Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7U9

LINC00469, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00469, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00469Q8N7U9 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
LINC00469Q8N7U9 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
LINC00469Q8N7U9 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LINC00469Q8N7U9 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LINC00469Q8N7U9 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LINC00469Q8N7U9 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LINC00469Q8N7U9 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LINC00469Q8N7U9 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LINC00469Q8N7U9 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LINC00469Q8N7U9 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LINC00469Q8N7U9 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LINC00469Q8N7U9 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LINC00469Q8N7U9 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LINC00469Q8N7U9 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LINC00469Q8N7U9 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LINC00469Q8N7U9 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LINC00469Q8N7U9 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LINC00469Q8N7U9 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LINC00469Q8N7U9 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LINC00469Q8N7U9 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LINC00469Q8N7U9 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LINC00469Q8N7U9 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LINC00469Q8N7U9 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LINC00469Q8N7U9 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LINC00469Q8N7U9 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LINC00469Q8N7U9 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LINC00469Q8N7U9 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LINC00469Q8N7U9 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LINC00469Q8N7U9 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LINC00469Q8N7U9 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LINC00469Q8N7U9 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LINC00469Q8N7U9 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LINC00469Q8N7U9 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LINC00469Q8N7U9 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LINC00469Q8N7U9 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LINC00469Q8N7U9 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LINC00469Q8N7U9 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LINC00469Q8N7U9 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LINC00469Q8N7U9 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LINC00469Q8N7U9 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LINC00469Q8N7U9 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LINC00469Q8N7U9 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LINC00469Q8N7U9 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LINC00469Q8N7U9 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LINC00469Q8N7U9 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LINC00469Q8N7U9 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LINC00469Q8N7U9 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LINC00469Q8N7U9 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LINC00469Q8N7U9 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LINC00469Q8N7U9 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LINC00469Q8N7U9 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LINC00469Q8N7U9 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LINC00469Q8N7U9 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LINC00469Q8N7U9 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LINC00469Q8N7U9 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LINC00469Q8N7U9 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LINC00469Q8N7U9 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LINC00469Q8N7U9 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LINC00469Q8N7U9 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
LINC00469Q8N7U9 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
LINC00469Q8N7U9 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LINC00469Q8N7U9 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LINC00469Q8N7U9 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LINC00469Q8N7U9 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LINC00469Q8N7U9 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LINC00469Q8N7U9 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LINC00469Q8N7U9 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LINC00469Q8N7U9 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LINC00469Q8N7U9 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LINC00469Q8N7U9 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LINC00469Q8N7U9 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LINC00469Q8N7U9 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LINC00469Q8N7U9 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LINC00469Q8N7U9 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LINC00469Q8N7U9 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LINC00469Q8N7U9 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LINC00469Q8N7U9 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LINC00469Q8N7U9 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LINC00469Q8N7U9 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LINC00469Q8N7U9 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LINC00469Q8N7U9 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LINC00469Q8N7U9 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LINC00469Q8N7U9 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LINC00469Q8N7U9 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LINC00469Q8N7U9 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LINC00469Q8N7U9 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LINC00469Q8N7U9 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LINC00469Q8N7U9 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LINC00469Q8N7U9 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LINC00469Q8N7U9 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LINC00469Q8N7U9 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LINC00469Q8N7U9 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LINC00469Q8N7U9 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
LINC00469Q8N7U9 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LINC00469Q8N7U9 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LINC00469Q8N7U9 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LINC00469Q8N7U9 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
LINC00469Q8N7U9 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LINC00469Q8N7U9 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LINC00469Q8N7U9 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms