Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCL9

APCDD1L, Protein APCDD1-like, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APCDD1LQ8NCL9 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
APCDD1LQ8NCL9 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
APCDD1LQ8NCL9 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
APCDD1LQ8NCL9 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
APCDD1LQ8NCL9 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
APCDD1LQ8NCL9 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
APCDD1LQ8NCL9 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
APCDD1LQ8NCL9 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
APCDD1LQ8NCL9 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
APCDD1LQ8NCL9 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
APCDD1LQ8NCL9 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
APCDD1LQ8NCL9 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
APCDD1LQ8NCL9 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
APCDD1LQ8NCL9 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
APCDD1LQ8NCL9 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
APCDD1LQ8NCL9 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
APCDD1LQ8NCL9 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
APCDD1LQ8NCL9 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
APCDD1LQ8NCL9 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
APCDD1LQ8NCL9 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
APCDD1LQ8NCL9 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
APCDD1LQ8NCL9 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
APCDD1LQ8NCL9 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
APCDD1LQ8NCL9 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
APCDD1LQ8NCL9 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
APCDD1LQ8NCL9 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
APCDD1LQ8NCL9 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
APCDD1LQ8NCL9 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
APCDD1LQ8NCL9 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
APCDD1LQ8NCL9 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
APCDD1LQ8NCL9 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
APCDD1LQ8NCL9 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
APCDD1LQ8NCL9 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
APCDD1LQ8NCL9 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
APCDD1LQ8NCL9 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
APCDD1LQ8NCL9 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
APCDD1LQ8NCL9 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
APCDD1LQ8NCL9 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
APCDD1LQ8NCL9 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
APCDD1LQ8NCL9 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
APCDD1LQ8NCL9 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
APCDD1LQ8NCL9 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
APCDD1LQ8NCL9 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
APCDD1LQ8NCL9 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
APCDD1LQ8NCL9 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
APCDD1LQ8NCL9 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
APCDD1LQ8NCL9 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
APCDD1LQ8NCL9 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
APCDD1LQ8NCL9 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
APCDD1LQ8NCL9 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
APCDD1LQ8NCL9 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
APCDD1LQ8NCL9 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
APCDD1LQ8NCL9 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
APCDD1LQ8NCL9 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
APCDD1LQ8NCL9 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
APCDD1LQ8NCL9 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
APCDD1LQ8NCL9 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
APCDD1LQ8NCL9 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
APCDD1LQ8NCL9 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
APCDD1LQ8NCL9 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
APCDD1LQ8NCL9 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
APCDD1LQ8NCL9 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
APCDD1LQ8NCL9 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
APCDD1LQ8NCL9 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
APCDD1LQ8NCL9 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
APCDD1LQ8NCL9 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
APCDD1LQ8NCL9 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
APCDD1LQ8NCL9 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
APCDD1LQ8NCL9 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
APCDD1LQ8NCL9 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
APCDD1LQ8NCL9 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
APCDD1LQ8NCL9 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
APCDD1LQ8NCL9 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
APCDD1LQ8NCL9 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
APCDD1LQ8NCL9 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
APCDD1LQ8NCL9 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
APCDD1LQ8NCL9 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
APCDD1LQ8NCL9 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
APCDD1LQ8NCL9 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
APCDD1LQ8NCL9 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
APCDD1LQ8NCL9 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
APCDD1LQ8NCL9 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
APCDD1LQ8NCL9 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
APCDD1LQ8NCL9 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
APCDD1LQ8NCL9 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
APCDD1LQ8NCL9 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
APCDD1LQ8NCL9 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
APCDD1LQ8NCL9 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
APCDD1LQ8NCL9 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
APCDD1LQ8NCL9 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
APCDD1LQ8NCL9 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
APCDD1LQ8NCL9 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
APCDD1LQ8NCL9 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
APCDD1LQ8NCL9 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
APCDD1LQ8NCL9 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
APCDD1LQ8NCL9 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
APCDD1LQ8NCL9 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
APCDD1LQ8NCL9 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
APCDD1LQ8NCL9 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
APCDD1LQ8NCL9 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms