Protein–RNA interactions for Protein: Q5VW22

AGAP6, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP6Q5VW22 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
AGAP6Q5VW22 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
AGAP6Q5VW22 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
AGAP6Q5VW22 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
AGAP6Q5VW22 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
AGAP6Q5VW22 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
AGAP6Q5VW22 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
AGAP6Q5VW22 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
AGAP6Q5VW22 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
AGAP6Q5VW22 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
AGAP6Q5VW22 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
AGAP6Q5VW22 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
AGAP6Q5VW22 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
AGAP6Q5VW22 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
AGAP6Q5VW22 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
AGAP6Q5VW22 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
AGAP6Q5VW22 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
AGAP6Q5VW22 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
AGAP6Q5VW22 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
AGAP6Q5VW22 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
AGAP6Q5VW22 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
AGAP6Q5VW22 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
AGAP6Q5VW22 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
AGAP6Q5VW22 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
AGAP6Q5VW22 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
AGAP6Q5VW22 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
AGAP6Q5VW22 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
AGAP6Q5VW22 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
AGAP6Q5VW22 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
AGAP6Q5VW22 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
AGAP6Q5VW22 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
AGAP6Q5VW22 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
AGAP6Q5VW22 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
AGAP6Q5VW22 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
AGAP6Q5VW22 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
AGAP6Q5VW22 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
AGAP6Q5VW22 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
AGAP6Q5VW22 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
AGAP6Q5VW22 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
AGAP6Q5VW22 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
AGAP6Q5VW22 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
AGAP6Q5VW22 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
AGAP6Q5VW22 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
AGAP6Q5VW22 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
AGAP6Q5VW22 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
AGAP6Q5VW22 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
AGAP6Q5VW22 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
AGAP6Q5VW22 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
AGAP6Q5VW22 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
AGAP6Q5VW22 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
AGAP6Q5VW22 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
AGAP6Q5VW22 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
AGAP6Q5VW22 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
AGAP6Q5VW22 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
AGAP6Q5VW22 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
AGAP6Q5VW22 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
AGAP6Q5VW22 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
AGAP6Q5VW22 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
AGAP6Q5VW22 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
AGAP6Q5VW22 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
AGAP6Q5VW22 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
AGAP6Q5VW22 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
AGAP6Q5VW22 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
AGAP6Q5VW22 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
AGAP6Q5VW22 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
AGAP6Q5VW22 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
AGAP6Q5VW22 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
AGAP6Q5VW22 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
AGAP6Q5VW22 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
AGAP6Q5VW22 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
AGAP6Q5VW22 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
AGAP6Q5VW22 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
AGAP6Q5VW22 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
AGAP6Q5VW22 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
AGAP6Q5VW22 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
AGAP6Q5VW22 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
AGAP6Q5VW22 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
AGAP6Q5VW22 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
AGAP6Q5VW22 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
AGAP6Q5VW22 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
AGAP6Q5VW22 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
AGAP6Q5VW22 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
AGAP6Q5VW22 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
AGAP6Q5VW22 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
AGAP6Q5VW22 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
AGAP6Q5VW22 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
AGAP6Q5VW22 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
AGAP6Q5VW22 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
AGAP6Q5VW22 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
AGAP6Q5VW22 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
AGAP6Q5VW22 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
AGAP6Q5VW22 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
AGAP6Q5VW22 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
AGAP6Q5VW22 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
AGAP6Q5VW22 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
AGAP6Q5VW22 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
AGAP6Q5VW22 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
AGAP6Q5VW22 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
AGAP6Q5VW22 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
AGAP6Q5VW22 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms