Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5G0

SMIM20, Small integral membrane protein 20, humanhuman

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Length 67 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM20Q8N5G0 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMIM20Q8N5G0 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMIM20Q8N5G0 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SMIM20Q8N5G0 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SMIM20Q8N5G0 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SMIM20Q8N5G0 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SMIM20Q8N5G0 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SMIM20Q8N5G0 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SMIM20Q8N5G0 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMIM20Q8N5G0 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMIM20Q8N5G0 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMIM20Q8N5G0 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMIM20Q8N5G0 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMIM20Q8N5G0 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMIM20Q8N5G0 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMIM20Q8N5G0 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMIM20Q8N5G0 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMIM20Q8N5G0 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMIM20Q8N5G0 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMIM20Q8N5G0 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMIM20Q8N5G0 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMIM20Q8N5G0 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMIM20Q8N5G0 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SMIM20Q8N5G0 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SMIM20Q8N5G0 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SMIM20Q8N5G0 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMIM20Q8N5G0 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMIM20Q8N5G0 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMIM20Q8N5G0 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMIM20Q8N5G0 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMIM20Q8N5G0 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMIM20Q8N5G0 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMIM20Q8N5G0 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMIM20Q8N5G0 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMIM20Q8N5G0 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMIM20Q8N5G0 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMIM20Q8N5G0 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMIM20Q8N5G0 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMIM20Q8N5G0 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMIM20Q8N5G0 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMIM20Q8N5G0 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMIM20Q8N5G0 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMIM20Q8N5G0 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMIM20Q8N5G0 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMIM20Q8N5G0 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMIM20Q8N5G0 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
SMIM20Q8N5G0 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SMIM20Q8N5G0 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMIM20Q8N5G0 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMIM20Q8N5G0 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMIM20Q8N5G0 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMIM20Q8N5G0 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMIM20Q8N5G0 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SMIM20Q8N5G0 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMIM20Q8N5G0 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMIM20Q8N5G0 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMIM20Q8N5G0 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMIM20Q8N5G0 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMIM20Q8N5G0 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMIM20Q8N5G0 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMIM20Q8N5G0 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMIM20Q8N5G0 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMIM20Q8N5G0 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMIM20Q8N5G0 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMIM20Q8N5G0 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMIM20Q8N5G0 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMIM20Q8N5G0 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMIM20Q8N5G0 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMIM20Q8N5G0 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMIM20Q8N5G0 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMIM20Q8N5G0 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMIM20Q8N5G0 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
SMIM20Q8N5G0 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMIM20Q8N5G0 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMIM20Q8N5G0 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMIM20Q8N5G0 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMIM20Q8N5G0 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMIM20Q8N5G0 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMIM20Q8N5G0 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMIM20Q8N5G0 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMIM20Q8N5G0 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMIM20Q8N5G0 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMIM20Q8N5G0 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMIM20Q8N5G0 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMIM20Q8N5G0 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMIM20Q8N5G0 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMIM20Q8N5G0 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMIM20Q8N5G0 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMIM20Q8N5G0 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMIM20Q8N5G0 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMIM20Q8N5G0 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SMIM20Q8N5G0 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMIM20Q8N5G0 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMIM20Q8N5G0 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMIM20Q8N5G0 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMIM20Q8N5G0 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMIM20Q8N5G0 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMIM20Q8N5G0 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMIM20Q8N5G0 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMIM20Q8N5G0 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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