Protein–RNA interactions for Protein: Q5SXM2

SNAPC4, snRNA-activating protein complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC4Q5SXM2 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC45.2■■■■■ 4.83
SNAPC4Q5SXM2 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.2■■■■■ 4.83
SNAPC4Q5SXM2 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.18■■■■■ 4.82
SNAPC4Q5SXM2 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC45.18■■■■■ 4.82
SNAPC4Q5SXM2 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC45.16■■■■■ 4.82
SNAPC4Q5SXM2 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.15■■■■■ 4.82
SNAPC4Q5SXM2 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.15■■■■■ 4.82
SNAPC4Q5SXM2 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.14■■■■■ 4.82
SNAPC4Q5SXM2 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC45.11■■■■■ 4.81
SNAPC4Q5SXM2 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC45.11■■■■■ 4.81
SNAPC4Q5SXM2 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC45.1■■■■■ 4.81
SNAPC4Q5SXM2 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC45.1■■■■■ 4.81
SNAPC4Q5SXM2 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.09■■■■■ 4.81
SNAPC4Q5SXM2 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.09■■■■■ 4.81
SNAPC4Q5SXM2 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC45.09■■■■■ 4.81
SNAPC4Q5SXM2 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC45.09■■■■■ 4.81
SNAPC4Q5SXM2 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC45.08■■■■■ 4.81
SNAPC4Q5SXM2 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.08■■■■■ 4.81
SNAPC4Q5SXM2 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC45.08■■■■■ 4.81
SNAPC4Q5SXM2 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.08■■■■■ 4.81
SNAPC4Q5SXM2 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.06■■■■■ 4.8
SNAPC4Q5SXM2 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.06■■■■■ 4.8
SNAPC4Q5SXM2 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.05■■■■■ 4.8
SNAPC4Q5SXM2 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC45.04■■■■■ 4.8
SNAPC4Q5SXM2 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC45.03■■■■■ 4.8
SNAPC4Q5SXM2 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.02■■■■■ 4.8
SNAPC4Q5SXM2 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC45.01■■■■■ 4.8
SNAPC4Q5SXM2 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45■■■■■ 4.79
SNAPC4Q5SXM2 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC44.99■■■■■ 4.79
SNAPC4Q5SXM2 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.99■■■■■ 4.79
SNAPC4Q5SXM2 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC44.98■■■■■ 4.79
SNAPC4Q5SXM2 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.97■■■■■ 4.79
SNAPC4Q5SXM2 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC44.96■■■■■ 4.79
SNAPC4Q5SXM2 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC44.94■■■■■ 4.79
SNAPC4Q5SXM2 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.94■■■■■ 4.78
SNAPC4Q5SXM2 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC44.92■■■■■ 4.78
SNAPC4Q5SXM2 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC44.91■■■■■ 4.78
SNAPC4Q5SXM2 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC44.9■■■■■ 4.78
SNAPC4Q5SXM2 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC44.9■■■■■ 4.78
SNAPC4Q5SXM2 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC44.9■■■■■ 4.78
SNAPC4Q5SXM2 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC44.87■■■■■ 4.77
SNAPC4Q5SXM2 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC44.86■■■■■ 4.77
SNAPC4Q5SXM2 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.85■■■■■ 4.77
SNAPC4Q5SXM2 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.82■■■■■ 4.77
SNAPC4Q5SXM2 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC44.82■■■■■ 4.77
SNAPC4Q5SXM2 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.81■■■■■ 4.76
SNAPC4Q5SXM2 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC44.81■■■■■ 4.76
SNAPC4Q5SXM2 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC44.81■■■■■ 4.76
SNAPC4Q5SXM2 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.8■■■■■ 4.76
SNAPC4Q5SXM2 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC44.8■■■■■ 4.76
SNAPC4Q5SXM2 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.79■■■■■ 4.76
SNAPC4Q5SXM2 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.78■■■■■ 4.76
SNAPC4Q5SXM2 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC44.78■■■■■ 4.76
SNAPC4Q5SXM2 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.78■■■■■ 4.76
SNAPC4Q5SXM2 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC44.78■■■■■ 4.76
SNAPC4Q5SXM2 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.78■■■■■ 4.76
SNAPC4Q5SXM2 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC44.77■■■■■ 4.76
SNAPC4Q5SXM2 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.77■■■■■ 4.76
SNAPC4Q5SXM2 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.77■■■■■ 4.76
SNAPC4Q5SXM2 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC44.77■■■■■ 4.76
SNAPC4Q5SXM2 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.76■■■■■ 4.76
SNAPC4Q5SXM2 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC44.76■■■■■ 4.76
SNAPC4Q5SXM2 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.75■■■■■ 4.75
SNAPC4Q5SXM2 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC44.74■■■■■ 4.75
SNAPC4Q5SXM2 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC44.74■■■■■ 4.75
SNAPC4Q5SXM2 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC44.74■■■■■ 4.75
SNAPC4Q5SXM2 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC44.73■■■■■ 4.75
SNAPC4Q5SXM2 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC44.73■■■■■ 4.75
SNAPC4Q5SXM2 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.73■■■■■ 4.75
SNAPC4Q5SXM2 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC44.71■■■■■ 4.75
SNAPC4Q5SXM2 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC44.71■■■■■ 4.75
SNAPC4Q5SXM2 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC44.71■■■■■ 4.75
SNAPC4Q5SXM2 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC44.71■■■■■ 4.75
SNAPC4Q5SXM2 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC44.71■■■■■ 4.75
SNAPC4Q5SXM2 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC44.71■■■■■ 4.75
SNAPC4Q5SXM2 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC44.71■■■■■ 4.75
SNAPC4Q5SXM2 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC44.71■■■■■ 4.75
SNAPC4Q5SXM2 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC44.71■■■■■ 4.75
SNAPC4Q5SXM2 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC44.67■■■■■ 4.74
SNAPC4Q5SXM2 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC44.67■■■■■ 4.74
SNAPC4Q5SXM2 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC44.61■■■■■ 4.73
SNAPC4Q5SXM2 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC44.61■■■■■ 4.73
SNAPC4Q5SXM2 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC44.6■■■■■ 4.73
SNAPC4Q5SXM2 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC44.59■■■■■ 4.73
SNAPC4Q5SXM2 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC44.58■■■■■ 4.73
SNAPC4Q5SXM2 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC44.57■■■■■ 4.73
SNAPC4Q5SXM2 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC44.57■■■■■ 4.73
SNAPC4Q5SXM2 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC44.57■■■■■ 4.73
SNAPC4Q5SXM2 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC44.56■■■■■ 4.72
SNAPC4Q5SXM2 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.56■■■■■ 4.72
SNAPC4Q5SXM2 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.54■■■■■ 4.72
SNAPC4Q5SXM2 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC44.53■■■■■ 4.72
SNAPC4Q5SXM2 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC44.53■■■■■ 4.72
SNAPC4Q5SXM2 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC44.53■■■■■ 4.72
SNAPC4Q5SXM2 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.52■■■■■ 4.72
SNAPC4Q5SXM2 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC44.52■■■■■ 4.72
SNAPC4Q5SXM2 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC44.52■■■■■ 4.72
SNAPC4Q5SXM2 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC44.52■■■■■ 4.72
SNAPC4Q5SXM2 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC44.52■■■■■ 4.72
SNAPC4Q5SXM2 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC44.52■■■■■ 4.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms