Protein–RNA interactions for Protein: Q4KN68

LINC01620, Uncharacterized protein encoded by LINC01620, humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01620Q4KN68 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LINC01620Q4KN68 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LINC01620Q4KN68 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LINC01620Q4KN68 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
LINC01620Q4KN68 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LINC01620Q4KN68 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LINC01620Q4KN68 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LINC01620Q4KN68 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LINC01620Q4KN68 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LINC01620Q4KN68 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LINC01620Q4KN68 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LINC01620Q4KN68 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LINC01620Q4KN68 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LINC01620Q4KN68 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LINC01620Q4KN68 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LINC01620Q4KN68 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LINC01620Q4KN68 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LINC01620Q4KN68 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LINC01620Q4KN68 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LINC01620Q4KN68 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LINC01620Q4KN68 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LINC01620Q4KN68 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LINC01620Q4KN68 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LINC01620Q4KN68 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LINC01620Q4KN68 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC01620Q4KN68 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LINC01620Q4KN68 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LINC01620Q4KN68 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LINC01620Q4KN68 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LINC01620Q4KN68 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
LINC01620Q4KN68 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC01620Q4KN68 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC01620Q4KN68 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC01620Q4KN68 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC01620Q4KN68 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC01620Q4KN68 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC01620Q4KN68 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC01620Q4KN68 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC01620Q4KN68 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC01620Q4KN68 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC01620Q4KN68 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC01620Q4KN68 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC01620Q4KN68 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC01620Q4KN68 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC01620Q4KN68 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC01620Q4KN68 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LINC01620Q4KN68 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LINC01620Q4KN68 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LINC01620Q4KN68 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC01620Q4KN68 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC01620Q4KN68 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC01620Q4KN68 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC01620Q4KN68 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LINC01620Q4KN68 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LINC01620Q4KN68 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LINC01620Q4KN68 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC01620Q4KN68 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC01620Q4KN68 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC01620Q4KN68 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC01620Q4KN68 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC01620Q4KN68 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC01620Q4KN68 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC01620Q4KN68 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LINC01620Q4KN68 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LINC01620Q4KN68 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LINC01620Q4KN68 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LINC01620Q4KN68 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LINC01620Q4KN68 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
LINC01620Q4KN68 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC01620Q4KN68 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC01620Q4KN68 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC01620Q4KN68 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LINC01620Q4KN68 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LINC01620Q4KN68 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LINC01620Q4KN68 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LINC01620Q4KN68 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LINC01620Q4KN68 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LINC01620Q4KN68 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LINC01620Q4KN68 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LINC01620Q4KN68 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
LINC01620Q4KN68 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
LINC01620Q4KN68 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LINC01620Q4KN68 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LINC01620Q4KN68 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LINC01620Q4KN68 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LINC01620Q4KN68 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LINC01620Q4KN68 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LINC01620Q4KN68 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LINC01620Q4KN68 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LINC01620Q4KN68 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LINC01620Q4KN68 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LINC01620Q4KN68 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LINC01620Q4KN68 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LINC01620Q4KN68 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LINC01620Q4KN68 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LINC01620Q4KN68 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LINC01620Q4KN68 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LINC01620Q4KN68 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LINC01620Q4KN68 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LINC01620Q4KN68 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.3 ms