Protein–RNA interactions for Protein: Q3YBR2

TBRG1, Transforming growth factor beta regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBRG1Q3YBR2 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TBRG1Q3YBR2 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TBRG1Q3YBR2 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TBRG1Q3YBR2 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TBRG1Q3YBR2 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TBRG1Q3YBR2 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
TBRG1Q3YBR2 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
TBRG1Q3YBR2 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
TBRG1Q3YBR2 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TBRG1Q3YBR2 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TBRG1Q3YBR2 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TBRG1Q3YBR2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TBRG1Q3YBR2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TBRG1Q3YBR2 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TBRG1Q3YBR2 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TBRG1Q3YBR2 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TBRG1Q3YBR2 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TBRG1Q3YBR2 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TBRG1Q3YBR2 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TBRG1Q3YBR2 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TBRG1Q3YBR2 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TBRG1Q3YBR2 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TBRG1Q3YBR2 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
TBRG1Q3YBR2 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TBRG1Q3YBR2 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TBRG1Q3YBR2 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TBRG1Q3YBR2 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TBRG1Q3YBR2 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
TBRG1Q3YBR2 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TBRG1Q3YBR2 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TBRG1Q3YBR2 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TBRG1Q3YBR2 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TBRG1Q3YBR2 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TBRG1Q3YBR2 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TBRG1Q3YBR2 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TBRG1Q3YBR2 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TBRG1Q3YBR2 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TBRG1Q3YBR2 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TBRG1Q3YBR2 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TBRG1Q3YBR2 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TBRG1Q3YBR2 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TBRG1Q3YBR2 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TBRG1Q3YBR2 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TBRG1Q3YBR2 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TBRG1Q3YBR2 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TBRG1Q3YBR2 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TBRG1Q3YBR2 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
TBRG1Q3YBR2 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TBRG1Q3YBR2 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TBRG1Q3YBR2 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TBRG1Q3YBR2 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TBRG1Q3YBR2 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TBRG1Q3YBR2 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TBRG1Q3YBR2 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TBRG1Q3YBR2 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TBRG1Q3YBR2 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TBRG1Q3YBR2 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TBRG1Q3YBR2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TBRG1Q3YBR2 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TBRG1Q3YBR2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TBRG1Q3YBR2 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TBRG1Q3YBR2 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TBRG1Q3YBR2 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TBRG1Q3YBR2 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TBRG1Q3YBR2 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TBRG1Q3YBR2 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TBRG1Q3YBR2 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TBRG1Q3YBR2 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TBRG1Q3YBR2 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TBRG1Q3YBR2 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TBRG1Q3YBR2 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TBRG1Q3YBR2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TBRG1Q3YBR2 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TBRG1Q3YBR2 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TBRG1Q3YBR2 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TBRG1Q3YBR2 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TBRG1Q3YBR2 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TBRG1Q3YBR2 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TBRG1Q3YBR2 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TBRG1Q3YBR2 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TBRG1Q3YBR2 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TBRG1Q3YBR2 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TBRG1Q3YBR2 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TBRG1Q3YBR2 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TBRG1Q3YBR2 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TBRG1Q3YBR2 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TBRG1Q3YBR2 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TBRG1Q3YBR2 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TBRG1Q3YBR2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TBRG1Q3YBR2 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TBRG1Q3YBR2 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TBRG1Q3YBR2 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TBRG1Q3YBR2 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TBRG1Q3YBR2 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TBRG1Q3YBR2 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TBRG1Q3YBR2 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TBRG1Q3YBR2 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TBRG1Q3YBR2 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TBRG1Q3YBR2 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TBRG1Q3YBR2 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms