Protein–RNA interactions for Protein: Q5UIP0

RIF1, Telomere-associated protein RIF1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIF1Q5UIP0 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RIF1Q5UIP0 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
RIF1Q5UIP0 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RIF1Q5UIP0 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RIF1Q5UIP0 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RIF1Q5UIP0 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RIF1Q5UIP0 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RIF1Q5UIP0 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
RIF1Q5UIP0 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.91
RIF1Q5UIP0 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
RIF1Q5UIP0 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
RIF1Q5UIP0 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RIF1Q5UIP0 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RIF1Q5UIP0 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RIF1Q5UIP0 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RIF1Q5UIP0 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RIF1Q5UIP0 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RIF1Q5UIP0 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RIF1Q5UIP0 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RIF1Q5UIP0 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RIF1Q5UIP0 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RIF1Q5UIP0 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RIF1Q5UIP0 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
RIF1Q5UIP0 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
RIF1Q5UIP0 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
RIF1Q5UIP0 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
RIF1Q5UIP0 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
RIF1Q5UIP0 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
RIF1Q5UIP0 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
RIF1Q5UIP0 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
RIF1Q5UIP0 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
RIF1Q5UIP0 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
RIF1Q5UIP0 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
RIF1Q5UIP0 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RIF1Q5UIP0 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RIF1Q5UIP0 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RIF1Q5UIP0 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RIF1Q5UIP0 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RIF1Q5UIP0 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RIF1Q5UIP0 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RIF1Q5UIP0 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RIF1Q5UIP0 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RIF1Q5UIP0 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RIF1Q5UIP0 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RIF1Q5UIP0 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.83■■□□□ 1.88
RIF1Q5UIP0 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
RIF1Q5UIP0 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
RIF1Q5UIP0 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
RIF1Q5UIP0 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RIF1Q5UIP0 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RIF1Q5UIP0 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RIF1Q5UIP0 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RIF1Q5UIP0 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RIF1Q5UIP0 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RIF1Q5UIP0 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RIF1Q5UIP0 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RIF1Q5UIP0 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RIF1Q5UIP0 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RIF1Q5UIP0 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RIF1Q5UIP0 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RIF1Q5UIP0 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RIF1Q5UIP0 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RIF1Q5UIP0 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
RIF1Q5UIP0 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RIF1Q5UIP0 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RIF1Q5UIP0 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RIF1Q5UIP0 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
RIF1Q5UIP0 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RIF1Q5UIP0 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RIF1Q5UIP0 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RIF1Q5UIP0 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RIF1Q5UIP0 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RIF1Q5UIP0 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RIF1Q5UIP0 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
RIF1Q5UIP0 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RIF1Q5UIP0 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RIF1Q5UIP0 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RIF1Q5UIP0 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RIF1Q5UIP0 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RIF1Q5UIP0 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RIF1Q5UIP0 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RIF1Q5UIP0 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RIF1Q5UIP0 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RIF1Q5UIP0 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RIF1Q5UIP0 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RIF1Q5UIP0 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
RIF1Q5UIP0 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
RIF1Q5UIP0 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RIF1Q5UIP0 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RIF1Q5UIP0 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RIF1Q5UIP0 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RIF1Q5UIP0 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RIF1Q5UIP0 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RIF1Q5UIP0 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RIF1Q5UIP0 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RIF1Q5UIP0 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RIF1Q5UIP0 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RIF1Q5UIP0 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RIF1Q5UIP0 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RIF1Q5UIP0 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms