Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCB7

SLC27A1, Long-chain fatty acid transport protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A1Q6PCB7 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SLC27A1Q6PCB7 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SLC27A1Q6PCB7 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SLC27A1Q6PCB7 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SLC27A1Q6PCB7 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SLC27A1Q6PCB7 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SLC27A1Q6PCB7 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SLC27A1Q6PCB7 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SLC27A1Q6PCB7 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SLC27A1Q6PCB7 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SLC27A1Q6PCB7 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SLC27A1Q6PCB7 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SLC27A1Q6PCB7 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SLC27A1Q6PCB7 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SLC27A1Q6PCB7 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SLC27A1Q6PCB7 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SLC27A1Q6PCB7 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SLC27A1Q6PCB7 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SLC27A1Q6PCB7 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SLC27A1Q6PCB7 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SLC27A1Q6PCB7 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SLC27A1Q6PCB7 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
SLC27A1Q6PCB7 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SLC27A1Q6PCB7 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SLC27A1Q6PCB7 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
SLC27A1Q6PCB7 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SLC27A1Q6PCB7 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SLC27A1Q6PCB7 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SLC27A1Q6PCB7 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SLC27A1Q6PCB7 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SLC27A1Q6PCB7 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SLC27A1Q6PCB7 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
SLC27A1Q6PCB7 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SLC27A1Q6PCB7 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SLC27A1Q6PCB7 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
SLC27A1Q6PCB7 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SLC27A1Q6PCB7 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SLC27A1Q6PCB7 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SLC27A1Q6PCB7 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SLC27A1Q6PCB7 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SLC27A1Q6PCB7 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SLC27A1Q6PCB7 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SLC27A1Q6PCB7 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SLC27A1Q6PCB7 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SLC27A1Q6PCB7 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SLC27A1Q6PCB7 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
SLC27A1Q6PCB7 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SLC27A1Q6PCB7 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SLC27A1Q6PCB7 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SLC27A1Q6PCB7 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SLC27A1Q6PCB7 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
SLC27A1Q6PCB7 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SLC27A1Q6PCB7 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
SLC27A1Q6PCB7 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SLC27A1Q6PCB7 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SLC27A1Q6PCB7 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SLC27A1Q6PCB7 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SLC27A1Q6PCB7 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
SLC27A1Q6PCB7 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SLC27A1Q6PCB7 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SLC27A1Q6PCB7 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SLC27A1Q6PCB7 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SLC27A1Q6PCB7 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SLC27A1Q6PCB7 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SLC27A1Q6PCB7 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SLC27A1Q6PCB7 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SLC27A1Q6PCB7 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SLC27A1Q6PCB7 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SLC27A1Q6PCB7 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SLC27A1Q6PCB7 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SLC27A1Q6PCB7 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SLC27A1Q6PCB7 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
SLC27A1Q6PCB7 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SLC27A1Q6PCB7 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SLC27A1Q6PCB7 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SLC27A1Q6PCB7 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SLC27A1Q6PCB7 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SLC27A1Q6PCB7 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
SLC27A1Q6PCB7 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SLC27A1Q6PCB7 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
SLC27A1Q6PCB7 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SLC27A1Q6PCB7 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SLC27A1Q6PCB7 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SLC27A1Q6PCB7 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SLC27A1Q6PCB7 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SLC27A1Q6PCB7 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
SLC27A1Q6PCB7 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SLC27A1Q6PCB7 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SLC27A1Q6PCB7 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SLC27A1Q6PCB7 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SLC27A1Q6PCB7 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SLC27A1Q6PCB7 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SLC27A1Q6PCB7 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SLC27A1Q6PCB7 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SLC27A1Q6PCB7 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SLC27A1Q6PCB7 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SLC27A1Q6PCB7 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SLC27A1Q6PCB7 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SLC27A1Q6PCB7 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SLC27A1Q6PCB7 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.2 ms