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ATOH1Q92858 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
ATOH1Q92858 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ATOH1Q92858 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ATOH1Q92858 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ATOH1Q92858 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ATOH1Q92858 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
ATOH1Q92858 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ATOH1Q92858 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ATOH1Q92858 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ATOH1Q92858 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
ATOH1Q92858 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
ATOH1Q92858 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
ATOH1Q92858 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
ATOH1Q92858 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
ATOH1Q92858 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
ATOH1Q92858 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
ATOH1Q92858 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
ATOH1Q92858 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
ATOH1Q92858 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ATOH1Q92858 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATOH1Q92858 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ATOH1Q92858 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ATOH1Q92858 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ATOH1Q92858 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ATOH1Q92858 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ATOH1Q92858 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ATOH1Q92858 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ATOH1Q92858 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ATOH1Q92858 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
ATOH1Q92858 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ATOH1Q92858 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATOH1Q92858 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATOH1Q92858 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ATOH1Q92858 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ATOH1Q92858 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATOH1Q92858 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
ATOH1Q92858 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATOH1Q92858 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATOH1Q92858 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ATOH1Q92858 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ATOH1Q92858 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
ATOH1Q92858 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
ATOH1Q92858 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ATOH1Q92858 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ATOH1Q92858 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ATOH1Q92858 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ATOH1Q92858 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ATOH1Q92858 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms